RNA id: TCONS_00035715


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00035715
length 126
RNA type rRNA
GC content 0.54
exon number 1
gene id XLOC_018118
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007131.7
NCBI id CM002904.2
chromosome length 55201332
location 27054095 ~ 27054220 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

AGGGATGAGCACCACTGGTATAGTATATGCCGGCAGCTTGCTCTCTGCAACTGTCatatggtcacccactgaagctacccggtcagtacctgaatgggagaccacatgggaatcgcctcatccagg

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000169237

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00035713 lncRNA downstream 91339 26959533 ~ 26962756 (-) True XLOC_018116
TCONS_00036848 lncRNA downstream 118324 26932068 ~ 26935771 (-) False XLOC_018115
TCONS_00035712 lncRNA downstream 118324 26935002 ~ 26935771 (-) True XLOC_018115
TCONS_00036847 lncRNA downstream 345569 26631070 ~ 26708526 (-) True XLOC_018112
TCONS_00036846 lncRNA downstream 345613 26631070 ~ 26708482 (-) False XLOC_018112
TCONS_00035725 lncRNA upstream 249628 27303848 ~ 27304286 (-) False XLOC_018122
TCONS_00036849 lncRNA upstream 1060544 28114764 ~ 28154496 (-) False XLOC_018129
TCONS_00036850 lncRNA upstream 1060544 28114764 ~ 28164127 (-) False XLOC_018129
TCONS_00036851 lncRNA upstream 1060544 28114764 ~ 28164152 (-) True XLOC_018129
TCONS_00036852 lncRNA upstream 1179057 28233277 ~ 28233592 (-) True XLOC_018130
TCONS_00035711 mRNA downstream 116642 26931496 ~ 26937453 (-) False XLOC_018115
TCONS_00035710 mRNA downstream 117208 26928915 ~ 26936887 (-) False XLOC_018115
TCONS_00035709 mRNA downstream 124410 26920681 ~ 26929685 (-) False XLOC_018115
TCONS_00035707 mRNA downstream 187984 26827265 ~ 26866111 (-) False XLOC_018114
TCONS_00035706 mRNA downstream 208067 26827265 ~ 26846028 (-) False XLOC_018114
TCONS_00035716 mRNA upstream 36688 27090908 ~ 27092290 (-) True XLOC_018119
TCONS_00035717 mRNA upstream 60654 27114874 ~ 27152495 (-) False XLOC_018120
TCONS_00035718 mRNA upstream 60654 27114874 ~ 27190393 (-) True XLOC_018120
TCONS_00035719 mRNA upstream 168629 27222849 ~ 27225876 (-) False XLOC_018121
TCONS_00035720 mRNA upstream 169201 27223421 ~ 27225878 (-) False XLOC_018121
TCONS_00035701 other downstream 465185 26584112 ~ 26588910 (-) True XLOC_018111
TCONS_00035698 other downstream 502862 26550661 ~ 26551233 (-) True XLOC_018110
TCONS_00035691 other downstream 542822 26502486 ~ 26511273 (-) False XLOC_018108
TCONS_00035690 other downstream 565150 26480428 ~ 26488945 (-) False XLOC_018108
TCONS_00035681 other downstream 662138 26390795 ~ 26391957 (-) True XLOC_018105
TCONS_00035722 other upstream 170592 27224812 ~ 27225878 (-) True XLOC_018121
TCONS_00035726 other upstream 254196 27308416 ~ 27311615 (-) True XLOC_018122
TCONS_00035747 other upstream 1557052 28611272 ~ 28612322 (-) True XLOC_018136
TCONS_00035753 other upstream 1778542 28832762 ~ 28842571 (-) False XLOC_018139
TCONS_00035760 other upstream 1817665 28871885 ~ 28875874 (-) False XLOC_018141

Expression Profile

//