Fish Transcriptome and Expression Database

RNA id: TCONS_00013759

Basic Information

Item	Value
RNA id	TCONS_00013759
length	79177
lncRNA type	inter_gene
GC content	0.35
exon number	1
gene id	XLOC_006468
representative	True

Chromosome Information

Item	Value
chromosome id	NC_007124.7
NCBI id	CM002897.2
chromosome length	52186027
location	10150919 ~ 10232078 (-)
genome version	GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species	zebrafish (Danio rerio)

Sequence

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Function

GO:

id	name	namespace
GO:0051301	cell division	biological_process
GO:0010564	regulation of cell cycle process	biological_process

KEGG:

id	description
ko03230	Viral genome structure
ko05164	Influenza A
ko03200	Viral proteins

JBrowse2

Notice the +/- strand.
Display format: symbol/gene id: RNA id. (Except when gene id is similar to RNA id.)
You can browse transcripts by dragging.
A more detailed transcript can be viewed by the zoom button in the upper right corner.

Neighbor

RNA id	RNA type	direction	distance	location	representative	gene id
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TCONS_00012551	lncRNA	upstream	55736	10287702 ~ 10346249 (-)	False	XLOC_006472
TCONS_00013761	lncRNA	upstream	99136	10331102 ~ 10346890 (-)	False	XLOC_006472
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TCONS_00012548	other	downstream	33855	10097851 ~ 10118935 (-)	False	XLOC_006467
TCONS_00012547	other	downstream	37910	10080027 ~ 10114880 (-)	False	XLOC_006467
TCONS_00012530	other	downstream	710458	9440328 ~ 9442332 (-)	True	XLOC_006454
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gene	XLOC_000007 f7
RNA	TCONS_00000019
bioproject	PRJEB12982

model fish

Basic

Function

Jbrowse2

Neighbor

Expression

RNA id: TCONS_00013759

Basic Information

Chromosome Information

Sequence

Function

GO:

KEGG:

JBrowse2

Neighbor

Expression Profile

copyright 2021-present@Lab of Aquatic Bioinfomatics, Institute of Hydrobiology, Chinese Academy of Sciences