G159129


Basic Information

Item Value
gene id G159129
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000030
NCBI id null
chromosome length 11638347
location 2944462 ~ 2951345 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU180663
GGGTGAGGAGGGCAGGTGGCCTGCCTCTCTTGGCAAATTACGTGTTTATGTGCCGAGGACACAAAGCCAAGAATGGCAAAACAATCGTGTTGAAGACAAACTAATTTTGGAGCCGACTAGAATTTGCCCACAGATGTGACCAATGGATGTCCAAAAAAATGGAATTCTGGGCTATGTACCAGTAACGCCTCTAACACAGGCAACTTACCTATTCGATCAAGGCGGTCGATGGCTACGGTCTCAAACGCTCTCCTCATCATGGGGTACTCCTCCAGTACTTCATTAAAGTTGTCTACGGAGAGCGAGTACAGTCGGCAATAGGTGTCCGCCCGTACGCTGGCGGTTCGTCTTCCACGGGTCAACAGGCAGATCTCTGAGAATGAACAGGACATATCATGGTTATGGTTCCAGAATCTTCTGTATCTTAGTGTAACAGACGTAGGCTACTAAGAGCTGTGCATGTAAACCTCACTCCCCTGAACTCAAGAGGTGCTCTAGCGACTGACTGTGGTCTTTAGCCTCCTTGTCAGAGCACCCACCTCCCATGCGGACGGGCCCGGGTTTGTGTCCCGCTTGGAGCAGGCAGGTGCGAACTAGAGGGGCTACATTGGTGCCGTGACCAGATGGGAGTGAGGCTTAGGGGGGTGAGTGTAACAGATGTAGGCTAGTAAAAGCTGTGCATGTAAACCTCACTCCCCGGAACTCAAGAGGTGCTCTAGCAACTGACGCTAGAGACTGCGGCCTCCTTGTTAAAGCGCCCACCTCCCATGCGGACGGGCCCGGGGTTCGTGTCCCGCTTGGAGCGGGCAGGTGCAAACTAGAGGGGCTACATTAGTCATTCCTTATTGGTTTTAGATGAGTCTTTAGTACTTGTCAAGCTGGGAGACAAGTTAAGACTAGCTGGCTGTACCTGATGTAAAAAAAAAAAAAGCTTAAACCAGCCTAAGATGGTTTGTTGGTCTTAGTTTTTAGATTAGTTTTTTAGTACTTGTCCAGCTGACAGACTAACTAAGACCAGAGGAACCATCAAAAGCTGGCTGTGCCTAATAGGGGGAAAAAAAAAAACAGCCTAAGATGATTTTCTCACCTTCGCTGGTTTTCCAGCCATGTCAGGCTGGTCCAGATTGCTGGCTTTAAAGTGGTTTCTGTCATTGGTCAGCTGGGTGACCAAGTTCAGTCAGATAAGTCTGGTTTATGCATTTTTTCTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCAGGGTCTAAGCTGGTGTTTGGCTGGTCAATCAGCTGCTCTCTTAGACTGACTAGTGGACAAGGGCCAAAAAACCCTTTAAAAGACCATCAAAAAAGACAGACTTGACCAGCTTGGTCTGGTTGGGAGACCACCTAGACCTTTTAGGCTGTTTTAAGTGTTTTTCAGTAGTGTTCGAAACAGAACACATTGAGATTTCACCACAACTGGAGTTGAAACCTGAAAAGGACCTGTCAGTTTGCTTCTTCTCCTAACTACACCTCTTCTCTTTGAGAGGAAGGTCAAACTCAGCATTAAAGAGAGCCCTTCTTCAGCGCCCCTGGCTCCTGGTATATCCGCAGCCTCAGTGAACTCTGCTCCTTGCCCCTCCCAGACCTTGCCCTAAAGACTCTGGAAAAAGCACTGCTTTTTTCTGAATCACCAACTCAAGCCCCTCGAAGAAGGCAGCATCTTAAATGGGACAAAGCTTGCTGGAGGGAGAAACTAAAGAGTCATGTTCAAATGAGCCGTCAGAGAGCTTCATGCCGATATTCCCTTTGGTCAGGACGCTGACTACGCCATGCTGAATGAAATACATCTTCTTGCCGATAGTTCCCTCTCGAATGATGTAATCTGCTGGTTGGAAGACCTCGAAGCGGAGCTTGGTTAACATTGCTGTCACAAAGTTGGGATCTGCGTTGGCGAAGAGCGGCATGGACGCCACTAGCTTCCGGCAGTTGAAGTTGACTATTTCCTGGAGGTGTGGAAATTAGTTTACTGTGAGTTTGAAGACAAGTTATCAATAGTGTACTGTTATCTGTTGGTAACTGGTACCTCTCGTAATGGCTCGTTCAGTTCTTCCAAAATGCTTTCCTCATCGAACATCTTGCCCTGGTATCTGTGCTCATAGTAGTCATGGATCTTCTGCCGGAAGTCGGCCGGAAGTTTGTGGAAAGACATGTATTGCTCAACTTGCTTGTACTGAGAAGATAAAATGGACACAGAGTAAGTGTGTTAGCTGACGTCTCAGGACACACTTTTGACCCAAAATTTCCAACCACCAACATTTGTGTTGCCCATCTTAATCCCACATGGCCTCTTTTGTGGAGAAATGCTGACAGGGAACATTATATGCAGATGAAAGTAAACAAGTAAACATCCAGGCTTGCTTTCCTTTATGGGCTTTTCGGCTATTTTAGGAAGCATCAGTGGAAGTTATTTATGGTGGATGTGATAGACTAAAGAGCATATGATAATATGATGTTCTCAAAGCAGGAAGAGTATGATGAAATAGATGATAAGTTCTATTTATAACACAGCATATGTAGTTAACCATCTCTCTGCAGCAGCATCTGTGCTGTCATGCTTTCTGGTTTAAGTTACAGGAATATGCAGTGCATTTATAGTGTTAAATGGTTTTGGCTATGTATGTTGTGTAGAAATTGGATTATATAGAACAACAAATTATAAATGTATGGATGTTTTAAAGCATATCACTGATTCTTATAACACAGAATACAACACAACTTCACCTGACATTGGTTTTTAAATAACTACATTTTTACTTTGAAAATAATAAGGACATTTTTTTTTTCAAATAAGAAAATATTTCATTTTATTAATGTCCACAAATATTTTGTCAACTGTTACTAACCAAACACCCCCCG
>TU180664
GGGTGAGGAGGGCAGGTGGCCTGCCTCTCTTGGCAAATTACGTGTTTATGTGCCGAGGACACAAAGCCAAGAATGGCAAAACAATCGTGTTGAAGACAAACTAATTTTGGAGCCGACTAGAATTTGCCCACAGATGTGACCAATGGATGTCCAAAAAAATGGAATTCTGGGCTATGTACCAGTAACGCCTCTAACACAGGCAACTTACCTATTCGATCAAGGCGGTCGATGGCTACGGTCTCAAACGCTCTCCTCATCATGGGGTACTCCTCCAGTACTTCATTAAAGTTGTCTACGGAGAGCGAGTACAGTCGGCAATAGGTGTCCGCCCGTACGCTGGCGGTTCGTCTTCCACGGGTCAACAGGCAGATCTCTGAGAATGAACAGGACATATCATGGGTCTAAGCTGGTGTTTGGCTGGTCAATCAGCTGCTCTCTTAGACTGACTAGTGGACAAGGGCCAAAAAACCCTTTAAAAGACCATCAAAAAAGACAGACTTGACCAGCTTGGTCTGGTTGGGAGACCACCTAGACCTTTTAGGCTGTTTTAAGTGTTTTTCAGTAGTGTTCGAAACAGAACACATTGAGATTTCACCACAACTGGAGTTGAAACCTGAAAAGGACCTGTCAGTTTGCTTCTTCTCCTAACTACACCTCTTCTCTTTGAGAGGAAGGTCAAACTCAGCATTAAAGAGAGCCCTTCTTCAGCGCCCCTGGCTCCTGGTATATCCGCAGCCTCAGTGAACTCTGCTCCTTGCCCCTCCCAGACCTTGCCCTAAAGACTCTGGAAAAAGCACTGCTTTTTTCTGAATCACCAACTCAAGCCCCTCGAAGAAGGCAGCATCTTAAATGGGACAAAGCTTGCTGGAGGGAGAAACTAAAGAGTCATGTTCAAATGTCAGTGGTATTTATCACTGTATTTGCAGTGCAAGTGAGCTGTTAGGGTTTCAGATGGAGCAGTGATAAGGTGCAATAATGTACGACTGTAAACATTTTTAACATGCTTTCAGTTTTGTTTTATTTTTTAACTCCCTTTTAAAAAGTTTTTTAAGTTTCAGTTTGAACTAAAAACTGAAAGTTGTTTTTTTCATCTTCATAAAAAATCATGAAGGAATGTGAACAGGAGGGTTCATTTTAATTTCTTTGACTATTAAAGCAATGCCTTAAAATTGTAGTATTTTTTTAGTATTTTGTTTTTGAATTTTTTGCATAATTTCCTCTATGGACTTTTATTTTGAAGTTTCATTTTAATAGCTAACAACAATTTAGCCTTGTAAAAACATTTGGCTGTAAGCAATTTATTGCAATATGATTTGAGTTTGATATGATTATTTGGTAATTTCAACATTTACTAATAGATTATTAAAATCAAAAGTTGTATTTGTTAACATTAGTTAATGCACTGTGAACTAACATGAACAAACAATGAATGACTGTATTTTTTAACTAACATTAACAAAGATTAATAAATACTGTAACAAATGTTTTGCTCATTGTTAGTTCATGTTAGTTAATGTTTTATTCTTTGCTAACTTAAGTTACACTGCCTTTGGATATTAAACTTGTAGTTTCAAGTATTTTTTTTTAAGTTCATATGTGGACTTTTATTTTGAAATTGTAATATTTTACAATTGTCAACAGACTTTCCAACACGAAAAGTTAGAAATGTAACCTTACAACAGTTTAGCCTTGGAAAAGCATTTGTCTGTAAGTATTATATTATAATTATATTAATATTATATTAATTCCGAATTAATAAGATGGTCTTTCTGTGTCCTTACCCCCAAAGTAGGAGCCGTCAGAGAGCTTCATGCCGATATTCCCTTTGGTCAGGACGCTGACTACGCCATGCTGAATGAAATACATCTTCTTGCCGATAGTTCCCTCTCGAATGATGTAATCTGCTGGTTGGAAGACCTCGAAGCGGAGCTTGGTTAACATTGCTGTCACAAAGTTGGGATCTGCGTTGGCGAAGAGCGGCATGGACGCCACTAGCTTCCGGCAGTTGAAGTTGACTATTTCCTGGAGGTGTGGAAATTAGTTTACTGTGAGTTTGAAGACAAGTTATCAATAGTGTACTGTTATCTGTTGGTAACTGGTACCTCTCGTAATGGCTCGTTCAGTTCTTCCAAAATGCTTTCCTCATCGAACATCTTGCCCTGGTATCTGTGCTCATAGTAGTCATGGATCTTCTGCCGGAAGTCGGCCGGAAGTTTGTGGAAAGACATGTATTGCTCAACTTGCTTGTACTGAGAAGATAAAATGGACACAGAGTAAGTGTGTTAGCTGACGTCTCAGGACACACTTTTGACCCAAAATTTCCAACCACCAACATTTGTGTTGCCCATCTTAATCCCACATGGCCTCTTTTGTGGAGAAATGCTGACAGGGAACATTATATGCAGATGAAAGTAAACAAGTAAACATCCAGGCTTGCTTTCCTTTATGGGCTTTTCGGCTATTTTAGGAAGCATCAGTGGAAGTTATTTATGGTGGATGTGATAGACTAAAGAGCATATGATAATATGATGTTCTCAAAGCAGGAAGAGTATGATGAAATAGATGATAAGTTCTATTTATAACACAGCATATGTAGTTAACCATCTCTCTGCAGCAGCATCTGTGCTGTCATGCTTTCTGGTTTAAGTTACAGGAATATGCAGTGCATTTATAGTGTTAAATGGTTTTGGCTATGTATGTTGTGTAGAAATTGGATTATATAGAACAACAAATTATAAATGTATGGATGTTTTAAAGCATATCACTGATTCTTATAACACAGAATACAACACAACTTCACCTGACATTGGTTTTTAAATAACTACATTTTTACTTTGAAAATAATAAGGACATTTTTTTTTTCAAATAAGAAAATATTTCATTTTATTAATGTCCACAAATATTTTGTCAACTGTTACTAACCAAACACCCCCCG
>TU180666
GGGTGAGGAGGGCAGGTGGCCTGCCTCTCTTGGCAAATTACGTGTTTATGTGCCGAGGACACAAAGCCAAGAATGGCAAAACAATCGTGTTGAAGACAAACTAATTTTGGAGCCGACTAGAATTTGCCCACAGATGTGACCAATGGATGTCCAAAAAAATGGAATTCTGGGCTATGTACCAGTAACGCCTCTAACACAGGCAACTTACCTATTCGATCAAGGCGGTCGATGGCTACGGTCTCAAACGCTCTCCTCATCATGGGGTACTCCTCCAGTACTTCATTAAAGTTGTCTACGGAGAGCGAGTACAGTCGGCAATAGGTGTCCGCCCGTACGCTGGCGGTTCGTCTTCCACGGGTCAACAGGCAGATCTCTGAGAATGAACAGGACATATCATGGGTCTAAGCTGGTGTTTGGCTGGTCAATCAGCTGCTCTCTTAGACTGACTAGTGGACAAGGGCCAAAAAACCCTTTAAAAGACCATCAAAAAAGACAGACTTGACCAGCTTGGTCTGGTTGGGAGACCACCTAGACCTTTTAGGCTGTTTTAAGTGTTTTTCAGTAGTGTTCGAAACAGGTAATCTAAACATCCATGGAACATAAACTTCAACATAAAAGTCATTAAGTTTTTCAGTCTTTTTTCTCTTTATTCTTGAAAGAACACATTGAGATTTCACCACAACTGGAGTTGAAACCTGAAAAGGACCTGTCAGTTTGCTTCTTCTCCTAACTACACCTCTTCTCTTTGAGAGGAAGGTCAAACTCAGCATTAAAGAGAGGTAAGATCCAGTCACTGACTGAAGGGGCTCTATCTACACAGACACACACACATTCAAAAGGATGCTCAGCATTTGGAATCTACCCAGTTGAAAATGTGGCTACACTTCAAAGTGAATGTTGGCACAGCTCACTCTAATTGAAGTTGCTGTGCCCCTCATCCCTGTAGAGTGGATAAAACTCCAATGAGGGATTCAAGTGGAAGTTGCCTGTCATAAAAAATCAATAAAGCTTTAATTCAGGGTAACATCTGCATCTTAATAAGGGCCTTTGAGATAAAGACTTAACCTTAAAAAACATTTGTTTAATTGATAATATTGAATATTTAGTTAAATTTGATTGTTAAATGTTGATTAGTTAAATACAACAGGACGATGCTGTGATAGTTGGGCTATGCAAACACTGTGTTGGACGGCCATTAATATTAACAGACTGGACAAAACAAATGGGGCTTTTATAGCACCCTAACTTTTAGGCAAATGTATGTTTTGTGTTGCTTTTATGATTATTTATTTATTTATTTATTAGTTTAACTTTTACATATACAGACATATGCCTGCAAAAATCTCCTTCTCAATCAGTATTCTTCTTCAGTAAAAACAATCAAATGAAATACATTTACTTGAAGCTAAATTGCATAAAATAATGGGTTTTTAGAGAATATACACTGCTCAAAAAAATTAAAGGAACACTTTTTAATCAGAGAATAGCAGAGGGGGTTGTTAATCAGTTTCATCTGCTTTGGCGTTAATGAAATTAACAACACGTGCACTAGATGGGCAACAATGAGATGACCCCCAAAACAGAAATGGTTTTACAGGTGGAGGCCACTGACATTTTTTCCCTACTCATCTTTTCTGACTGTTTTTCACTAGTTTTGCATTTGGCTAGGGTCAGTGTCACTACTGGTAGCATGAGGACCCTACAGAGGTTGCACAGGCAGTCCAACTCCTCCAGGATGGCACATCAATGTGTGCCATTGCCAGAAGGTTTGCTGTGTCTCCCAACACAGCCTCAAGAGCATGGAGGTGATTCCAGGAGACAGGCAGTTACTCTAGGAGAGCTGGACAGGGCTGTAGAAGGCCCTTAACTCATCAGCAGGACTGGTATCTGCTCCATTGTGAAAGGAGGAACTGCCAGAGCCCTACAAAATGACCTCCAGCAGGCCACTGGTGTGAATGTCTCTGACCAAACAATCAGAAACAGACTTAATGAGGGTGGCCTGAGGGCCTGAGTGCTCACTGCCCGGCACCGTGGAGCTCGATTGGCATTTGCCATTGAACACCAGAATTGGCAGGTCCGCCACTGGCGCCCTGTGCTTTTCACATATGAGAGCACGTGACAAACGTGAAAGGGTCTGGAGAAGCCATAGAGAACGTTATGCATGACCAGCTTGGTGGTGGGTCAGTGGTCTGGGGAGGCATATTTGCAATTGTTTTTAAG
>TU180662
GGGTGAGGAGGGCAGGTGGCCTGCCTCTCTTGGCAAATTACGTGTTTATGTGCCGAGGACACAAAGCCAAGAATGGCAAAACAATCGTGTTGAAGACAAACTAATTTTGGAGCCGACTAGAATTTGCCCACAGATGTGACCAATGGATGTCCAAAAAAATGGAATTCTGGGCTATGTACCAGTAACGCCTCTAACACAGGCAACTTACCTATTCGATCAAGGCGGTCGATGGCTACGGTCTCAAACGCTCTCCTCATCATGGGGTACTCCTCCAGTACTTCATTAAAGTTGTCTACGGAGAGCGAGTACAGTCGGCAATAGGTGTCCGCCCGTACGCTGGCGGTTCGTCTTCCACGGGTCAACAGGCAGATCTCTGAGAATGAACAGGACATATCATGGTTATGGTTCCAGAATCTTCTGTATCTTAGTGTAACAGACGTAGGCTACTAAGAGCTGTGCATGTAAACCTCACTCCCCTGAACTCAAGAGGTGCTCTAGCGACTGACTGTGGTCTTTAGCCTCCTTGTCAGAGCACCCACCTCCCATGCGGACGGGCCCGGGTTTGTGTCCCGCTTGGAGCAGGCAGGTGCGAACTAGAGGGGCTACATTGGTGCCGTGACCCGGATGGGAGTGAGGCTTAGGGGAGTGAGTGTAACAGACGTAGGCTAGTAAGAGCTGTGCATGTAAACCTCACTCCCCTGAACTCAAGAGGTGCTCTAGCAACTGACGCTAGAGACTGCGGTCTTTAGCCTCCTTGTTGGAGCGCCCACCTCCCATGCAGACGGGCCGGGGTTCGTGTCCCGCTTGGAGCAGGCAGGTGCGAACTAGAGGGGCTACATTGGTGCCGTGACCAGATGGGAGTGAGGCTTAGGGGGGTGAGTGTAACAGATGTAGGCTAGTAAAAGCTGTGCATGTAAACCTCACTCCCCGGAACTCAAGAGGTGCTCTAGCAACTGACGCTAGAGACTGCGGCCTCCTTGTTAAAGCGCCCACCTCCCATGCGGACGGGCCCGGGGTTCGTGTCCCGCTTGGAGCGGGCAGGTGCAAACTAGAGGGG

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU180663 False 2881 lncRNA 0.44 6 2944462 2951345
TU180664 False 2935 lncRNA 0.38 5 2944462 2951345
TU180666 False 2220 lncRNA 0.43 3 2947950 2951345
TU180662 True 1057 lncRNA 0.54 2 2950185 2951345

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000030_02824217_02832330 ATP5D coding downstream 111250 2823974 ~ 2833212 (-)
CI01000030_02785349_02803666 MIDN coding downstream 140796 2783629 ~ 2803666 (-)
CI01000030_02690496_02691051 NA coding downstream 252975 2690496 ~ 2691487 (-)
CI01000030_02688886_02690562 NA coding downstream 253900 2688478 ~ 2690562 (-)
CI01000030_02653346_02655442 NA coding downstream 288147 2653247 ~ 2656315 (-)
CI01000030_02978356_03013342 POLRMT coding upstream 26429 2977774 ~ 3013507 (-)
CI01000030_03213584_03216600 C10H19ORF70 coding upstream 261766 3213111 ~ 3216600 (-)
CI01000030_03273527_03314595 CELF5, CELF5A coding upstream 322182 3273527 ~ 3314595 (-)
CI01000030_03491770_03493119 CELF5A coding upstream 538774 3490119 ~ 3493741 (-)
CI01000030_03545674_03546876 RXFP3.2B coding upstream 593797 3545142 ~ 3547053 (-)
G159124 NA non-coding downstream 17302 2926892 ~ 2927160 (-)
G159123 NA non-coding downstream 17623 2926495 ~ 2926839 (-)
G159122 NA non-coding downstream 20987 2923197 ~ 2923475 (-)
G159112 NA non-coding downstream 66623 2877590 ~ 2877839 (-)
G159106 NA non-coding downstream 78211 2865602 ~ 2866251 (-)
G159152 NA non-coding upstream 110096 3061441 ~ 3108585 (-)
G159183 NA non-coding upstream 159526 3110871 ~ 3115373 (-)
G159196 NA non-coding upstream 184139 3135484 ~ 3135802 (-)
G159202 NA non-coding upstream 197991 3149336 ~ 3149550 (-)
G159218 NA non-coding upstream 269056 3220401 ~ 3220996 (-)
G158980 NA other downstream 411898 2499584 ~ 2536375 (-)
G158914 NA other downstream 492744 2450849 ~ 2451718 (-)
CI01000030_02155901_02157314 NA other downstream 785171 2155584 ~ 2157390 (-)
G158780 NA other downstream 1022331 1920258 ~ 1922131 (-)
G160213 NA other upstream 515008 3466353 ~ 3469162 (-)
G160713 NA other upstream 2467774 5419119 ~ 5423513 (-)
G160712 NA other upstream 2505615 5456960 ~ 5512074 (-)
G160949 NA other upstream 2845952 5797297 ~ 5800426 (-)

Expression


Co-expression Network