RNA id: TCONS_00034779


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00034779
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_017499
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007131.7
NCBI id CM002904.2
chromosome length 55201332
location 36280048 ~ 36280164 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TACCACAGCTGTATCACTCTGCAGCCCAAGACAGGTTACTCACTGAAACCaggcagggctgagcctggtcagtacctggatgggagatcacgATGGAAAACTAGGTTactgttgaaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000190632

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00036627 lncRNA upstream 325807 35857399 ~ 35954241 (+) False XLOC_017496
TCONS_00036398 lncRNA upstream 452843 35712858 ~ 35827205 (+) False XLOC_017495
TCONS_00036625 lncRNA upstream 470460 35712602 ~ 35809588 (+) False XLOC_017495
TCONS_00034772 lncRNA upstream 520294 35712884 ~ 35759754 (+) False XLOC_017495
TCONS_00036626 lncRNA upstream 549166 35714050 ~ 35730882 (+) True XLOC_017495
TCONS_00036399 lncRNA downstream 22633 36302797 ~ 36304106 (+) True XLOC_017500
TCONS_00036400 lncRNA downstream 401982 36682146 ~ 36704359 (+) False XLOC_017503
TCONS_00036401 lncRNA downstream 434739 36714903 ~ 36715819 (+) True XLOC_017504
TCONS_00036628 lncRNA downstream 503250 36783414 ~ 36791968 (+) True XLOC_017503
TCONS_00036629 lncRNA downstream 510775 36790939 ~ 36796506 (+) True XLOC_017505
TCONS_00034774 mRNA upstream 243352 35998073 ~ 36036696 (+) False XLOC_017497
TCONS_00034775 mRNA upstream 243352 36010080 ~ 36036696 (+) True XLOC_017497
TCONS_00034773 mRNA upstream 299596 35857399 ~ 35980452 (+) True XLOC_017496
TCONS_00034771 mRNA upstream 783589 35484070 ~ 35496459 (+) True XLOC_017494
TCONS_00034770 mRNA upstream 783912 35484070 ~ 35496136 (+) False XLOC_017494
TCONS_00034780 mRNA downstream 343643 36623807 ~ 36626569 (+) False XLOC_017501
TCONS_00034781 mRNA downstream 343727 36623891 ~ 36626533 (+) True XLOC_017501
TCONS_00034782 mRNA downstream 347895 36628059 ~ 36638179 (+) False XLOC_017502
TCONS_00034783 mRNA downstream 349009 36629173 ~ 36637503 (+) True XLOC_017502
TCONS_00034784 mRNA downstream 401887 36682051 ~ 36792710 (+) False XLOC_017503
TCONS_00034762 other upstream 857221 35422698 ~ 35422827 (+) True XLOC_017490
TCONS_00034760 other upstream 897431 35382438 ~ 35382617 (+) False XLOC_017489
TCONS_00034756 other upstream 991077 35279996 ~ 35288971 (+) False XLOC_017488
TCONS_00034743 other upstream 1216067 35062806 ~ 35063981 (+) True XLOC_017485
TCONS_00034740 other upstream 1324788 34943371 ~ 34955260 (+) True XLOC_017481
TCONS_00034815 other downstream 1540826 37820990 ~ 37826136 (+) False XLOC_017519
TCONS_00034825 other downstream 1833633 38113797 ~ 38119890 (+) True XLOC_017523
TCONS_00034845 other downstream 2340502 38620666 ~ 38648890 (+) False XLOC_017535
TCONS_00034847 other downstream 2340570 38620734 ~ 38633460 (+) True XLOC_017535
TCONS_00034852 other downstream 2494808 38774972 ~ 38775087 (+) True XLOC_017538