RNA id: TCONS_00051481


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00051481
length 98
RNA type snoRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_026418
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 29868635 ~ 29868732 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

CGTGCATGTAATGATGAAAAACATGGATTAACCGCGTCAGGCATGGCGCCCGAAACGCATGAGGAAATTTCCCATGCTGCCTTCCTTCTGACAGCACA

Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000119350

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00053045 lncRNA downstream 5029 29835165 ~ 29863606 (-) False XLOC_026415
TCONS_00053044 lncRNA downstream 5029 29835165 ~ 29863606 (-) True XLOC_026415
TCONS_00051475 lncRNA downstream 5031 29835165 ~ 29863604 (-) False XLOC_026415
TCONS_00051476 lncRNA downstream 5050 29835165 ~ 29863585 (-) False XLOC_026415
TCONS_00053043 lncRNA downstream 12167 29835165 ~ 29856468 (-) False XLOC_026415
TCONS_00051496 lncRNA upstream 54424 29923156 ~ 29926774 (-) True XLOC_026422
TCONS_00051501 lncRNA upstream 105736 29974468 ~ 29975528 (-) True XLOC_026424
TCONS_00053046 lncRNA upstream 126163 29994895 ~ 30004929 (-) True XLOC_026425
TCONS_00053047 lncRNA upstream 151104 30019836 ~ 30023485 (-) False XLOC_026426
TCONS_00051502 lncRNA upstream 153346 30022078 ~ 30023202 (-) True XLOC_026426
TCONS_00051469 mRNA downstream 180236 29674308 ~ 29688399 (-) False XLOC_026412
TCONS_00051471 mRNA downstream 180265 29686639 ~ 29688370 (-) False XLOC_026412
TCONS_00051470 mRNA downstream 189164 29674628 ~ 29679471 (-) False XLOC_026412
TCONS_00051467 mRNA downstream 196982 29655677 ~ 29671653 (-) False XLOC_026411
TCONS_00051463 mRNA downstream 359676 29487300 ~ 29508959 (-) False XLOC_026408
TCONS_00051483 mRNA upstream 4087 29872819 ~ 29891500 (-) False XLOC_026419
TCONS_00051484 mRNA upstream 11798 29880530 ~ 29891456 (-) False XLOC_026419
TCONS_00051485 mRNA upstream 12791 29881523 ~ 29891218 (-) True XLOC_026419
TCONS_00051486 mRNA upstream 25234 29893966 ~ 29899172 (-) False XLOC_026420
TCONS_00051487 mRNA upstream 25234 29893966 ~ 29899230 (-) True XLOC_026420
TCONS_00051479 other downstream 1095 29867404 ~ 29867540 (-) True XLOC_026417
TCONS_00051474 other downstream 98377 29770142 ~ 29770258 (-) True XLOC_026414
TCONS_00051472 other downstream 180872 29686709 ~ 29687763 (-) True XLOC_026412
TCONS_00051468 other downstream 204872 29655732 ~ 29663763 (-) True XLOC_026411
TCONS_00051466 other downstream 204892 29654961 ~ 29663743 (-) False XLOC_026411
TCONS_00051482 other upstream 167 29868899 ~ 29870124 (-) True XLOC_026416
TCONS_00051520 other upstream 585621 30454353 ~ 30488094 (-) False XLOC_026436
TCONS_00051529 other upstream 931809 30800541 ~ 30800658 (-) True XLOC_026441
TCONS_00051585 other upstream 2317402 32186134 ~ 32187385 (-) False XLOC_026474
TCONS_00051635 other upstream 3104242 32972974 ~ 32973534 (-) True XLOC_026495

Expression Profile

//