RNA id: TCONS_00034507


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00034507
length 116
RNA type rRNA
GC content 0.52
exon number 1
gene id XLOC_017344
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007131.7
NCBI id CM002904.2
chromosome length 55201332
location 26594764 ~ 26594879 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TgctacagccatatcaccctgcagcccaagactggttactcactgaagctaagcagggctgagcctggtcggTACCAGGATggaaaccacatgggaaaactaggaagtggtgttaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000175296

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00036595 lncRNA upstream 31165 26556387 ~ 26563599 (+) True XLOC_017343
TCONS_00036594 lncRNA upstream 380943 26095530 ~ 26213821 (+) False XLOC_017340
TCONS_00034499 lncRNA upstream 528820 26059710 ~ 26065944 (+) True XLOC_017339
TCONS_00036593 lncRNA upstream 709063 25880309 ~ 25885701 (+) True XLOC_017334
TCONS_00034490 lncRNA upstream 943672 25650477 ~ 25651092 (+) True XLOC_017332
TCONS_00036596 lncRNA downstream 109505 26704384 ~ 26706029 (+) True XLOC_017348
TCONS_00034515 lncRNA downstream 310279 26905158 ~ 26913676 (+) False XLOC_017352
TCONS_00034517 lncRNA downstream 310331 26905210 ~ 26913507 (+) True XLOC_017352
TCONS_00034533 lncRNA downstream 408792 27003671 ~ 27004507 (+) False XLOC_017358
TCONS_00036597 lncRNA downstream 513827 27108706 ~ 27113992 (+) True XLOC_017362
TCONS_00034504 mRNA upstream 30932 26556174 ~ 26563832 (+) False XLOC_017343
TCONS_00034506 mRNA upstream 31153 26556372 ~ 26563611 (+) False XLOC_017343
TCONS_00034505 mRNA upstream 34378 26556372 ~ 26560386 (+) False XLOC_017343
TCONS_00034503 mRNA upstream 53587 26538137 ~ 26541177 (+) True XLOC_017342
TCONS_00034502 mRNA upstream 187531 26394324 ~ 26407233 (+) True XLOC_017341
TCONS_00034508 mRNA downstream 89054 26683933 ~ 26685395 (+) True XLOC_017345
TCONS_00034509 mRNA downstream 95157 26690036 ~ 26692944 (+) True XLOC_017346
TCONS_00034510 mRNA downstream 107498 26702377 ~ 26704331 (+) True XLOC_017347
TCONS_00034511 mRNA downstream 285789 26880668 ~ 26886849 (+) False XLOC_017349
TCONS_00034512 mRNA downstream 286721 26881600 ~ 26888698 (+) True XLOC_017349
TCONS_00034480 other upstream 1013308 25580906 ~ 25581456 (+) True XLOC_017327
TCONS_00034475 other upstream 1032947 25558878 ~ 25561817 (+) True XLOC_017323
TCONS_00034473 other upstream 1039749 25533064 ~ 25555015 (+) False XLOC_017322
TCONS_00034470 other upstream 1125615 25466570 ~ 25469149 (+) True XLOC_017320
TCONS_00034463 other upstream 1357640 25237009 ~ 25237124 (+) True XLOC_017317
TCONS_00034514 other downstream 304866 26899745 ~ 26902268 (+) True XLOC_017351
TCONS_00034520 other downstream 344879 26939758 ~ 26943286 (+) False XLOC_017354
TCONS_00034523 other downstream 345254 26940133 ~ 26940555 (+) False XLOC_017354
TCONS_00034547 other downstream 743127 27338006 ~ 27338121 (+) True XLOC_017366
TCONS_00034549 other downstream 810999 27405878 ~ 27405962 (+) True XLOC_017368