XLOC_009444 (CR944667.3)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_009444
gene name CR944667.3
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007126.7
NCBI id CM002899.2
chromosome length 48040578
location 37876716 ~ 37880887 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00018553
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>TCONS_00018552
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Function

GO:

id name namespace
GO:0044459 obsolete plasma membrane part cellular_component
GO:0005886 plasma membrane cellular_component
GO:0071944 cell periphery cellular_component

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000117685

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00018553 False 2679 lncRNA 0.34 3 37876716 37880887
TCONS_00018552 True 3116 lncRNA 0.33 2 37876716 37880887

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_009443 si:dkey-238d18.4 coding downstream 1115 37854483 ~ 37875601 (-)
XLOC_009442 si:dkey-238d18.3 coding downstream 25747 37831604 ~ 37850969 (-)
XLOC_009441 ctrl coding downstream 47556 37820258 ~ 37829160 (-)
XLOC_009440 si:dkey-42l23.1 coding downstream 69693 37806111 ~ 37807023 (-)
XLOC_009439 si:dkey-42l23.2 coding downstream 77220 37795286 ~ 37799496 (-)
XLOC_009445 si:dkey-238d18.5 coding upstream 10158 37891045 ~ 37921998 (-)
XLOC_009446 si:dkey-238d18.15 coding upstream 47062 37927949 ~ 37929135 (-)
XLOC_009447 si:dkey-238d18.6 coding upstream 127615 38008502 ~ 38009344 (-)
XLOC_009448 si:dkey-24p1.1 coding upstream 220248 38101135 ~ 38129845 (-)
XLOC_009449 irgq2 coding upstream 269578 38150465 ~ 38154616 (-)
XLOC_009432 CR848836.1 non-coding downstream 147550 37727834 ~ 37729166 (-)
XLOC_009422 CR848749.2 non-coding downstream 612451 37259354 ~ 37264265 (-)
XLOC_009420 AL953844.1 non-coding downstream 1002350 36874251 ~ 36874366 (-)
XLOC_009419 NA non-coding downstream 1091943 36784479 ~ 36784773 (-)
XLOC_009416 NA non-coding downstream 1373527 36500206 ~ 36503189 (-)
XLOC_009453 NA non-coding upstream 415270 38296157 ~ 38297734 (-)
XLOC_009455 NA non-coding upstream 544661 38425548 ~ 38425845 (-)
XLOC_009456 NA non-coding upstream 666940 38547827 ~ 38550804 (-)
XLOC_009457 NA non-coding upstream 1021046 38901933 ~ 38910271 (-)
XLOC_009458 NA non-coding upstream 1067536 38948423 ~ 38952429 (-)

Expression


Co-expression Network