RNA id: TCONS_00042836


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00042836
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.55
exon number 1
gene id XLOC_021579
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007134.7
NCBI id CM002907.2
chromosome length 46223584
location 17501314 ~ 17501428 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

gctggcagctagctctctgcatctcttacatggtcacccactgaagctaagcagggctgcgcccagttagtaccttgatgggagaccacatgagaaagctaggttgctgccggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000184888

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00044806 lncRNA upstream 23866 17473119 ~ 17477448 (+) True XLOC_021578
TCONS_00044805 lncRNA upstream 79878 17412525 ~ 17421436 (+) False XLOC_021576
TCONS_00044668 lncRNA upstream 246557 17254498 ~ 17254757 (+) True XLOC_021573
TCONS_00044804 lncRNA upstream 290040 17146315 ~ 17211274 (+) False XLOC_021571
TCONS_00044802 lncRNA upstream 600078 16889152 ~ 16901236 (+) False XLOC_021567
TCONS_00042840 lncRNA downstream 41291 17542719 ~ 17546078 (+) False XLOC_021580
TCONS_00044807 lncRNA downstream 45684 17547112 ~ 17550653 (+) True XLOC_021580
TCONS_00042841 lncRNA downstream 155408 17656836 ~ 17659102 (+) True XLOC_021581
TCONS_00044808 lncRNA downstream 268996 17770424 ~ 17776345 (+) True XLOC_021582
TCONS_00042842 lncRNA downstream 281080 17782508 ~ 17783044 (+) True XLOC_021583
TCONS_00042835 mRNA upstream 36082 17437554 ~ 17465232 (+) True XLOC_021577
TCONS_00042834 mRNA upstream 54151 17417539 ~ 17447163 (+) True XLOC_021576
TCONS_00042833 mRNA upstream 97303 17387325 ~ 17404011 (+) True XLOC_021575
TCONS_00042831 mRNA upstream 116065 17354154 ~ 17385249 (+) False XLOC_021574
TCONS_00042832 mRNA upstream 145701 17354951 ~ 17355613 (+) True XLOC_021574
TCONS_00042837 mRNA downstream 8366 17509794 ~ 17520775 (+) False XLOC_021580
TCONS_00042838 mRNA downstream 10609 17512037 ~ 17523384 (+) False XLOC_021580
TCONS_00042839 mRNA downstream 21439 17522867 ~ 17549145 (+) False XLOC_021580
TCONS_00042844 mRNA downstream 299289 17800717 ~ 17815253 (+) False XLOC_021585
TCONS_00042845 mRNA downstream 299411 17800839 ~ 17814778 (+) True XLOC_021585
TCONS_00042829 other upstream 289508 17187884 ~ 17211806 (+) True XLOC_021571
TCONS_00042828 other upstream 290040 17146561 ~ 17211274 (+) False XLOC_021571
TCONS_00042827 other upstream 354323 17146315 ~ 17146991 (+) False XLOC_021571
TCONS_00042824 other upstream 555873 16937629 ~ 16945441 (+) True XLOC_021568
TCONS_00042818 other upstream 600308 16898325 ~ 16901006 (+) False XLOC_021567
TCONS_00042843 other downstream 281985 17783413 ~ 17783541 (+) True XLOC_021584
TCONS_00042853 other downstream 372098 17873526 ~ 17873598 (+) True XLOC_021588
TCONS_00042854 other downstream 372644 17874072 ~ 17874147 (+) True XLOC_021587
TCONS_00042869 other downstream 787646 18289074 ~ 18289201 (+) True XLOC_021598
TCONS_00042875 other downstream 1186929 18688357 ~ 18691482 (+) False XLOC_021600