G187399


Basic Information

Item Value
gene id G187399
gene name NA
gene type non-coding
species mexican tetra (Astyanax mexicanus)
category of species ornamental fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_035918.1
NCBI id CM008321.1
chromosome length 32506130
location 4941025 ~ 4949650 (+)
genome version Astyanax_mexicanus-2.0_2017_mexican_tetra_Genome

Sequence

>TU254118
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>TU254119
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tnfrsf9 NA coding upstream 45984 4887519 ~ 4895041 (+)
LOC103023712 NA coding upstream 56659 4873029 ~ 4884366 (+)
LOC103025087 NA coding upstream 71236 4859869 ~ 4869789 (+)
LOC103024549 LOC103024549,LOC108441419,LOC107756648,LOC107654396,LOC107592863,LOC107582410,LOC107654432 coding upstream 99260 4826094 ~ 4841765 (+)
LOC103021734 dnajc11,LOC107654442,LOC107751176,LOC103038967 coding downstream 522832 5472482 ~ 5486413 (+)
fbxo2 NA coding downstream 558658 5508308 ~ 5517565 (+)
wnt4 wnt4,wnt4a,LOC107565731,LOC107654388 coding downstream 775693 5725343 ~ 5731344 (+)
ap5b1 ap5b1 coding downstream 815799 5765449 ~ 5771297 (+)
cldn19 cldn19,LOC107654447,LOC107582397,LOC107751184,LOC107565733 coding downstream 868334 5817984 ~ 5835626 (+)
G187400 NA non-coding upstream 68247 4872365 ~ 4872778 (+)
G187307 NA non-coding upstream 139119 4801106 ~ 4801906 (+)
G187305 NA non-coding upstream 140517 4797616 ~ 4800508 (+)
G187306 NA non-coding upstream 143469 4796928 ~ 4797556 (+)
G187281 NA non-coding upstream 357695 4549931 ~ 4583330 (+)
G187409 NA non-coding downstream 28734 4978384 ~ 4989227 (+)
LOC111195360 NA non-coding downstream 41891 4991541 ~ 5004012 (+)
G187473 NA non-coding downstream 537438 5487088 ~ 5487811 (+)
G187472 NA non-coding downstream 539310 5488960 ~ 5489830 (+)
G187471 NA non-coding downstream 540435 5490085 ~ 5491257 (+)
G186978 rps23,rs23,LOC106566095,LOC106566598 other upstream 1546182 3392387 ~ 3394843 (+)
G186880 lmcd1 other upstream 1939010 2980497 ~ 3002015 (+)
podxl2 NA other upstream 3845688 606833 ~ 1095337 (+)
cers5 cers5,LOC107698577,LOC107590873,LOC107694004,LOC107718462 other upstream 4402809 510575 ~ 538216 (+)
G186231 NA other upstream 4825938 107396 ~ 115087 (+)
p3h1 NA other downstream 830241 5779891 ~ 5798979 (+)
LOC103029365 NA other downstream 2127515 7077165 ~ 7098672 (+)
trnaq-uug_4 NA other downstream 2242504 7192154 ~ 7192226 (+)
LOC111195452 NA other downstream 3162353 8112003 ~ 8113242 (+)
agtrap agtrap other downstream 3307146 8256796 ~ 8271712 (+)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus) G99362 NA non-coding NC_047600.1 CM018546.1 14630335 ~ 14631361 (+)