RNA id: TCONS_00028885


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00028885
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.52
exon number 1
gene id XLOC_014611
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007130.7
NCBI id CM002903.2
chromosome length 48449771
location 11193249 ~ 11193363 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TTGAGTAGctcgctctctgcaactctcacatagtTGTCCACTGAAGCAAAGCAGGGCTGTgcatggtcagtacctggatgggagaccacatgggaaagctagtttgctgccggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000180767

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00028870 lncRNA downstream 316419 10875733 ~ 10876830 (-) False XLOC_014603
TCONS_00028865 lncRNA downstream 328450 10859194 ~ 10864799 (-) False XLOC_014603
TCONS_00028866 lncRNA downstream 332800 10859122 ~ 10860449 (-) False XLOC_014603
TCONS_00028835 lncRNA downstream 874287 10313927 ~ 10318962 (-) True XLOC_014586
TCONS_00029757 lncRNA downstream 1286310 9904324 ~ 9906939 (-) True XLOC_014578
TCONS_00030168 lncRNA upstream 26398 11219761 ~ 11227568 (-) True XLOC_014612
TCONS_00028909 lncRNA upstream 941428 12134791 ~ 12138739 (-) False XLOC_014624
TCONS_00028922 lncRNA upstream 1205181 12398544 ~ 12404316 (-) False XLOC_014631
TCONS_00030169 lncRNA upstream 1427563 12620926 ~ 12623962 (-) True XLOC_014632
TCONS_00030170 lncRNA upstream 1773656 12967019 ~ 13008216 (-) False XLOC_014635
TCONS_00028882 mRNA downstream 35590 11129318 ~ 11157659 (-) True XLOC_014609
TCONS_00028881 mRNA downstream 86934 11039517 ~ 11106315 (-) True XLOC_014608
TCONS_00028876 mRNA downstream 161855 10985369 ~ 11031394 (-) False XLOC_014607
TCONS_00028880 mRNA downstream 161976 11028097 ~ 11031273 (-) True XLOC_014607
TCONS_00028879 mRNA downstream 162097 10996886 ~ 11031152 (-) False XLOC_014607
TCONS_00028886 mRNA upstream 37720 11231083 ~ 11238721 (-) False XLOC_014613
TCONS_00028887 mRNA upstream 38041 11231404 ~ 11237125 (-) False XLOC_014613
TCONS_00028888 mRNA upstream 38149 11231512 ~ 11238620 (-) True XLOC_014613
TCONS_00028889 mRNA upstream 53691 11247054 ~ 11248982 (-) True XLOC_014614
TCONS_00028890 mRNA upstream 77484 11270847 ~ 11315224 (-) True XLOC_014615
TCONS_00028867 other downstream 332783 10859217 ~ 10860466 (-) False XLOC_014603
TCONS_00028860 other downstream 462771 10692166 ~ 10730478 (-) False XLOC_014599
TCONS_00028862 other downstream 487774 10705459 ~ 10705475 (-) True XLOC_014600
TCONS_00028853 other downstream 546427 10636369 ~ 10646822 (-) False XLOC_014597
TCONS_00028825 other downstream 951138 10238453 ~ 10242111 (-) True XLOC_014584
TCONS_00028897 other upstream 532133 11725496 ~ 11725631 (-) True XLOC_014620
TCONS_00028905 other upstream 853091 12046454 ~ 12046570 (-) True XLOC_014623
TCONS_00028907 other upstream 937682 12131045 ~ 12131180 (-) True XLOC_014625
TCONS_00028910 other upstream 941484 12134847 ~ 12145765 (-) True XLOC_014624
TCONS_00028911 other upstream 943373 12136736 ~ 12136871 (-) True XLOC_014626