XLOC_033439 (rbm14b)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_033439
gene name rbm14b
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007118.7
NCBI id CM002891.2
chromosome length 74282399
location 6941583 ~ 7043133 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

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Function

symbol description
rbm14b Predicted to enable RNA binding activity and zinc ion binding activity. Acts upstream of with a negative effect on BMP signaling pathway. Predicted to be located in nucleus. Predicted to be part of spliceosomal complex. Orthologous to several human genes including RBM14-RBM4 (RBM14-RBM4 readthrough).

GO:

id name namespace
GO:0046872 metal ion binding molecular_function
GO:0003676 nucleic acid binding molecular_function
GO:0003723 RNA binding molecular_function
GO:0008270 zinc ion binding molecular_function

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-040426-2455 Predicted to enable RNA binding activity and zinc ion binding activity. Acts upstream of with a negative effect on BMP signaling pathway. Predicted to be located in nucleus. Predicted to be part of spliceosomal complex. Orthologous to several human genes including RBM14-RBM4 (RBM14-RBM4 readthrough).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000103834

RNA

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TCONS_00065462 False 2257 mRNA 0.52 5 6941583 7035227
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TCONS_00065467 True 3016 mRNA 0.51 4 7027199 7036566

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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XLOC_033442 gal3st3 coding downstream 108699 7151832 ~ 7249789 (+)
XLOC_033443 NA coding downstream 222549 7265682 ~ 7275388 (+)
XLOC_033444 NA coding downstream 232718 7275851 ~ 7279896 (+)
XLOC_033445 si:ch211-168d1.3 coding downstream 236770 7279903 ~ 7373059 (+)
XLOC_033446 NA coding downstream 377079 7420212 ~ 7422923 (+)
XLOC_033429 NA non-coding upstream 688922 6249392 ~ 6252661 (+)
XLOC_033428 NA non-coding upstream 884221 6053845 ~ 6057362 (+)
XLOC_033416 NA non-coding upstream 994456 5943810 ~ 5947127 (+)
XLOC_033406 NA non-coding upstream 1114083 5826581 ~ 5827500 (+)
XLOC_033450 NA non-coding downstream 511627 7554760 ~ 7563288 (+)
XLOC_033453 CABZ01030292.1 non-coding downstream 729032 7772165 ~ 7772378 (+)

Expression


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