RNA id: TCONS_00051529


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00051529
length 118
RNA type rRNA
GC content 0.56
exon number 1
gene id XLOC_026441
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 30800541 ~ 30800658 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

tgccacagccatatcacactgcagcccaagactggttactcactgaagccaagcaTGGGCagggcctggtcagtacctggatggccgaccacatgggaaaactaggttgctgttggag

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000117456

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00053050 lncRNA downstream 104251 30694877 ~ 30696290 (-) True XLOC_026439
TCONS_00051527 lncRNA downstream 124513 30670505 ~ 30676028 (-) True XLOC_026438
TCONS_00051515 lncRNA downstream 552282 30247749 ~ 30248259 (-) True XLOC_026434
TCONS_00053049 lncRNA downstream 598710 30199036 ~ 30201831 (-) True XLOC_026432
TCONS_00053048 lncRNA downstream 761392 30036697 ~ 30039149 (-) True XLOC_026427
TCONS_00053051 lncRNA upstream 241294 31041952 ~ 31058290 (-) True XLOC_026446
TCONS_00051546 lncRNA upstream 280022 31080680 ~ 31082367 (-) False XLOC_026449
TCONS_00053052 lncRNA upstream 292554 31093212 ~ 31093764 (-) True XLOC_026450
TCONS_00051549 lncRNA upstream 304710 31105368 ~ 31108643 (-) False XLOC_026451
TCONS_00053053 lncRNA upstream 373475 31174133 ~ 31177209 (-) True XLOC_026453
TCONS_00051526 mRNA downstream 115140 30665195 ~ 30685401 (-) False XLOC_026438
TCONS_00051522 mRNA downstream 175322 30515365 ~ 30625219 (-) False XLOC_026437
TCONS_00051525 mRNA downstream 190882 30529627 ~ 30609659 (-) False XLOC_026437
TCONS_00051524 mRNA downstream 190882 30529627 ~ 30609659 (-) False XLOC_026437
TCONS_00051523 mRNA downstream 190882 30529627 ~ 30609659 (-) True XLOC_026437
TCONS_00051530 mRNA upstream 67668 30868326 ~ 30885250 (-) False XLOC_026442
TCONS_00051531 mRNA upstream 72427 30873085 ~ 30888415 (-) False XLOC_026442
TCONS_00051532 mRNA upstream 87468 30888126 ~ 30909487 (-) True XLOC_026442
TCONS_00051533 mRNA upstream 125706 30926364 ~ 30941362 (-) True XLOC_026443
TCONS_00051534 mRNA upstream 147306 30947964 ~ 30962646 (-) True XLOC_026444
TCONS_00051520 other downstream 312447 30454353 ~ 30488094 (-) False XLOC_026436
TCONS_00051482 other downstream 930417 29868899 ~ 29870124 (-) True XLOC_026416
TCONS_00051481 other downstream 931809 29868635 ~ 29868732 (-) True XLOC_026418
TCONS_00051479 other downstream 933001 29867404 ~ 29867540 (-) True XLOC_026417
TCONS_00051474 other downstream 1030283 29770142 ~ 29770258 (-) True XLOC_026414
TCONS_00051585 other upstream 1385476 32186134 ~ 32187385 (-) False XLOC_026474
TCONS_00051635 other upstream 2172316 32972974 ~ 32973534 (-) True XLOC_026495
TCONS_00051656 other upstream 2623534 33424192 ~ 33424328 (-) True XLOC_026505
TCONS_00051678 other upstream 3148011 33948669 ~ 33948788 (-) True XLOC_026513
TCONS_00051702 other upstream 3222507 34023165 ~ 34023613 (-) True XLOC_026529