RNA id: TCONS_00016936



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00016936
length 441
RNA type mRNA
GC content 0.41
exon number 3
gene id XLOC_008460
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007126.7
NCBI id CM002899.2
chromosome length 48040578
location 21202820 ~ 21204471 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


CACCGAGATCATGGCTCTGATTGTTAGCTGTTGTTTAAAAGGGTTCTTCCTGATCTTTATCCTCTTCCTCTGtgtcaatggaaataaaacaagaccAATCTTCATGGTGACCTTTCCTGCCGTGATTGAGTCAGGATCTGATGCCAAACTGTGTGCAAGTCTTCTAAAGCCCAACAAAACCCTCTTCATGAACATTTATCTAGTTCATAGTAACCAGAGCACATTATTGCTGCAGGAGAAAGCTGAGCAAGAGTTTCACCGCTGTTTTAACTTTCAGGCTCCTCTAGCAGAAGCAGAATCAGTGCAGAAAATCAAGGTTGAACTTCAAGGAGAGTCCTTCAACATGACTGAAGAGAGAAAAGTCATGTTCAAATCATACCATCCTCTGACTTTTATTCAGATGGATAAACCCTTCTATATTGCTGGACAGACTGGTAAGTT

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000154036

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00018772 lncRNA upstream 38247 21164035 ~ 21164573 (+) True XLOC_008457
TCONS_00018926 lncRNA upstream 109204 21004733 ~ 21093616 (+) True XLOC_008455
TCONS_00018927 lncRNA upstream 165042 21017649 ~ 21037778 (+) True XLOC_008456
TCONS_00016933 lncRNA upstream 301465 20897103 ~ 20901355 (+) True XLOC_008454
TCONS_00016932 lncRNA upstream 310077 20891319 ~ 20892743 (+) True XLOC_008453
TCONS_00018773 lncRNA downstream 35953 21240424 ~ 21245834 (+) True XLOC_008461
TCONS_00018928 lncRNA downstream 43055 21247526 ~ 21251557 (+) False XLOC_008462
TCONS_00018929 lncRNA downstream 44995 21249466 ~ 21251557 (+) True XLOC_008462
TCONS_00016950 lncRNA downstream 64752 21269223 ~ 21272557 (+) True XLOC_008465
TCONS_00018930 lncRNA downstream 118575 21323046 ~ 21427967 (+) False XLOC_008467
TCONS_00016930 mRNA upstream 308044 20843161 ~ 20894776 (+) False XLOC_008453
TCONS_00016929 mRNA upstream 393696 20801253 ~ 20809124 (+) True XLOC_008452
TCONS_00016928 mRNA upstream 396625 20799943 ~ 20806195 (+) False XLOC_008452
TCONS_00016926 mRNA upstream 559273 20548212 ~ 20643547 (+) False XLOC_008451
TCONS_00016938 mRNA downstream 48061 21252532 ~ 21262567 (+) False XLOC_008464
TCONS_00016939 mRNA downstream 48087 21252558 ~ 21261192 (+) False XLOC_008464
TCONS_00016940 mRNA downstream 48108 21252579 ~ 21258324 (+) False XLOC_008464
TCONS_00016941 mRNA downstream 48108 21252579 ~ 21258577 (+) False XLOC_008464
TCONS_00016943 mRNA downstream 48110 21252581 ~ 21254912 (+) False XLOC_008464
TCONS_00016935 other upstream 4534 21180094 ~ 21198286 (+) True XLOC_008459
TCONS_00016934 other upstream 25771 21167142 ~ 21177049 (+) True XLOC_008458
TCONS_00016921 other upstream 667336 20529280 ~ 20535484 (+) False XLOC_008450
TCONS_00016911 other upstream 840848 20355795 ~ 20361972 (+) True XLOC_008446
TCONS_00016899 other upstream 1204045 19990123 ~ 19998775 (+) False XLOC_008443
TCONS_00016937 other downstream 47720 21252191 ~ 21252282 (+) True XLOC_008463
TCONS_00016942 other downstream 48108 21252579 ~ 21261192 (+) False XLOC_008464
TCONS_00016953 other downstream 233162 21437633 ~ 21437728 (+) True XLOC_008468
TCONS_00016954 other downstream 233405 21437876 ~ 21437959 (+) True XLOC_008469
TCONS_00016955 other downstream 243185 21447656 ~ 21447800 (+) True XLOC_008467

Expression Profile


//