RNA id: TCONS_00049265


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00049265
length 9886
lncRNA type inter_gene
GC content 0.32
exon number 1
gene id XLOC_024212
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007136.7
NCBI id CM002909.2
chromosome length 37502051
location 31248998 ~ 31258883 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
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TCONS_00049264 lncRNA upstream 886103 30360507 ~ 30362895 (+) True XLOC_024202
TCONS_00049057 lncRNA upstream 904072 30342200 ~ 30344926 (+) True XLOC_024201
TCONS_00047966 lncRNA upstream 1019077 30221191 ~ 30229921 (+) True XLOC_024197
TCONS_00047989 lncRNA downstream 65087 31323970 ~ 31344114 (+) False XLOC_024215
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TCONS_00047992 lncRNA downstream 146388 31405271 ~ 31409874 (+) True XLOC_024217
TCONS_00049267 lncRNA downstream 238435 31497318 ~ 31503469 (+) False XLOC_024218
TCONS_00049269 lncRNA downstream 242984 31501867 ~ 31503469 (+) False XLOC_024218
TCONS_00047984 mRNA upstream 396 31238606 ~ 31248602 (+) True XLOC_024211
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TCONS_00047981 mRNA upstream 86182 31122806 ~ 31162816 (+) True XLOC_024209
TCONS_00047977 mRNA upstream 443994 30799236 ~ 30805004 (+) True XLOC_024205
TCONS_00047985 mRNA downstream 5272 31264155 ~ 31275790 (+) False XLOC_024213
TCONS_00047986 mRNA downstream 8385 31267268 ~ 31275944 (+) True XLOC_024213
TCONS_00047987 mRNA downstream 17959 31276842 ~ 31288556 (+) False XLOC_024214
TCONS_00047988 mRNA downstream 18532 31277415 ~ 31288658 (+) True XLOC_024214
TCONS_00047990 mRNA downstream 65095 31323978 ~ 31394515 (+) True XLOC_024215
TCONS_00047980 other upstream 267551 30981333 ~ 30981447 (+) True XLOC_024208
TCONS_00047979 other upstream 277038 30971844 ~ 30971960 (+) True XLOC_024207
TCONS_00047974 other upstream 911009 30316839 ~ 30337989 (+) True XLOC_024200
TCONS_00047963 other upstream 1072439 30176471 ~ 30176559 (+) True XLOC_024196
TCONS_00047922 other upstream 2745033 28503850 ~ 28503965 (+) True XLOC_024172
TCONS_00048011 other downstream 1323857 32582740 ~ 32611439 (+) True XLOC_024226
TCONS_00048019 other downstream 1880192 33139075 ~ 33139200 (+) True XLOC_024231
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TCONS_00048052 other downstream 3516675 34775558 ~ 34789619 (+) True XLOC_024253

Expression Profile

//