XLOC_025174



Basic Information


Item Value
gene id XLOC_025174
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 15685362 ~ 15719823 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence


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>TCONS_00049719
GAAGAAGGGAGGGCATGTTGGAGAGAATCACGAGAGCCCAATAGGCCATTGGCAGTGGTGAAGAGATTAATGGGAGAGGAGCCGTCTGTAATAAGAGTAGACTTCAGACCCAAAGACTGCAGGAGCTTCACCTGGAAGACAAAACGTCGTACACCTGCACGGTGGCGTTGTGTGGGATACGATAAGACACCACTCTGGTTTTATCCCGCTCCGCCTGCCCAAAGCTCCTTCCTCGATCTGAGCGGTCAGCCAGCGGATCACGGGACTGCGCCAGAAGAGACTCTACATTGGCCGGAAGCTCTTTCTCCCACAATTCCTCATCCTGCGTCAGCATGCGTTTTCTTATCACGTAAACATGAAGACAAACATTTTGGGAATGCTCATGGGGTCATATCAACTATTCAGAATAAGGGTCAAAGGCTTGTGAAACAGGAAGCAAACATGTCCTGTACCCCCTGAGTGTCAATGAAGGCCTCGACGGCGCGCAGCACAAGCCCTTCCTCCTCAGACAGCACATACACATCCTGAATGCCGTTCTCCAGATGCTCACCGGGCATGAGGAAGAATGAACGCTCACCCTATTAGATGAGGAGACACAGAGAAGAGGTTTTTATCAGTATATGCTATACCTGCAGCAatcacatacattcattcattca

Function


GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000093219

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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XLOC_025169 NA coding upstream 179205 15505184 ~ 15506157 (+)
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XLOC_025180 NA non-coding downstream 146098 15865921 ~ 15866402 (+)
XLOC_025183 CR387933.1 non-coding downstream 335186 16055009 ~ 16055732 (+)
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XLOC_025185 NA non-coding downstream 466770 16186593 ~ 16241340 (+)

Expression



Co-expression Network