G179903


Basic Information

Item Value
gene id G179903
gene name NA
gene type misc
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053128.1
NCBI id CM020925.1
chromosome length 37416781
location 33114691 ~ 33187628 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU243669
ggggtgtgtgtctctgtgtcagtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtatttgtgtttgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtatttgtgtttgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtcagtttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcagtctgtgtttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcagtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtcagtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtcagtctgtgtttgtgtttgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtctctgtctgtgtgtgtgtttgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcagtctgtgtttgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctctgtctctgtctgtgtgtgtgtttgtctctgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatctgtgtgtgtgtaaaagtaaaagaaagggaaaaaccCATCTAACACAAGGCGCCATGGCCAGCGGTGAACTAGCCTCtgtcctctgattggtcagtggcTCTGGTGAACTAGCCTCtgtcctctgattggtcagtggcTCTGGTGAACTAGCCTCtggcctctgattggtcagtggcTCTGGTGAACTAGCCTCtggcctctgattggtcagtattTCCGTCAGGAGTTGCTCTTCCTGCGTTTCCCGTCTCTCCCCTCCGGCGTTCCTCTCGGCCTCTTCCTGCCAGGCGGCGCCGCCGTTTCCGTGGAGACGCGGCAGCAGGAAACAGGAACAGGAAACGCATCGAGGGTTAAAGTCTGCGAGTGGAACAGAGGAGAGACGGCCAATAGGACGCTGACGGCGTCGTGGAGACGCTCgttcttcttctgctgctgctgctgctggggggGGTCAGGGTCTgtagcagagacacacacacacacacacacacacacagagagacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaaacacagagacacacacacacacacacacagagacacacacacacacacacacacacagacacacacacacacacacacacacacacacacacagacagatagaaacacacacacacacagagagagacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacagcaacacagagacacacacacaacgcttAGATTCTtctaatgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttcctcgtCTCCATCACAGTGTAGTTAACTACATGATGTATGTTtagtgggaatcgaacctgcGGCTG
>TU243671
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>TU243672
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>TU243673
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>TU243674
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>TU243675
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU243669 True 1528 lncRNA 0.51 3 33115765 33117759
TU243671 False 1147 lncRNA 0.52 5 33115765 33117759
TU243672 False 496 lncRNA 0.50 3 33114691 33187628
TU243673 False 1216 TUCP 0.49 4 33115765 33187628
TU243674 False 1387 lncRNA 0.51 4 33115765 33117759
TU243675 False 715 lncRNA 0.50 2 33114691 33117556

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC120545707 NA coding upstream 38552 33073364 ~ 33076139 (+)
LOC120545701 NA coding upstream 59807 33052912 ~ 33054884 (+)
LOC120545698 NA coding upstream 78459 33033850 ~ 33036232 (+)
LOC120545699 NA coding upstream 84374 33027615 ~ 33030317 (+)
psmb6 psmb6,LOC107372744,LOC103460825,LOC101466438 coding upstream 165267 32940410 ~ 32949424 (+)
LOC120545739 LOC106675582 coding downstream 83608 33271236 ~ 33273527 (+)
LOC120545741 NA coding downstream 133739 33321367 ~ 33325749 (+)
LOC120545637 LOC106675582 coding downstream 377726 33565354 ~ 33567283 (+)
xpo7 xpo7 coding downstream 428409 33616037 ~ 33656759 (+)
LOC120545885 NA coding downstream 501469 33689097 ~ 33691664 (+)
G179897 helq non-coding upstream 18089 33094063 ~ 33096602 (+)
G179898 NA non-coding upstream 18939 33094425 ~ 33095752 (+)
G179876 NA non-coding upstream 96239 33017455 ~ 33018452 (+)
G179873 helq non-coding upstream 103435 33009719 ~ 33011256 (+)
G179870 NA non-coding upstream 106338 33003214 ~ 33008353 (+)
G179910 NA non-coding downstream 1619 33189247 ~ 33189571 (+)
G179992 NA non-coding downstream 68788 33256416 ~ 33259022 (+)
G180006 NA non-coding downstream 117516 33305144 ~ 33314650 (+)
G180010 NA non-coding downstream 157766 33345394 ~ 33345994 (+)
G180026 NA non-coding downstream 417343 33604971 ~ 33605298 (+)
mrps18c NA other upstream 5220 33103891 ~ 33109471 (+)
LOC120545086 LOC100699756 other upstream 130639 32964961 ~ 32984052 (+)
LOC120545732 lage3,LOC103372999 other upstream 665876 32442010 ~ 32448815 (+)
G179655 cox5b,LOC106567989,LOC106563057 other upstream 1015149 32079177 ~ 32099542 (+)
LOC120545711 NA other upstream 1036681 32059925 ~ 32078010 (+)
abraxas1 fam175a other downstream 2393 33190021 ~ 33197957 (+)
G179997 LOC102306450 other downstream 83368 33270996 ~ 33324065 (+)
dmtn LOC102797496,LOC102303313,LOC101469122,LOC102075582 other downstream 521097 33708725 ~ 33745193 (+)
G180040 NA other downstream 636714 33824342 ~ 33825338 (+)
G180043 NA other downstream 650564 33838192 ~ 33839387 (+)

Expression


Co-expression Network