RNA id: TCONS_00009129


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00009129
length 121
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_004597
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007123.7
NCBI id CM002896.2
chromosome length 49182954
location 15381694 ~ 15381814 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TGCACTGGCAGCAGCTACCTCTTTTCAACTCTCACATGGtaacccactgaagctaagcagggctgcgcctggtcagtatctAGATGGAAgaacacatgggaaagctaggttgctgctgaaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000120737

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00009124 lncRNA upstream 203212 15148740 ~ 15178482 (+) False XLOC_004594
TCONS_00010730 lncRNA upstream 266263 15113429 ~ 15115431 (+) False XLOC_004593
TCONS_00010729 lncRNA upstream 266263 15113429 ~ 15115431 (+) True XLOC_004593
TCONS_00010900 lncRNA upstream 266282 15112124 ~ 15115412 (+) False XLOC_004593
TCONS_00010728 lncRNA upstream 267418 15111405 ~ 15114276 (+) False XLOC_004593
TCONS_00010731 lncRNA downstream 522310 15904124 ~ 15925797 (+) True XLOC_004602
TCONS_00010901 lncRNA downstream 566222 15948036 ~ 15948551 (+) True XLOC_004603
TCONS_00010902 lncRNA downstream 834834 16216648 ~ 16229550 (+) False XLOC_004606
TCONS_00010903 lncRNA downstream 835270 16217084 ~ 16229550 (+) False XLOC_004606
TCONS_00010904 lncRNA downstream 836244 16218058 ~ 16229550 (+) True XLOC_004606
TCONS_00009127 mRNA upstream 69695 15290800 ~ 15311999 (+) True XLOC_004595
TCONS_00009126 mRNA upstream 69849 15273304 ~ 15311845 (+) False XLOC_004595
TCONS_00009123 mRNA upstream 185471 15148618 ~ 15196223 (+) False XLOC_004594
TCONS_00009125 mRNA upstream 185826 15165736 ~ 15195868 (+) True XLOC_004594
TCONS_00009122 mRNA upstream 299327 15078124 ~ 15082367 (+) True XLOC_004592
TCONS_00009130 mRNA downstream 95297 15477111 ~ 15555772 (+) False XLOC_004598
TCONS_00009131 mRNA downstream 95297 15477111 ~ 15561869 (+) False XLOC_004598
TCONS_00009132 mRNA downstream 106020 15487834 ~ 15555772 (+) True XLOC_004598
TCONS_00009133 mRNA downstream 240807 15622621 ~ 15663412 (+) True XLOC_004599
TCONS_00009134 mRNA downstream 285135 15666949 ~ 15676285 (+) True XLOC_004600
TCONS_00009115 other upstream 1277888 14102104 ~ 14103806 (+) True XLOC_004585
TCONS_00009106 other upstream 1723550 13658022 ~ 13658144 (+) True XLOC_004581
TCONS_00009101 other upstream 1924338 13457237 ~ 13457356 (+) True XLOC_004579
TCONS_00009094 other upstream 2088927 13283774 ~ 13292767 (+) True XLOC_004575
TCONS_00009079 other upstream 2768243 12613335 ~ 12613451 (+) True XLOC_004569
TCONS_00009153 other downstream 1578879 16960693 ~ 16960781 (+) True XLOC_004618
TCONS_00009163 other downstream 1963736 17345550 ~ 17345667 (+) True XLOC_004624
TCONS_00009172 other downstream 2345728 17727542 ~ 17727651 (+) True XLOC_004630
TCONS_00009175 other downstream 2546057 17927871 ~ 17941043 (+) False XLOC_004633
TCONS_00009179 other downstream 2743844 18125658 ~ 18125774 (+) True XLOC_004634