G34635



Basic Information


Item Value
gene id G34635
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id CI01000004
NCBI id null
chromosome length 17451736
location 14980342 ~ 14995039 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence


>TU39320
GTAATTTCAAAATGAAAATTAATTTTTCATACTGTACATTATAATGCAGTGATGCCTAAATTCACTTGTAGCATTTGAAATTATTTTAGTGTTACATTAGTAATAAAATTTAATATGAATATCACCATTATTGGTTAATATTAAAAAATATTTTTCGACTCATCATTATCGGTCAGAATTGTAATCTTTTGGGGCATCCCTATTTAGTTTGTTTTCAGTGTACTTTTCTTATACTTTACAACACTACAGTATAATTTCCCCCCCATTCCCATCTCACTCCGTGACTCACATCGACCTGACTGTCAGATCAGCTCAGAAACCCTGACTGAATGATAGATTGTGTTTGCTAGTATAGGAAATGATAAGAAAATATTACCTCACACCGCAAACTTCTCTAAATGTACAGCCGTTGCAAGAACAGGCTCGTGTTTTGTATGCTGTAGAGGTTCAATCTCTCTTTGAAGCAGCTTTGACACCATGCCGAGAGCTTTGTCTTGGGAAAAGAGAGTAGGATGCTGTCAAACCAGATCTTTTGTTTCTCCTCCTTTACTTTTCTTTCTTCATCTGGAATTAAACTCTGCCAGCAAGTAGAAAAGTTGTGTTTTTAGTGTCTGCCGAGTGACTTTTTATGGCCAATTTCTTTGTATGGCATAGAGTGCTGATATAGTTAGTGTGAGCTGGTTATTCCCTGTCCATGGTGCTGAATTTCTTTTGTGCAAGGGATAGAGAAGGTATCAGCAGCGTTCTGCAAGGCTCTGTGCTGTGCTGTGCAGCTTTTGCGGTGTGCTATTTCCTGCAGTGGGAGCTGTTTTTATGCATTTGAGGATGAATCTAGAATCTGGTACACTGTGATGCAGCAATCAGCACTGTCTCTTAAGTCCACCATCTGTTGTAGTTCTTGGACATTTATGGGAGATCTGTCAGTGTAATTGTGTGTTTGTCTTGGCTGGGAGGGCATTGATCTGACCCACGGCATCTAACAGAGCAGCAGTCACTGTCTCAGTAATTACATGTTTTCATTAAGAAAACTTGAGCAGCGTGCAATGGGGAGACGAAAGAAAAACAAAGCAAATTATATGTGGTATTTGTTTATTTGAATGTCTTGAATTTTTATATTTAAACATTTAAAAAGCAGTGCATTTTATCTGTCAAATATCTGCCAAAGGGTTTATGGGAAATCACTAAATTACAAAAGAGGCTTTTAGAGAACTGGGATGCTTTTAAACTGCACTTTATTTTTTAATTAGGCATTCTCAATGGAGAATTTTGCTGATCATGTTTTTTTTCCAGCAGCATGTTTCCTGGAAATATCTCTCACCTAGCAAATTCCTAACGTCTTTTTTCATCTTATACAATATAAAGGGAGAAAGAGACAGACATGCACACACACAGGGAGTGATGATTTTATTATACTAATATTAAAATGCTGAAGTTGAGGTGTTTACGCTTGTGTCAGAGTGAGCTGCTTTGGGCAGGTGGGAACTAAATATGGAAAACAAACATAGGAGCAGGTGAAAAAATAAAGCAGAAAAAAGCTCAAATGGACAAAGGAAGCTCTTTGTTTATAAATCTCTCCTATCAACATGTTTCATGTCCTACTCAATCACTTATGATGCAAAATTATGTTAGAGATTCTGTATGAAGTCCTTGATGTGATAGCGCCGTCATCGACATAGATGACGACAAATATAGGGGAATTGATTTTTGAAAGATAACTTACAAACCTTTAAAGACAGACCTACTGTGAGCTACGAGGTTGTTAATCGAGGGTAAATGCTTTTGTTGAAGCCATCAGCCTGTATTATTTCAACTTATTTTTTTAAAAATCGCGTTCAACAGTGGAATCCCTGGTGAAAAACTACATTACCCATGATTCTGCAGAGAAAGCTCCACTAATCAGAGGATCGGGAAAATCAAATCTTGCCAGAAGACCAAGCAGTCATGGGGACTGTAGTTCTTTCCCTCATTAAAGGGGTCATGAATTGAGAAATCAAATTTTCTTTCATCTTTTGATCATCATCAGGTCATGGTACTAAGAAAATACAGAACTCAAAATTTCCTTGTTAGTCCAAAAACAGCTTTTTATTGAAACCAAGCTGCCAGAACAACTCGTTTTGGATTTTATCACATTATGACAGTATAGTGCGATGAAAGACCGCCTCTGCAGAAGAAGATCAACGCCTACTTCTACAACATTGCCTCTTTAGCCCCGCCCACTGATTAACCCATATCATGTAGTAGGCTAGTAAATACAAGACAAACACAGGATTACTCCAGCAACAAAATGATAGAGATGTCTCTGAGGATTACAAGATGTTTTGCAGTGCCAAGTTGTGGAAAAACAGTCTTTGCTTCGCCTCCCTTGATCATAACATTAAGAAAGAGTGGATGAACTTTATTTTAACAAAGTTCCAGATCGCATCAGTAAGACACTGTTTGTTTGTTTGCTTCATTTTACTTCGGATTTATTTTTTAACAAAACGCTGTTTCAGCACAGGCTTTTCAGCATGAAAATAAAAGATGATGCAGTGCAGACTATATTAGATCTGACAGCAATGTCACAACACACTAGTGTGAGTAACAATGTTTTTACCACGTGTGTTTAATAAGTACTGACTATTTACACTGCAGCGCTGCAGTCAAACTGTGAATAGTTGTGATTTGCCGTTCTTTCCTTTGCTTCGGCATTTATGGAGTTAATGCGTCGGATACAGAAGAAAGCACGTAGAGAACGCTTCTTTTGTTGTTTTGATCGAGACATTCGCTGTAATCCTGAATAAAAGCTTCCGTAAGTGAGATCTTCTGTTTTCTCACCAGTAAGACATTATAACACGTTTCATTTTATTTAAAACACGACACTCCAAATGACATTATATTTTCACTTTATCAAAAATAATGAACGATGAATAGCCTATAAGAGTGACAAATGATGGTACATATTTATTCATAACTCCGTTTACACAAAACACTGTAAGTTATCATTTGTCAATTATAACTGTGATAACTCCAAGTACTTAAAGGGAACCCCTGTTATTAAGACTTGTATGGCTTAATATAAAGTAAATGATGTCTCTTACTGAAATATGTAAACCCCATGAAAGACTTGCGTTATTTAAAATCTCCATGACATATTTGGACAATGGGCGGCGCCATTTTGTTTAGGTGCACAGTGCGTTCTGTGTCGATGACGTCAAATGGTTGCACTCGGTGAGCTACTGACACTGTCCTGTTGTTATTTTTACCACAACACAACTCAGAATATAATATACGATGCCACATTGTGCAGCTTTTGGTTGTAATTTTCCGTCGATGAGCCAGAAGAGAAGTGTTTACTGCTTTACTAGCGATAAGAGGAGAAAAGAATGGGAAGTTGTGAAGAATGTGGGCGAATAAAACTTCCTTTATTTGCCACAACCAAGACTTATAAAGCATATGTAAACATGTATACATTTTTCACATTGCTGGCAAATATTTCAATGTAACAATATTTTTGAACATTGGAAGTTTTCAAAACAATTCCAAACGTGTAATGGTGCAGACGCTGAAAATTATTTTAATATGCAAAACTGTTGCCCAATCATAGCAATGGGCGTTTACTTCCCAGTCTTGAATGAGACACGCCCATCAAAACAGAGAGTTTGGTTCAAAAACAGGATAGAAAATAGCTTATTACTTCTAAATTAGGATCTTGATAACATTATAAGTGGACTTCAGGAAACATAATTTAAAAAAGATATGCAGCTCATGACCCCTTTAAGATGTTAAATATACAGTCTTGTACCTTGTCTTTTTATCAAACTTTTTTTGCTTCAAATCAAAGTTGTAATGTTGTGATTCACCTTGTAGCTTGTTGTTTTGTTTCATGACTTATAGCATTTAAAGTCCCTATGGGTATTTTTATGAATAGGAAAAGTATTTCCAGAACCAATGTTGCACCCTAGGAAATGTCTAGACAGCGTGATTGACCAATCAGAATCAAGTATTCCATAAAGCTGTTATATAAAATAATAATGGAATTCAATTCATAATATAACACTAGTTTCCACAGTAAGCTAATTACAAAAGATTTCACCGAGCTAAATGTACAGTATGAGTGCAACCCTTTAATTATTGTTTTTCAGTCTCATGTCAAAATGACAGAAATAGTCTTGCTATCTTAATGTTTGTATAAGCAACCTGAAGCTATGCAGTGTTTCTGCATGATAAGACATAATAACAATAATAAAGAACGTTTTTTTATGTTTTATATTGGATGCAACAATGTAATTACAAAGAGACCGTAATTAGAGTCTTATGCCCTACCACCTTAAGAATATGCCGTTTCCATTTCTTTTTCACTCAATCCCAAACCAATCAAAATATCTGCGGAGAGGCATATCCACACTCTGTATTTTTTCTTTTCCCTCCATTTTCCTTCGTTTAAATGAGAGTGCTGACCCCATTAGATAAAAAAAAGAAGAGAAGACAGACTGCATTCATTTTGAGAAGAGTGATTAATTACAGATGTTACTGAGACAATGAAATATAGATCATACCGACTGGGACTCCAGCCGGGTTTACTCAGTGTCAGGCTCTTCCAATTTTGATCAGAGGGAAAGGAATTCATCGCCGAGCTCTTTGCCACAGGTTTTTGTGATCATTAACATTCTCTTCAAAGGCTTGCAATAAAGCATGCTAACCAAAAAATCCACCCAAAAAGGCAGAAGGAAAGTTGTGACGTGCTGTGGTAGATTTATCTAGATATTTTTTTTGCAGTCTGTTGCAACTCATTTGGAGCTTGTGTAAATGGCGTTTTGAAATGAAATCTCTAAACCAAATCCTTTGGTCGACAGATGCACGAGAGAACGAAATGGAAAGAGAGGATGTGCGAAGGAAAAGGCGAGAGAAGATATACTTTGCATGGCTGAGATAAAAGACAGATCATTAGTCAGGGCTCTTAATATAACTGCAGGAACAGGAGAGCGTGGCACTGTCGGTTTTTAGACATTTGGGATCTATTT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Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU39320 True 11650 lncRNA 0.50 2 14980342 14995039

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
CI01000004_14951433_14957539 NA coding downstream 22501 14951176 ~ 14957841 (-)
CI01000004_14897662_14906408 NA coding downstream 73916 14897250 ~ 14906426 (-)
CI01000004_14860344_14863053 NA coding downstream 116894 14860286 ~ 14863448 (-)
CI01000004_14846825_14850092 NA coding downstream 128811 14846785 ~ 14851531 (-)
CI01000004_14843132_14843640 NA coding downstream 136363 14842913 ~ 14843979 (-)
CI01000004_14999971_15002640 SLITRK3B coding upstream 4236 14999275 ~ 15002640 (-)
CI01000004_15063428_15066310 NA coding upstream 68389 15063428 ~ 15066310 (-)
CI01000004_15068206_15086386 MAP1SB coding upstream 72716 15067755 ~ 15086519 (-)
CI01000004_15086759_15087492 NA coding upstream 91646 15086671 ~ 15087575 (-)
CI01000004_15159447_15160043 DIRAS1A, DIRAS1B, DIRAS1, DIRAS2 coding upstream 164369 15159408 ~ 15160043 (-)
G34558 NA non-coding downstream 59003 14921068 ~ 14921339 (-)
G34550 NA non-coding downstream 67606 14910081 ~ 14912736 (-)
G34470 NA non-coding downstream 87047 14889692 ~ 14893295 (-)
G34468 NA non-coding downstream 92286 14885825 ~ 14888056 (-)
G34474 NA non-coding downstream 142020 14837689 ~ 14838322 (-)
G34661 NA non-coding upstream 35406 15030445 ~ 15030741 (-)
G34663 NA non-coding upstream 36952 15031991 ~ 15032373 (-)
G34664 NA non-coding upstream 43553 15038592 ~ 15038910 (-)
G34666 NA non-coding upstream 53673 15048712 ~ 15049140 (-)
G34670 NA non-coding upstream 58824 15053863 ~ 15054107 (-)
CI01000004_14827536_14831360 NA other downstream 152219 14827496 ~ 14831526 (-)
CI01000004_14808034_14808645 NA other downstream 171813 14807938 ~ 14808969 (-)
CI01000004_14775109_14792782 NA other downstream 197686 14774282 ~ 14792784 (-)
CI01000004_14749034_14751685 NA other downstream 228623 14748304 ~ 14753596 (-)
G34632 NA other upstream 16322 15011361 ~ 15025221 (-)
G34668 NA other upstream 56137 15051176 ~ 15052775 (-)
G34718 NA other upstream 285977 15281016 ~ 15281649 (-)
G34633 NA other upstream 792347 15787386 ~ 15787897 (-)

Expression



Co-expression Network