XLOC_017865


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_017865
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007131.7
NCBI id CM002904.2
chromosome length 55201332
location 4135534 ~ 4146132 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

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GO:0070160 tight junction cellular_component

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00036790 False 8285 lncRNA 0.40 2 4135534 4144010
TCONS_00036791 True 10407 lncRNA 0.40 2 4135534 4146132

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_017864 CABZ01042336.1 coding downstream 9280 4126140 ~ 4126254 (-)
XLOC_017863 sprtn coding downstream 85672 4033193 ~ 4049862 (-)
XLOC_017862 fam89a coding downstream 104059 4026408 ~ 4031475 (-)
XLOC_017861 ttc13 coding downstream 138003 3954579 ~ 3997531 (-)
XLOC_017860 NA coding downstream 181903 3942667 ~ 3953631 (-)
XLOC_017866 zgc:194224 coding upstream 3391 4149523 ~ 4157138 (-)
XLOC_017867 NA coding upstream 235797 4381929 ~ 4386307 (-)
XLOC_017868 CABZ01032982.1 coding upstream 259805 4405937 ~ 4407228 (-)
XLOC_017869 NA coding upstream 349009 4495141 ~ 4496142 (-)
XLOC_017870 papola coding upstream 566644 4712776 ~ 4738133 (-)
XLOC_017928 CU539064.1 misc upstream 5907273 10053405 ~ 10053701 (-)
XLOC_017859 NA non-coding downstream 219764 3913424 ~ 3915770 (-)
XLOC_017857 NA non-coding downstream 408608 3721325 ~ 3726926 (-)
XLOC_017856 NA non-coding downstream 710880 3421578 ~ 3424654 (-)
XLOC_017875 BX649499.1 non-coding upstream 759946 4906078 ~ 4907477 (-)
XLOC_017876 NA non-coding upstream 922680 5068812 ~ 5070190 (-)
XLOC_017882 CABZ01045949.1 non-coding upstream 1175083 5321215 ~ 5321329 (-)

Expression


Co-expression Network