G150960


Basic Information

Item Value
gene id G150960
gene name NA
gene type unknown
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053126.1
NCBI id CM020923.1
chromosome length 38831509
location 2148731 ~ 2216999 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU204401
catattggactaaaatagttcacagaGACATGTTACTGGGAACATCTGGAGAGAGAaatagggtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtctcgtgtgtgtgtctcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgc
>TU204402
catattggactaaaatagttcacagaGACATGTTACTGGGAACATCTGGAGAGAGAaatagggtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgcg
>TU204406
catattggactaaaatagttcacagaGACATGTTACTGGGAACATCTGGAGAGAGAaatagggtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtttgtgtgtgtgtgtctctctctgtgtgtgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgt
>TU204407
catattggactaaaatagttcacagaGACATGTTACTGGGAACATCTGGAGAGAGAaatagggtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctctgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgc
>TU204409
catattggactaaaatagttcacagaGACATGTTACTGGGAACATCTGGAGAGAGAaatagggtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtctcgtgtgtgtgtctcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgcg
>TU204410
catattggactaaaatagttcacagaGACATGTTACTGGGAACATCTGGAGAGAGAaatagggtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtttgtgtgtgtgtgtctctctctgtgtgtgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgt
>TU204412
catattggactaaaatagttcacagaGACATGTTACTGGGAACATCTGGAGAGAGAaatagggtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtatgtgtctgtgtgtgtatgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgcg

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU204401 True 824 TUCP 0.49 2 2148731 2164361
TU204402 False 575 TUCP 0.49 2 2148731 2216999
TU204406 False 820 TUCP 0.49 3 2148731 2154848
TU204407 False 728 TUCP 0.49 3 2148731 2164361
TU204409 False 535 TUCP 0.49 3 2148731 2216999
TU204410 False 506 TUCP 0.48 3 2148731 2154848
TU204412 False 517 TUCP 0.49 3 2148731 2216999

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120575157 gcdh,LOC102794743,LOC101471797,LOC102209187,LOC100704678 coding upstream 29608 2091477 ~ 2119123 (+)
LOC120573865 NA coding upstream 372160 1767641 ~ 1776571 (+)
jmjd8 jmjd8 coding upstream 650631 1485594 ~ 1498100 (+)
LOC120573834 NA coding upstream 728833 1402982 ~ 1419898 (+)
LOC120573839 NA coding upstream 1041435 1068480 ~ 1107296 (+)
trappc5 LOC103358680,LOC104930124,LOC100705746 coding downstream 236751 2453750 ~ 2459249 (+)
LOC120574835 mcoln1,LOC104930122,LOC101475291,LOC102295873,LOC106517836 coding downstream 244244 2461243 ~ 2493919 (+)
wu:fb95e10 NA coding downstream 303716 2520715 ~ 2581298 (+)
engl NA coding downstream 481927 2698926 ~ 2733225 (+)
si:ch211-106h11.1 LOC103371866,LOC102800031 coding downstream 553370 2770369 ~ 2783645 (+)
G150958 NA non-coding upstream 1705 2145332 ~ 2147026 (+)
G150948 NA non-coding upstream 27062 2121337 ~ 2121669 (+)
G150947 NA non-coding upstream 53916 2094208 ~ 2094815 (+)
G150926 NA non-coding upstream 75952 2008717 ~ 2072779 (+)
G150942 NA non-coding upstream 78020 2069793 ~ 2070711 (+)
G151045 NA non-coding downstream 57814 2274813 ~ 2275121 (+)
G151052 NA non-coding downstream 89970 2306969 ~ 2307300 (+)
G151054 NA non-coding downstream 119035 2336034 ~ 2397394 (+)
G151062 NA non-coding downstream 133322 2350321 ~ 2351235 (+)
G151063 NA non-coding downstream 134852 2351851 ~ 2353552 (+)
G150905 NA other upstream 81083 1936920 ~ 2067648 (+)
G150804 NA other upstream 379837 1761280 ~ 1768894 (+)
G150386 NA other upstream 823631 1324062 ~ 1325100 (+)
G150465 LOC105897445 other upstream 840358 1284929 ~ 1308373 (+)
G150388 NA other upstream 894711 1235548 ~ 1254020 (+)
LOC120574078 LOC103371863,LOC106930631,LOC103154952,LOC106957020,LOC105929964 other downstream 428827 2645826 ~ 2691562 (+)
G151122 LOC103375031,LOC102776069 other downstream 582470 2799469 ~ 2802221 (+)
G151240 NA other downstream 784900 3001899 ~ 3003364 (+)
junbb LOC103364966,LOC107087652,LOC104932219,LOC100707881,LOC105929935 other downstream 866899 3083898 ~ 3104592 (+)
G151315 NA other downstream 929505 3146504 ~ 3147977 (+)

Expression


Co-expression Network