XLOC_023632


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_023632
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007135.7
NCBI id CM002908.2
chromosome length 42172926
location 36872875 ~ 36879127 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00047248
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>TCONS_00047249
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00047248 False 5350 lncRNA 0.30 2 36872875 36878968
TCONS_00047249 True 6104 lncRNA 0.30 2 36872875 36879127

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_023631 fam171a2b coding downstream 46371 36812640 ~ 36826504 (-)
XLOC_023630 dcakd coding downstream 69984 36798558 ~ 36802891 (-)
XLOC_023629 si:ch73-334d15.1 coding downstream 144953 36721341 ~ 36727922 (-)
XLOC_023628 NA coding downstream 173868 36689295 ~ 36699007 (-)
XLOC_023627 ccr10 coding downstream 192614 36673686 ~ 36680261 (-)
XLOC_023633 dnaaf3l coding upstream 24045 36903172 ~ 36910224 (-)
XLOC_023634 dnaaf3 coding upstream 116168 36995295 ~ 37003577 (-)
XLOC_023635 NA coding upstream 167467 37046594 ~ 37049911 (-)
XLOC_023636 NA coding upstream 190556 37069683 ~ 37076817 (-)
XLOC_023637 NA coding upstream 291190 37170317 ~ 37170924 (-)
XLOC_023665 dre-mir-735 misc upstream 1298834 38177961 ~ 38178027 (-)
XLOC_023625 NA non-coding downstream 293408 36574093 ~ 36579467 (-)
XLOC_023621 NA non-coding downstream 445094 36275575 ~ 36427781 (-)
XLOC_023624 NA non-coding downstream 506109 36364436 ~ 36366766 (-)
XLOC_023613 NA non-coding downstream 825683 36046699 ~ 36047192 (-)
XLOC_023641 NA non-coding upstream 410341 37289468 ~ 37295101 (-)
XLOC_023644 CU469584.1 non-coding upstream 482062 37361189 ~ 37404466 (-)

Expression


Co-expression Network