RNA id: TCONS_00016937


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00016937
length 92
RNA type misc_RNA
GC content 0.51
exon number 1
gene id XLOC_008463
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007126.7
NCBI id CM002899.2
chromosome length 48040578
location 21252191 ~ 21252282 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

ACGCTGGTTAGCTCAGTGGTTACTTCCGAAAATCTTACTGTTGATTTCTCTCCCGTCATGGGATCGAACCACGGGCACCGTCCAGCGTTTTC

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000119489

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00018928 lncRNA upstream 634 21247526 ~ 21251557 (+) False XLOC_008462
TCONS_00018929 lncRNA upstream 634 21249466 ~ 21251557 (+) True XLOC_008462
TCONS_00018773 lncRNA upstream 6357 21240424 ~ 21245834 (+) True XLOC_008461
TCONS_00018772 lncRNA upstream 87618 21164035 ~ 21164573 (+) True XLOC_008457
TCONS_00018926 lncRNA upstream 158575 21004733 ~ 21093616 (+) True XLOC_008455
TCONS_00016950 lncRNA downstream 16941 21269223 ~ 21272557 (+) True XLOC_008465
TCONS_00018930 lncRNA downstream 70764 21323046 ~ 21427967 (+) False XLOC_008467
TCONS_00018931 lncRNA downstream 70774 21323056 ~ 21495896 (+) False XLOC_008467
TCONS_00018932 lncRNA downstream 70779 21323061 ~ 21390208 (+) False XLOC_008467
TCONS_00018933 lncRNA downstream 70795 21323077 ~ 21390208 (+) False XLOC_008467
TCONS_00016936 mRNA upstream 47720 21202820 ~ 21204471 (+) True XLOC_008460
TCONS_00016930 mRNA upstream 357415 20843161 ~ 20894776 (+) False XLOC_008453
TCONS_00016929 mRNA upstream 443067 20801253 ~ 20809124 (+) True XLOC_008452
TCONS_00016928 mRNA upstream 445996 20799943 ~ 20806195 (+) False XLOC_008452
TCONS_00016925 mRNA upstream 608644 20548212 ~ 20643547 (+) False XLOC_008451
TCONS_00016938 mRNA downstream 250 21252532 ~ 21262567 (+) False XLOC_008464
TCONS_00016939 mRNA downstream 276 21252558 ~ 21261192 (+) False XLOC_008464
TCONS_00016940 mRNA downstream 297 21252579 ~ 21258324 (+) False XLOC_008464
TCONS_00016941 mRNA downstream 297 21252579 ~ 21258577 (+) False XLOC_008464
TCONS_00016943 mRNA downstream 299 21252581 ~ 21254912 (+) False XLOC_008464
TCONS_00016935 other upstream 53905 21180094 ~ 21198286 (+) True XLOC_008459
TCONS_00016934 other upstream 75142 21167142 ~ 21177049 (+) True XLOC_008458
TCONS_00016921 other upstream 716707 20529280 ~ 20535484 (+) False XLOC_008450
TCONS_00016911 other upstream 890219 20355795 ~ 20361972 (+) True XLOC_008446
TCONS_00016899 other upstream 1253416 19990123 ~ 19998775 (+) False XLOC_008443
TCONS_00016942 other downstream 297 21252579 ~ 21261192 (+) False XLOC_008464
TCONS_00016953 other downstream 185351 21437633 ~ 21437728 (+) True XLOC_008468
TCONS_00016954 other downstream 185594 21437876 ~ 21437959 (+) True XLOC_008469
TCONS_00016955 other downstream 195374 21447656 ~ 21447800 (+) True XLOC_008467
TCONS_00016960 other downstream 459378 21711660 ~ 21715665 (+) False XLOC_008472

Expression Profile

//