RNA id: TCONS_00028862



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00028862
length 17
RNA type pseudogene
GC content 0.24
exon number 1
gene id XLOC_014600
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007130.7
NCBI id CM002903.2
chromosome length 48449771
location 10705459 ~ 10705475 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GAAcagttattttcata

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000183775

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00028835 lncRNA downstream 386497 10313927 ~ 10318962 (-) True XLOC_014586
TCONS_00029757 lncRNA downstream 798520 9904324 ~ 9906939 (-) True XLOC_014578
TCONS_00028805 lncRNA downstream 1021951 9676517 ~ 9683508 (-) True XLOC_014572
TCONS_00030166 lncRNA downstream 1095947 9594867 ~ 9609512 (-) False XLOC_014570
TCONS_00028866 lncRNA upstream 153647 10859122 ~ 10860449 (-) False XLOC_014603
TCONS_00028865 lncRNA upstream 153719 10859194 ~ 10864799 (-) False XLOC_014603
TCONS_00028870 lncRNA upstream 170258 10875733 ~ 10876830 (-) False XLOC_014603
TCONS_00030168 lncRNA upstream 514286 11219761 ~ 11227568 (-) True XLOC_014612
TCONS_00028909 lncRNA upstream 1429316 12134791 ~ 12138739 (-) False XLOC_014624
TCONS_00028856 mRNA downstream 48663 10649424 ~ 10656796 (-) False XLOC_014598
TCONS_00028857 mRNA downstream 48758 10649425 ~ 10656701 (-) False XLOC_014598
TCONS_00028859 mRNA downstream 48783 10653645 ~ 10656676 (-) True XLOC_014598
TCONS_00028858 mRNA downstream 48792 10649426 ~ 10656667 (-) False XLOC_014598
TCONS_00028854 mRNA downstream 56936 10636524 ~ 10648523 (-) False XLOC_014597
TCONS_00028863 mRNA upstream 32675 10738150 ~ 10771558 (-) True XLOC_014601
TCONS_00028864 mRNA upstream 100383 10805858 ~ 10810006 (-) True XLOC_014602
TCONS_00028868 mRNA upstream 153744 10859219 ~ 10881486 (-) False XLOC_014603
TCONS_00028869 mRNA upstream 166126 10871601 ~ 10881508 (-) False XLOC_014603
TCONS_00028871 mRNA upstream 170258 10875733 ~ 10881141 (-) True XLOC_014603
TCONS_00028853 other downstream 58637 10636369 ~ 10646822 (-) False XLOC_014597
TCONS_00028825 other downstream 463348 10238453 ~ 10242111 (-) True XLOC_014584
TCONS_00028819 other downstream 582112 10123233 ~ 10123347 (-) True XLOC_014581
TCONS_00028818 other downstream 692845 10012498 ~ 10012614 (-) True XLOC_014580
TCONS_00028791 other downstream 1852804 8852540 ~ 8852655 (-) True XLOC_014556
TCONS_00028867 other upstream 153742 10859217 ~ 10860466 (-) False XLOC_014603
TCONS_00028885 other upstream 487774 11193249 ~ 11193363 (-) True XLOC_014611
TCONS_00028897 other upstream 1020021 11725496 ~ 11725631 (-) True XLOC_014620
TCONS_00028905 other upstream 1340979 12046454 ~ 12046570 (-) True XLOC_014623
TCONS_00028907 other upstream 1425570 12131045 ~ 12131180 (-) True XLOC_014625