G17674


Basic Information

Item Value
gene id G17674
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000001
NCBI id null
chromosome length 13537560
location 9790940 ~ 9803333 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU19814
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU19814 True 12322 lncRNA 0.37 2 9790940 9803333

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000001_09782626_09784851 NA coding upstream 5756 9782626 ~ 9785184 (+)
CI01000001_09582178_09593275 PTPN22 coding upstream 197657 9582178 ~ 9593283 (+)
CI01000001_09533674_09538902 NA coding upstream 251861 9533674 ~ 9539079 (+)
CI01000001_09509892_09522047 NA coding upstream 267859 9509892 ~ 9523081 (+)
CI01000001_09491225_09507444 PFKFB1 coding upstream 282929 9490227 ~ 9508011 (+)
CI01000001_09932205_09934551 NA coding downstream 127822 9931155 ~ 9935172 (+)
CI01000001_09946111_09958162 NA coding downstream 140787 9944120 ~ 9958246 (+)
CI01000001_10072627_10081119 CACNB3, CACNB3A, CACNB3B coding downstream 269294 10072627 ~ 10081179 (+)
CI01000001_10093069_10104108 RND1B, RND1, RND1A coding downstream 289569 10092902 ~ 10105699 (+)
CI01000001_10141190_10146911 PTGES3, PTGES3A coding downstream 337857 10141190 ~ 10148058 (+)
G17602 NA non-coding upstream 214155 9576471 ~ 9576785 (+)
G17601 NA non-coding upstream 215039 9575631 ~ 9575901 (+)
G17594 NA non-coding upstream 222715 9567903 ~ 9568225 (+)
G17588 NA non-coding upstream 232520 9558151 ~ 9558420 (+)
G17587 NA non-coding upstream 233043 9557593 ~ 9557897 (+)
G17694 NA non-coding downstream 1341 9804674 ~ 9805379 (+)
G17709 NA non-coding downstream 52142 9855475 ~ 9863074 (+)
G17710 NA non-coding downstream 52529 9855862 ~ 9857182 (+)
G17713 NA non-coding downstream 82252 9885585 ~ 9887156 (+)
G17751 NA non-coding downstream 160578 9963911 ~ 9966669 (+)
CI01000001_09435836_09436037 NA other upstream 352877 9435836 ~ 9436373 (+)
G17354 NA other upstream 550263 9234463 ~ 9240677 (+)
G17353 NA other upstream 562081 9216022 ~ 9228859 (+)
G17234 NA other upstream 1758457 8032124 ~ 8032483 (+)
CI01000001_07531945_07539781 NA other upstream 2250354 7531541 ~ 7540586 (+)
G18896 NA other downstream 436567 10239900 ~ 10241492 (+)
G18873 NA other downstream 453779 10223879 ~ 10260714 (+)
G18872 NA other downstream 467813 10271146 ~ 10281369 (+)
CI01000001_10395420_10396473 NA other downstream 590224 10394851 ~ 10396705 (+)
G18937 NA other downstream 671651 10474984 ~ 10476389 (+)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
tiger barb (Puntius tetrazona) G157705 NA non-coding NC_056721.1 CM032090.1 15482672 ~ 15486980 (+)