XLOC_002254 (kl)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_002254
gene name kl
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007121.7
NCBI id CM002894.2
chromosome length 45420867
location 34001444 ~ 34026125 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00004310
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Function

symbol description
kl Predicted to enable beta-glucosidase activity; fibroblast growth factor binding activity; and fibroblast growth factor receptor binding activity. Predicted to be involved in fibroblast growth factor receptor signaling pathway. Predicted to act upstream of or within aging; carbohydrate metabolic process; and insulin receptor signaling pathway. Predicted to be located in extracellular space and membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be active in endoplasmic reticulum. Is expressed in several structures, including digestive system; gill; heart; pleuroperitoneal region; and yolk syncytial layer. Human ortholog(s) of this gene implicated in coronary artery disease; intracranial embolism; and spondylosis. Orthologous to human KL (klotho).

GO:

id name namespace
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GO:0008543 fibroblast growth factor receptor signaling pathway biological_process
GO:0008286 insulin receptor signaling pathway biological_process
GO:0005975 carbohydrate metabolic process biological_process
GO:0005783 endoplasmic reticulum cellular_component
GO:0005615 extracellular space cellular_component
GO:0016020 membrane cellular_component
GO:0016021 integral component of membrane cellular_component
GO:0008422 beta-glucosidase activity molecular_function
GO:0005104 fibroblast growth factor receptor binding molecular_function
GO:0004553 hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds molecular_function
GO:0017134 fibroblast growth factor binding molecular_function

KEGG:

id description
ko00040 Pentose and glucuronate interconversions
ko00053 Ascorbate and aldarate metabolism
ko04928 Parathyroid hormone synthesis, secretion and action
ko04961 Endocrine and other factor-regulated calcium reabsorption
ko04211 Longevity regulating pathway
ko02000 Transporters
ko04147 Exosome

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-110221-1 Predicted to enable beta-glucosidase activity; fibroblast growth factor binding activity; and fibroblast growth factor receptor binding activity. Predicted to be involved in fibroblast growth factor receptor signaling pathway. Predicted to act upstream of or within aging; carbohydrate metabolic process; and insulin receptor signaling pathway. Predicted to be located in extracellular space and membrane. Predicted to be integral component of membrane. Predicted to be active in endoplasmic reticulum. Is expressed in several structures, including digestive system; gill; heart; pleuroperitoneal region; and yolk syncytial layer. Human ortholog(s) of this gene implicated in coronary artery disease; intracranial embolism; and spondylosis. Orthologous to human KL (klotho).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000079862

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00004310 False 3591 mRNA 0.50 6 34001444 34021856
TCONS_00004312 False 7341 mRNA 0.41 6 34010494 34026125
TCONS_00004311 True 7449 mRNA 0.41 5 34010494 34026125

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_002253 fryb coding upstream 1663 33895315 ~ 33999781 (+)
XLOC_002252 NA coding upstream 130432 33870189 ~ 33871012 (+)
XLOC_002251 rxfp2a coding upstream 134018 33744098 ~ 33867426 (+)
XLOC_002250 b3glctb coding upstream 291217 33626344 ~ 33710227 (+)
XLOC_002249 mis18a coding upstream 407334 33588715 ~ 33594110 (+)
XLOC_002255 BX548044.4 coding downstream 9564 34035689 ~ 34043319 (+)
XLOC_002256 zgc:174193 coding downstream 21227 34047352 ~ 34104491 (+)
XLOC_002257 BX548044.5 coding downstream 82416 34108541 ~ 34120301 (+)
XLOC_002258 BX548044.1 coding downstream 98296 34124421 ~ 34147245 (+)
XLOC_002259 BX548044.2 coding downstream 125161 34151286 ~ 34171425 (+)
XLOC_002245 NA non-coding upstream 633279 33360328 ~ 33368165 (+)
XLOC_002244 NA non-coding upstream 642418 33357096 ~ 33359026 (+)
XLOC_002243 NA non-coding upstream 735757 33265381 ~ 33265687 (+)
XLOC_002241 CU929186.1 non-coding upstream 999011 33002319 ~ 33002433 (+)
XLOC_002260 BX548044.3 non-coding downstream 149343 34175468 ~ 34220241 (+)

Expression


Co-expression Network