G137929 (LOC103374120)


Basic Information

Item Value
gene id G137929
gene name LOC103374120
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053124.1
NCBI id CM020921.1
chromosome length 39224300
location 31943797 ~ 31948488 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU185755
tgtgtttgcacgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcctctacCTTTGTGAGGACCAAAAGTTTAGACAGTGAAAGTGAGGACAGTGTCCCCACCCAGTGGTTGTAAGTACTCAGTACATGCACTCGATACTGCACTTGAAGCACATTGTTAAGCTATTTGTTAGGTTGTCTTATTTTGCATTTGAACGCATCATGTAGAGAGCTCAACTGCTGCTCACATTTCTGTTCAATGTACACAGAAGGATTCACAGCTGCatgttaatttaaatttttttttattttcaagtaGTTACTCAACAATGCTGTGTGTAAAACAGTTATTCTATGTTATATTTCTACTTTaccacattaatctgacagcttttctTACTTTGCAGAATCAAATTATTAACACAACATAACTAATTACGATGTGATATTAAGCCACCCAGCAGTTTATACAGTTACACAGTAAATCACAGCCGCatgttcatttcatttttatttttttattttcaagtaGTTACTCTCATCAATAATAACAATGCTGTATGTAAAACAAACCCGCAGAGTTAAAGTGATTTATACAGAGcttgtttaaaagtaaaaaaaaaaaaaggaagtttaGGGTAAGTAGGTCAGCAGGAAGTCCTTAATCCAGCAAGGCAGTGAAGTAAGGTTGCCATTTGAGAGGGGGCGGGTTGATGCAGAGACtgtataagtgaagccaaaacatctggatcgcccaaagatggtttctgtcatttcgGGGTAGTTCTGATCACACTGGTGTTAGTTCAAGTGTTAATTTTTCtgatcagtgtttttttttttgttacttaatgcTATAAAAGCAGGGTGAAACCATagtgattgacagctgggattGACTCGTGATTGGTCGGGCAGGTGTGTGACCGGGACTTTGATGCTGCTACATCcgtggttgatgctccacgcccttgaccggcagctgattggatgaatgcgtcacgtgggtctggccgCTCGAGAATTTCAACCGAGCGTCACGGCGGCCAGTTacgaatacgatctcgtattttacgaaaataggtCACCAggatgtttctgaaaacattttaagcgagttGTATCGTACAGTTGCTgaaatctgtcttcatttcagatcgacaaaggtcagttggaaagattttcgtctacttctactggatggTCGCgtttcatttgcataaagatgggcatcGGCCGGATTTTTGGACGCGCAGCAATTTTCAAatgcagcgccgccttcccAGGATGCTTTGCGGGCGCGTTAAAGTCACTTGACGTCACCCAGAGGAATAAAGCGGAGCGACAGAAGCCTCGCACGGACAAATGGATCAGCACTGTATGGTTGAGAGGGAAAAGCAGCATTATTTTTGATCAAATGTAAGAAAAAAGGCAGTACTGGTTCGTGggtttttcttacacccctctAAATCTTGATCCATGGTCCTGCGGAGGCTCCCCGCAGCCTACGTAAGTTTATACTTGGTGCGTTGGTGTGCGCGTCGATTtcttaaaagaaaatgtttcaaaTATTAGGGTGTAGCGTCGGTATCTCAGATCGCAGATTTAACGCcgaagcataaatcacgctttataAACAAAAACCGCGTCAGGAGCCTTTACTTGTTCACAGTGGGAGGGTGTAAATCATTTTTTACGTGAGGTTTTATGTTGATAATTGAGAAAACTTCAGGTTGAATTAACTTCCCTGATAAATAGGGCCTGGGTATCGCCAGTGATTTCCCGAATCGATTCGATTCTGACTCTTTAATAttaacattcattcaataatATTTTGAGATCTCTACTTTTGAGTAAAAATAgaaattttgagcatatcaaacacttcatttcctgccttCTGGTGAATtgttctgcaacaatttgtgccttttttgcATCAAGTTATGGAgcaaattttttaaatgtaaattaaattataataggttttttggggggggttgcaccggccagttttgattattagtGGGGTTGTAACCCCCATCCCCCTTTTAATTTACTTATAATTCACCAGGTATTACATATATTAAACATATCAAAAGATCGATTTGGGGAttttattaacccttgtgttgtcttctcaTCCAATATGCACGTTTTTCtgcaaaaaatttaaaattaaaacgtttattttttccaagtcttttgtcacttattctgtttgttgatttttttttctgcgcttgttttttgacatttttgtagtttttttccactttttgaagctttttttccaacatttttatcatttttctttttcttcgaatactataaattaaataaaacacccaaattcaataatagtagtgaactgatcatttatttgacttgtgaagagcCTTGCAtagaaccatccatgttatttttttggacaatttggtaATTgtaaaacccaaatttctgatgtagaaactttttgaaaatgggtcatatttgacccgaagacaacaggagggttaatcgATAACAGATCACAgattcaaacaaagaaaaaaactaatttaatttGAGAATGGATTATTTGAACCCAGCCCTACTGATAACAGTGTTTGGTGTCTTAAAcccccaacgtcgccttccaggcagcgctgtctGGAAGGCAcaaggattaggcaatggttaggggcAGGGTTAGCGTTAGGTGTGTCACTGCCCGATGCGAGTCGAGTTccgatgtgagtcgcgcatgcgtcacttagcgacaagatgctaacggcttttTGAGCTAACGCACAGTCTATGAGCTGACGTTagcaactgctgctgctgctgtctacacgtttttgaaatgatttccatcttctgctATTGTATGTAaacgtttattattttatggatttcacaaatttcagtaagacacgttatgccgtaaaccgtttgaATCTGAGCATGCCCGACTCACATgagcactcgactcacatcgggcagcgACAAGGTGTCTTGAAGTCAACgctcgcagcgctgccttgaagtcaacgctCGCAGTGCTGCCTttaagtcgacgttgggggcttaaaactcCATCGAGCGCTGATAACTCGTCCTCAcaccagctgcagcagcagcccgTACGGTCGGATGGACTCCTGCACGATGGCTCTCGCCTGGACGTCGTTGCACTCTTTGGGGACGTAGACCAACCAGACGTCCTCCCGCTGGCACTTCACCCTCTTCGACGGGTTGATGCGGTTCTGGAGAACCACTTTGTACGTCTTCCCGTCCActttggacttgaactgcttgCAGTACTTCTCCGCCAGCTTGATGTCCGGCGTGGAGTACGCCCCTCGGCCCCTCGTCTCGGCGTTGACCAGCGAGGCGGCGGCGGCTTCCAGGAAGCAGGGCTCGTCGCCGGGGCTACCGCCGTGGGTCAGGATGATGCCCAGGGAGCCGTCCATGTTGTGTCCGTGGTAGGAGACGGGCCAGGCGTCCTTCCCCGTCCCGAGCCAGGTGTCCCCGTCGTACTTCCGCACGACCTGCAGCGCGGCGCGGTTCCAGCCGCAGGGACGGATGTACGGCTCGTTGCCGCGCAGGAACGTCTTGCTGCCGTCCTG
>TU185756
GTAAAACAGTTATTCTATGTTATATTTCTACTTTaccacattaatctgacagcttttctTACTTTGCAGAATCAAATTATTAACACAACATAACTAATTACGATGTGATATTAAGccacattaatctgacagcttttctTACTTTGCAGAATCAAATTATTAACACAACATAACTAATTACGATGTGATATTAAGCCACCCAGCAGTTTATACAGTTACACAGTAAATCACAGCCGCatgttcatttcatttttatttttttattttcaagtaGTTACTCTCATCAATAATAACAATGCTGTATGTAAAACAAACCCGCAGAGTTAAAGTGATTTATACAGAGcttgtttaaaagtaaaaaaaaaaaaaggaagtttaGGGTAAGTAGGTCAGCAGGAAGTCCTTAATCCAGCAAGGCAGTGAAGTAAGGTTGCCATTTGAGAGGGGGCGGGTTGATGCAGAGACtgtataagtgaagccaaaacatctggatcgcccaaagatggtttctgtcatttcgGGGTAGTTCTGATCACACTGGTGTTAGTTCAAGTGTTAATTTTTCtgatcagtgtttttttttttgttacttaatgcTATAAAAGCAGGGTGAAACCATagtgattgacagctgggattGACTCGTGATTGGTCGGGCAGGTGTGTGACCGGGACTTTGATGCTGCTACATCcgtggttgatgctccacgcccttgaccggcagctgattggatgaatgcgtcacgtgggtctggccgCTCGAGAATTTCAACCGAGCGTCACGGCGGCCAGTTacgaatacgatctcgtattttacgaaaataggtCACCAggatgtttctgaaaacattttaagcgagttGTATCGTACAGTTGCTgaaatctgtcttcatttcagatcgacaaaggtcagttggaaagattttcgtctacttctactggatggTCGCgtttcatttgcataaagatgggcatcGGCCGGATTTTTGGACGCGCAGCAATTTTCAAatgcagcgccgccttcccAGGATGCTTTGCGGGCGCGTTAAAGTCACTTGACGTCACCCAGAGGAATAAAGCGGAGCGACAGAAGCCTCGCACGGACAAATGGATCAGCACTGTATGGTTGAGAGGGAAAAGCAGCATTATTTTTGATCAAATGTAAGAAAAAAGGCAGTACTGGTTCGTGggtttttcttacacccctctAAATCTTGATCCATGGTCCTGCGGAGGCTCCCCGCAGCCTACGTAAGTTTATACTTGGTGCGTTGGTGTGCGCGTCGATTtcttaaaagaaaatgtttcaaaTATTAGGGTGTAGCGTCGGTATCTCAGATCGCAGATTTAACGCcgaagcataaatcacgctttataAACAAAAACCGCGTCAGGAGCCTTTACTTGTTCACAGTGGGAGGGTGTAAATCATTTTTTACGTGAGGTTTTATGTTGATAATTGAGAAAACTTCAGGTTGAATTAACTTCCCTGATAAATAGGGCCTGGGTATCGCCAGTGATTTCCCGAATCGATTCGATTCTGACTCTTTAATAttaacattcattcaataatATTTTGAGATCTCTACTTTTGAGTAAAAATAgaaattttgagcatatcaaacacttcatttcctgccttCTGGTGAATtgttctgcaacaatttgtgccttttttgcATCAAGTTATGGAgcaaattttttaaatgtaaattaaattataataggttttttggggggggttgcaccggccagttttgattattagtGGGGTTGTAACCCCCATCCCCCTTTTAATTTACTTATAATTCACCAGGTATTACATATATTAAACATATCAAAAGATCGATTTGGGGAttttattaacccttgtgttgtcttctcaTCCAATATGCACGTTTTTCtgcaaaaaatttaaaattaaaacgtttattttttccaagtcttttgtcacttattctgtttgttgatttttttttctgcgcttgttttttgacatttttgtagtttttttccactttttgaagctttttttccaacatttttatcatttttctttttcttcgaatactataaattaaataaaacacccaaattcaataatagtagtgaactgatcatttatttgacttgtgaagagcCTTGCAtagaaccatccatgttatttttttggacaatttggtaATTgtaaaacccaaatttctgatgtagaaactttttgaaaatgggtcatatttgacccgaagacaacaggagggttaatcgATAACAGATCACAgattcaaacaaagaaaaaaactaatttaatttGAGAATGGATTATTTGAACCCAGCCCTACTGATAACAGTGTTTGGTGTCTTAAAcccccaacgtcgccttccaggcagcgctgtctGGAAGGCAcaaggattaggcaatggttaggggcAGGGTTAGCGTTAGGTGTGTCACTGCCCGATGCGAGTCGAGTTccgatgtgagtcgcgcatgcgtcactttgcgacaagtagccgccaagatgctaacggcttttTGAGCTAACGCACAGTCTATGAGCTGACGTTagcaactgctgctgctgctggctacaagttagcaatcaaacacaacaaaggctgtcacttgaatggcgttttgagctaacgttagcaatcaaacaatcatagctaGCTAccacgtttttgaaatgatttccatcttctgctATTGTATGTAaacgtttattattttatggatttcacaaatttcagtaagacacgttatgccgtaaaccgtttgaATCTGAGCATGCCCGACTCACATgagcactcgactcacatcgggcagcgACAAGGTGTCTTGAAGTCAACgctcgcagcgctgccttgaagtcaacgctCGCAGTGCTGCCTttaagtcgacgttgggggcttaaaactcCATCGAGCGCTGATAACTCGTCCTCAcaccagctgcagcagcagcccgTACGGTCGGATGGACTCCTGCACGATGGCTCTCGCCTGGACGTCGTTGCACTCTTTGGGGACGTAGACCAACCAGACGTCCTCCCGCTGGCACTTCACCCTCTTCGACGGGTTGATGCGGTTCTGGAGAACCACTTTGTACGTCTTCCCGTCCActttggacttgaactgcttgCAGTACTTCTCCGCCAGCTTGATGTCCGGCGTGGAGTACGCCCCTCGGCCCCTCGTCTCGGCGTTGACCAGCGAGGCGGCGGCGGCTTCCAGGAAGCAGGGCTCGTCGCCGGGGCTACCGCCGTGGGTCAGGATGATGCCCAGGGAGCCGTCCATGTTGTGTCCGTGGTAGGAGACGGGCCAGGCGTCCTTCCCCGTCCCGAGCCAGGTGTCCCCGTCGTACTTCCGCACGACCTGCAGCGCGGCGCGGTTCCAGCCGCAGGGACGGATGTACGGCTCGTTGCCGCGCAGGAACGTCTTGCTGCCGTCCTG

Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC103374120

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU185755 True 3586 lncRNA 0.44 3 31944321 31948488
TU185756 False 3453 lncRNA 0.44 3 31943797 31948488

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
vps52 vps52 coding upstream 25954 31881882 ~ 31917843 (+)
LOC120571697 ring1 coding upstream 73409 31860945 ~ 31870388 (+)
LOC120570797 NA coding upstream 142115 31799108 ~ 31801682 (+)
LOC120571681 NA coding upstream 472630 31468125 ~ 31471167 (+)
si:ch211-264f5.6 NA coding upstream 777707 31119789 ~ 31166090 (+)
atf6b atf6b coding downstream 296506 32244994 ~ 32276565 (+)
LOC120571106 NA coding downstream 399795 32348283 ~ 32398742 (+)
LOC120570932 NA coding downstream 459895 32408383 ~ 32415662 (+)
LOC120570933 NA coding downstream 474724 32423212 ~ 32426098 (+)
LOC120571113 NA coding downstream 481926 32430414 ~ 32451519 (+)
G137915 NA non-coding upstream 23123 31869135 ~ 31920674 (+)
G137916 NA non-coding upstream 69997 31825549 ~ 31873800 (+)
LOC120570794 NA non-coding upstream 94457 31847055 ~ 31849340 (+)
G137879 NA non-coding upstream 220191 31721804 ~ 31723606 (+)
G137836 NA non-coding upstream 453738 31489860 ~ 31490059 (+)
G137952 NA non-coding downstream 151555 32100043 ~ 32100373 (+)
G137953 NA non-coding downstream 154396 32102884 ~ 32103176 (+)
G137956 NA non-coding downstream 159373 32107861 ~ 32128359 (+)
G137970 NA non-coding downstream 196122 32144610 ~ 32145491 (+)
G137983 NA non-coding downstream 332967 32281455 ~ 32281978 (+)
LOC120570800 NA other upstream 260345 31617595 ~ 31683452 (+)
G137773 NA other upstream 1006940 30921166 ~ 30936857 (+)
G137743 NA other upstream 1196789 30745785 ~ 30747008 (+)
rnf139 rnf139,LOC106674496 other upstream 1285358 30571463 ~ 30658439 (+)
LOC120570927 NA other upstream 1425907 30516558 ~ 30517890 (+)
LOC120571558 NA other downstream 46513 31995001 ~ 32003680 (+)
G138076 NA other downstream 481922 32430410 ~ 32504976 (+)
LOC120571115 NA other downstream 589789 32538277 ~ 32566162 (+)
G138105 NA other downstream 693153 32641641 ~ 32699309 (+)
G138130 NA other downstream 1035274 32983762 ~ 33020409 (+)

Expression


Co-expression Network