G174319


Basic Information

Item Value
gene id G174319
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000036
NCBI id null
chromosome length 2115676
location 1653986 ~ 1663487 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU197973
TGTAAAAATGTAAATTTCTTTACTGTAAATTTTGATCAGTTTAATGCATCCTTTCTGAATAAAAGTACTAATAAAACAAATAAAAATATTTAACTGACCCCAAGCTTTTGAACAAATGCTAATTAACTTATAATATTCAACAATATTTGAAATCTGCTGGTTAGATCATTTCCGATCGCTTCCCCATAATTACGTCTTCTCATTCTGTGATGGCTATCATCTGGACTTTAGAGAGGAGAAAACCACCAGCCTTTCATGTGGTATCCATGGCGATTATTGACATTTAAAGCCCTGTTTCAAAGCTTTAATAAACACCTAAGCAGATAACAAAGCGATCTATGTTGAGGTTCGGTTCAGAAAACCAGTTGACTTACGACTCGTCGTCGGTGCCTGTCATGCGTTTAAAGCCTGTGGTGTTTCACTTCATATATTGCACGTGCACACGATCACAGCAATTTCACGCCTTCTGCCCCTGAGCTCTGGTGTGAGACTGCTTGTCTTGCGGTGTGCTTGGAGAGATGAAAGTTTTACAAACAAATGTACACACACAGCCAAATAAGAGAGTGCTGTGACAAGCTTTCAGCCATAAACTCCATAGCATTTGAAATCGGGTTGAAAAGTACAGCTGTTATTGCGTTATAGTCCGTTTTTTATTATATCACACAGGTTGAGAGACAGTGTGAAAAATAAGTTTTAATATGTGCATATTTCACACCGCAGAGGCATACGTTGCATCAGACAGGTCTCTCTGATTTGGGACACAGAAATACTGCAGGATCTCTCTCAGCCTCTGAGGCTGACCAAAGGATGGTGTATGTGTGTGTACACACGCTATCCCATAATCCCCCTCTCCCTCCTGATGGCATTCTGGGACAGTCCCCAAAGCAACCCTTGAATGACCCCTGTAATCTCTCCTTTTTAATGACATCACCAAACTTTCTTCTCAAGCATTTTTATTGTAGACAGTGCTGTCAGCACCGGTCCAATAATCAATATCACACATACAAGCGGGGCTTTAAATCTGAAGATAGATGTATCTGAGAGCCAAAAAAGTAAGATTGAGTATCTGTATTTGTGAGTGAGATGCTCACCGTGCCAGAAGAGACTGATGACAACAACAAACCCTCGTATGTTTCAGCTCTGACCATTAATTCAGCATCTTGTCGACATGCGTTATTCACCTAATGCAAATAGAGCATCTGACTGACAAACAGATGCCTTAAAAGTGCCCGTTTGACACATTAGAGCGAGAGGCTTCTTTATTTTGCGTAACACCCTCAATTAGTTCTTTCTTTAGCTTTACACAAAAGGTTCTGAAGATCACATAGAGCTTCAAATGCTCTAAACCTGCCGGTGATTTGTAAGGCTAGTTCCTCTGTACCTTCATTAGAATTCTCCCATAGAAAAAGCATTGATTTTTTTAGTCTGGCAGCCTAGCAGATCCTCAGAATTTATCTTCCTCTGGCCTCTCATTTAATCTCTGCTTGAAACAACAGCAGCGGTAATGGCAGTGGAAGGATCCCGGGGAATGTGCATGGTCAGCGTGAAGAGAGATAGAGTTGGTGCTGGCTGTGTAAATTAAAGCAGCGGAGCTCAAAGAGACAGTTTTATGGAGCAGGTCCCTGTGTGTGAGAGAAAGTATCTGTGTTTGTGTGTTTCGATTTCTGCGTGCGGGGTTTCTGTGTGTGTGGTGCTGCGGTTGAGAGCGTAAATGTCATTTCAAACACTTATCCTCTTTATTAGAATGTTTCCACCTGTGTGAAAACATTATCTCCGTTATAACTTCCCATTTTCTCTTCTATTCTCGATGAATAGCGAATTTGACCCCGTTTCTATACCTACAGCCTCTTTCACCTTAATACATATTCAGTACTGATTTGAAATGCATTTTTAGGTCCTGCAACTCTCAATATCCAGCTCATGAATTGACTTCACCGCAGTGCTGGGTTTGCAAGAGCAGACCACCTTGAGATTGCTTTAATGGGATAGCTCATTTACTCACCCTTGTTTTGTTCTAAACTCAAATGACTTTATTTTGTGTAACACAATTTTTGTTTAATATTCAATATTTTGAGGATTGTTCCAGCTGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCATATTATGAAAGTCAAAGGGGTCCAAAACTTTCTCAAAAAAAAGGACATGAAGGTAACGTAAAATTAAGTCTTCTGAGGCAACACAATCGTATACTGCTAGAACAAAATGTGCAAAAATTATACCTTTAGGGGTACAACAGCTTGTCACTGGGGAAGAACCATTTAAGGGACAAATTGTACCTTATCTGTCCTTAAACTGTATATTAGTGTCTTAGATTAGTAATGTGAATCCTTAAGGTATACTATGAACCTTTTAGGGGTAGATAAGGTACAAAAGTATCCCTTTAAGTGTAAAGCTGTTGTACAACTAAAGGTAGAATTTTTGCACATTTTTTCTTATGGCTCATTTCCACTGAGTGGTACGGTTTGGTTCAGTTCAGCACAGTACAGTACGATTTGAGATGGTAAACCCTGATCCGGCTTGCGTTTCCACCGCCAACAGTACACTTACTTGATAGGCGTGGTGTATGCCGGAAAGTAGCAATCAACGTCATTATCGCGTGAAGAAGAAAGTGACAGTAAACAACATTGGAGGACATACAGCAGCTTTGTTTGACCAAAGGCTGAAGGCTGCAAGGAAAAACAGCTGAAAAATACATATTGTGTTGCAACGGTATTGTGTTGTCATTCTCCTTATAGCACGCATAAGTGACGATTCTCTGTCAACCAATCAATGTTCTGCAGTGAGTGTAGCTCCACCCTTTTGGTACCGATACTATTGGTACTATTGTGCTAGGTACCCTAAGTGCTACGGTATACGGTTTGGTATTTTGGTACCATTCACAACTTCTGACAATGGAAACGGAAATAATTGCTTACCATACTGTACTGAACCGTACCACTCTGTGGAAACGAGCCATTAGAGTGTATGATAGATTTAATTTAGGTATTTATTCACTCTCAAATTAAATAAAAACATTGATCAATGCATAAATACACAGACTATATTAAATATGACATTAATCATTGTTTTGATTTGATTTGAGAGGCTTACATTTTAAACTGTTCATGACACAAAGGAAGCATACTGCTGTGAGCATCCAGAAAGGTTGGAATATACCAGTCAAGTCATATGGATCAAATTCACTATGTCCCTTTTGGAGCTTGAAATGTTCAAACCTCACTAACTTTCATTGTATGTACAAAAACAGTTGTTCAAAATATCTCCTTTTGTTGTTTCGGAGAAGTCATGTAGGTCTGGAACAACATGAGGTTAAGAAACTATCCTTCAACTATCCTTTTAATACATATTCAAAACTGATTTAAAATGCATTCTTGGTTTTTGCAACACTCCGTATCCAGCTCATAAATTGAGTGCTTTACCGCAGTGCTGGGTTTGAAAGTGCAGACCACCTTGAGATGTTTTGGGATACATTTAATACATTGTTTTAGTTTCCTTGCTGCAGTGTTTATCTGTGTAGTGGCTCTGCTCAAAAGCTCCGGTGCACTTGTAGAGTGGTGGACTAAAATTACATGAAGGGGAGGGGGTAGGCTAGGACCCAGGGGAGGGGTCGGGTTCGGCTCAGGGCCTGGGCAGGTGCCAGGAGTTGGCTTATGTTCTCGCAGTATCAGCAGAGAGCTCCGACTCGCAGAAGGTAAAAGCATTTCTGCGACCCCAAAGACTTTCTTCGCAGTTATCCCACACCCGCTTCATTAAAAGAAGACTGCTGGGATGCAGGAGAATGTACGTTCCCAGCAGTATGATGGCTGTCATTGTCTACATAATGAGTAGCTTTGCAGGGCATCTTTGTGTGTTTTATAAAGTCTTTGCTGGAGGCTGTATCTTTGTTGGACTACCCACGCAGCTAGCCTCCCTCTCCACCCACTCCCCTCCTCTCATCTGTCAGAGTAGTGCCCACATATCAGGCCACTTTCTTGTTTAATGAAATTCATTAGCCAGAGCATCTTAAAAGCTGGAAGACTAATTAAGCTTCTTTTTGAAATGCATGACAGAGGGAACATGTATTGGGATTCTACATCGCTGCCAGAGGCATGATTCCCTGCACTATAGTAGTCAACAACAGACCCTAGTGAGACGAAAGGGTCGTTTTTGCAAACAAAAGGAAACAAAACATTGTTTTATCTATATTATTAAGCAAACAATTATTGACTTGGAAGCTTTGAAGGGATTTTCACCTCTTCATTGCGGTCCAGAGGCATTGTGTCGGCCATTGTGCTTGCACAATGCTTTTGTAAATATTGGCGCGTTCGCCTGAATACTGTGCTCCCGTGGTCTTGCTTTAAATGGCACAATGACTACAGCTGTCACCGCAAAGCGGGGCGATGTTCGCCCTCACATTGCTTGCTCACTATCCAGCCTCGATTGTTTGCCTCAAAATAACCTAAGCACAAGTTGCTGCAGTTTAATGGAGACGTGCAATCTTTCAGTATCTTGCTGTGTGGTGTGTACAAGCTCTTCGATTGCCCAAATTTATCTCAGGTTCAGGGGCACTTAAGGGTCCTATTTGTGAGGTTCAGATAGCATCTCCTCGCCGCCGTAGAGGTGTATCTGCAGTGTGCATTTATAAGCCTGATATCTCCGTGTTTAATTATTAATGTGTGGTCAGTGTTTCTCTAGCACTTACAGCCGTCCCCTGTAAAAGCAGATTTGATTTGCCATTCTGGATTGCCCCAATCAGAAGCTCGGGGAGCCGATCATGCACCGACTCTGACATATGCGATGTGGAGCTAATGTTAGAACTGTTCTGGCGCCTGTCCAGGTAGCGCTTGGTTATTGTATTGGGCTGAGTGCGCTCGTCGCTAATGCAATTTATCTTTGAAGAGCAGTAGTAATAAACAGAGGCATTGAGGCTATGAACTGACTTAAAACCCACGCACATAAAAATAGAGCTGGGGTAATAAAGGGGCCAGTTGAACAGGTTGTGGTATT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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU197973 True 9502 lncRNA 0.39 1 1653986 1663487

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000036_01611248_01620780 ZNF804A coding downstream 32597 1611119 ~ 1621389 (-)
CI01000036_01475403_01476425 NA coding downstream 177295 1475403 ~ 1476691 (-)
CI01000036_01466321_01474630 NA coding downstream 179356 1465479 ~ 1474630 (-)
CI01000036_01428324_01454913 ITGAV coding downstream 198201 1428287 ~ 1455785 (-)
CI01000036_01417031_01422737 UMPS coding downstream 231249 1416887 ~ 1422737 (-)
CI01000036_01763171_01765280 NA coding upstream 98988 1762475 ~ 1765385 (-)
CI01000036_01782319_01786637 NUP35 coding upstream 118474 1781961 ~ 1786637 (-)
CI01000036_01839255_01848818 CUNH3ORF70 coding upstream 173662 1837149 ~ 1848818 (-)
CI01000036_01850532_01860056 EHHADH coding upstream 186974 1850461 ~ 1860056 (-)
CI01000036_02022324_02026053 NA coding upstream 358460 2021947 ~ 2031983 (-)
G174318 NA non-coding downstream 13848 1628159 ~ 1640138 (-)
G174357 NA non-coding downstream 51101 1602531 ~ 1602885 (-)
G174121 NA non-coding downstream 98367 1555342 ~ 1555619 (-)
G174102 NA non-coding downstream 136566 1517051 ~ 1517420 (-)
G174100 NA non-coding downstream 137829 1515908 ~ 1516157 (-)
G174320 NA non-coding upstream 715 1664202 ~ 1666700 (-)
G174363 NA non-coding upstream 13101 1676588 ~ 1676958 (-)
G174365 NA non-coding upstream 46386 1709873 ~ 1710209 (-)
G174366 NA non-coding upstream 58664 1722151 ~ 1722529 (-)
G174388 NA non-coding upstream 200270 1863757 ~ 1864342 (-)
G174002 NA other downstream 378791 1274778 ~ 1275195 (-)
G173528 NA other downstream 693609 959421 ~ 960377 (-)
G174386 NA other upstream 201447 1864934 ~ 2010840 (-)

Expression


Co-expression Network