RNA id: TCONS_00023731


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00023731
length 120
RNA type rRNA
GC content 0.55
exon number 1
gene id XLOC_012025
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007128.7
NCBI id CM002901.2
chromosome length 53461100
location 18350726 ~ 18350845 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GCTTGCCGACAGCTAGCTCTCTGataactctcacatggtcgccgactgaagccaagcagggctgcgcctggtcagtacttggatgggagaacACACAGGAAAGCTAAGTTACTGCAggag

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000118673

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00024876 lncRNA downstream 168168 18148782 ~ 18182558 (-) True XLOC_012023
TCONS_00024875 lncRNA downstream 320469 18025736 ~ 18030257 (-) True XLOC_012022
TCONS_00023720 lncRNA downstream 1080026 17268622 ~ 17270700 (-) False XLOC_012016
TCONS_00023718 lncRNA downstream 1084847 17257310 ~ 17265879 (-) False XLOC_012016
TCONS_00024873 lncRNA downstream 1609470 16733316 ~ 16741256 (-) True XLOC_012013
TCONS_00023732 lncRNA upstream 423116 18773961 ~ 18774494 (-) False XLOC_012026
TCONS_00024877 lncRNA upstream 667168 19018013 ~ 19019635 (-) True XLOC_012029
TCONS_00024878 lncRNA upstream 879889 19230734 ~ 19245642 (-) False XLOC_012030
TCONS_00024879 lncRNA upstream 879889 19230734 ~ 19398185 (-) False XLOC_012030
TCONS_00023740 lncRNA upstream 998468 19349313 ~ 19360252 (-) False XLOC_012030
TCONS_00023729 mRNA downstream 402139 17939095 ~ 17948587 (-) True XLOC_012021
TCONS_00023726 mRNA downstream 585925 17763167 ~ 17764801 (-) True XLOC_012018
TCONS_00023724 mRNA downstream 591506 17492195 ~ 17759220 (-) False XLOC_012017
TCONS_00023725 mRNA downstream 591588 17746555 ~ 17759138 (-) True XLOC_012017
TCONS_00023723 mRNA downstream 594382 17491226 ~ 17756344 (-) False XLOC_012017
TCONS_00023733 mRNA upstream 423116 18773961 ~ 18797245 (-) True XLOC_012026
TCONS_00023734 mRNA upstream 527073 18877918 ~ 18888959 (-) True XLOC_012027
TCONS_00023735 mRNA upstream 538792 18889637 ~ 18898115 (-) True XLOC_012028
TCONS_00023736 mRNA upstream 666549 19017394 ~ 19022990 (-) False XLOC_012029
TCONS_00023737 mRNA upstream 666802 19017647 ~ 19019635 (-) False XLOC_012029
TCONS_00023730 other downstream 66663 18283949 ~ 18284063 (-) True XLOC_012024
TCONS_00023728 other downstream 471017 17879594 ~ 17879709 (-) True XLOC_012020
TCONS_00023727 other downstream 571643 17778968 ~ 17779083 (-) True XLOC_012019
TCONS_00023722 other downstream 902824 17444375 ~ 17447902 (-) True XLOC_012016
TCONS_00023716 other downstream 1384917 16906523 ~ 16965809 (-) False XLOC_012015
TCONS_00023750 other upstream 1549909 19900754 ~ 19900857 (-) True XLOC_012037
TCONS_00023754 other upstream 1771181 20122026 ~ 20143916 (-) True XLOC_012040
TCONS_00023774 other upstream 2309026 20659871 ~ 20665926 (-) True XLOC_012050
TCONS_00023778 other upstream 2352334 20703179 ~ 20703297 (-) True XLOC_012054
TCONS_00023786 other upstream 2615990 20966835 ~ 20978952 (-) True XLOC_012057