XLOC_017868 (CABZ01032982.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_017868
gene name CABZ01032982.1
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007131.7
NCBI id CM002904.2
chromosome length 55201332
location 4405937 ~ 4407228 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00035273
GTGTACACTAACACCTGTGAGCTGCACAGTAACATCAGCACAgggtgagggtgtgtgtgtgtgtgctgtgtgtgtataagtgtgtgagaTTGTACGTGTTTTTGTCTTTCTGTACATTTCTGTGTCTGtcagtgtgttttgtgtgtatgtgtgagtatgtttgagtatttgtgtgtatgtgtatgcttTCGTATGTGAATGCGCtgtgtagtgtatgaatgagtgtgtgtgcgtgtgcgtgcttgtctgtctgtgtgtgtatatatgtgtgtatgtgtgtgtgcttttgtgttagtttgtatgtgtatgcgtgtacgcgtttgtgtgtgtgtgtgtttatgtttttgcGTGTTTGTTTCTGTctagtttgtttatgtttgtttgtttgtttgtgtgtgctcatttgtgtttgtctgtgtgtttgtgtgtgtacctgtgtgtgtttttttgtgtgtgtatgtttgtgtgtgtatgtgtgtgcatatgtgtttgtgtgtgtgggtgtctgtctgtttgtttacgTGTGTACTTGTGCGCAAGCTTTTatatgtttgtgcgtgtgtgcgcatgtgtttgtatttgtgtttgtgtgtgtacttgtgtgtgtgttgttatgtgcatgtgtgtgtgttggagtctgtgtttgtgcgtgtttgtgtctgtgtgtgtacttgtgtgtgtatgtgtgtttgttcacctgtatgtgtgtgtgcatgcgtgtttgtgcctgtgtgtgcatctgtgtgcgtgtgtatgtgtttttatgtgtgtggttgtgtaagtttgagtctgtgtgtgtttattgtgtgtgtgtgtgcttgtgtgtatgtttgttcatttgtgtgtgcgcatgtgtgtttctgtttgtctatgtgtatgtggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtctctgtgtatgtccatgtatgtgtgtgtgtgcctatgtatgtgcgtgtatgtgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgacaggtaGTACAGTCACAGAAGTGTTGCAGTGGTATCTGTGTTTCCGGTCTACTTCTCTGCATGCTGGACGGATGTTGGAGAGGTGCACATGCACCATACAGGTATATCTCAGCAGACAAACTAGCGCTTACGAAAGCCGCAAAAACAGCCTCAAAATACGCTCTCAGCCTCGGGTCGCATCGCATGCCGCTGCATCACAGGTGCATGTTGGGAACAGCGGTTAAGGAGCCTCAAAAACAGTCGTCTCATATGTAAAAATCGACTACAGTACGCCTTCAGCATTCTGCAGCCTCTCGAAATTCCCT

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000099075

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00035273 True 1292 mRNA 0.44 1 4405937 4407228

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_017867 NA coding downstream 19630 4381929 ~ 4386307 (-)
XLOC_017866 zgc:194224 coding downstream 248799 4149523 ~ 4157138 (-)
XLOC_017865 NA coding downstream 259805 4135534 ~ 4146132 (-)
XLOC_017864 CABZ01042336.1 coding downstream 279683 4126140 ~ 4126254 (-)
XLOC_017863 sprtn coding downstream 356075 4033193 ~ 4049862 (-)
XLOC_017869 NA coding upstream 87913 4495141 ~ 4496142 (-)
XLOC_017870 papola coding upstream 305548 4712776 ~ 4738133 (-)
XLOC_017871 ak7a coding upstream 335172 4742400 ~ 4766649 (-)
XLOC_017872 galca coding upstream 362534 4769762 ~ 4793450 (-)
XLOC_017873 zdhhc14 coding upstream 420507 4827735 ~ 4883673 (-)
XLOC_017928 CU539064.1 misc upstream 5646177 10053405 ~ 10053701 (-)
XLOC_017860 NA non-coding downstream 452306 3942667 ~ 3953631 (-)
XLOC_017859 NA non-coding downstream 490167 3913424 ~ 3915770 (-)
XLOC_017875 BX649499.1 non-coding upstream 498850 4906078 ~ 4907477 (-)
XLOC_017876 NA non-coding upstream 661584 5068812 ~ 5070190 (-)
XLOC_017882 CABZ01045949.1 non-coding upstream 913987 5321215 ~ 5321329 (-)
XLOC_017885 BX088548.1 non-coding upstream 1206651 5613879 ~ 5613996 (-)

Expression


Co-expression Network