RNA id: TCONS_00048029



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00048029
length 116
RNA type rRNA
GC content 0.56
exon number 1
gene id XLOC_024239
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007136.7
NCBI id CM002909.2
chromosome length 37502051
location 33780513 ~ 33780628 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GGCCGCAGCCATATCACTCTGCAGCCCAAgtccagttactcactgaagctaagcggggctgagcctggtcagtacctggatgggagaccacttgggaaaactaggttgctcaACCT

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000177979

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00049061 lncRNA upstream 170560 33605601 ~ 33609953 (+) True XLOC_024237
TCONS_00049060 lncRNA upstream 276949 33501345 ~ 33503564 (+) True XLOC_024236
TCONS_00049271 lncRNA upstream 340893 33407120 ~ 33439620 (+) True XLOC_024235
TCONS_00049270 lncRNA upstream 431778 33344794 ~ 33348735 (+) True XLOC_024234
TCONS_00049059 lncRNA upstream 744409 33029618 ~ 33036104 (+) True XLOC_024229
TCONS_00049062 lncRNA downstream 254875 34035503 ~ 34036111 (+) False XLOC_024243
TCONS_00048036 lncRNA downstream 254875 34035503 ~ 34050402 (+) False XLOC_024243
TCONS_00048037 lncRNA downstream 262652 34043280 ~ 34043756 (+) True XLOC_024243
TCONS_00049063 lncRNA downstream 274128 34054756 ~ 34138343 (+) False XLOC_024244
TCONS_00049272 lncRNA downstream 274247 34054875 ~ 34137434 (+) True XLOC_024244
TCONS_00048027 mRNA upstream 513960 33256012 ~ 33266553 (+) True XLOC_024233
TCONS_00048026 mRNA upstream 530190 33202294 ~ 33250323 (+) True XLOC_024232
TCONS_00048025 mRNA upstream 535670 33201727 ~ 33244843 (+) False XLOC_024232
TCONS_00048024 mRNA upstream 539769 33201727 ~ 33240744 (+) False XLOC_024232
TCONS_00048023 mRNA upstream 543180 33192935 ~ 33237333 (+) False XLOC_024232
TCONS_00048030 mRNA downstream 69019 33849647 ~ 33963212 (+) False XLOC_024240
TCONS_00048031 mRNA downstream 159100 33939728 ~ 33969717 (+) True XLOC_024240
TCONS_00048032 mRNA downstream 191391 33972019 ~ 34009675 (+) False XLOC_024241
TCONS_00048033 mRNA downstream 191525 33972153 ~ 34008525 (+) True XLOC_024241
TCONS_00048034 mRNA downstream 232465 34013093 ~ 34027379 (+) False XLOC_024242
TCONS_00048028 other upstream 51115 33729284 ~ 33729398 (+) True XLOC_024238
TCONS_00048019 other upstream 641313 33139075 ~ 33139200 (+) True XLOC_024231
TCONS_00048011 other upstream 1169074 32582740 ~ 32611439 (+) True XLOC_024226
TCONS_00047980 other upstream 2799066 30981333 ~ 30981447 (+) True XLOC_024208
TCONS_00047979 other upstream 2808553 30971844 ~ 30971960 (+) True XLOC_024207
TCONS_00048052 other downstream 994930 34775558 ~ 34789619 (+) True XLOC_024253
TCONS_00048053 other downstream 1010734 34791362 ~ 34791466 (+) True XLOC_024254
TCONS_00048100 other downstream 2100787 35881415 ~ 35881531 (+) True XLOC_024292
TCONS_00048139 other downstream 2676172 36456800 ~ 36456918 (+) True XLOC_024327
TCONS_00048140 other downstream 2729046 36509674 ~ 36509789 (+) True XLOC_024328

Expression Profile


//