RNA id: TCONS_00051678


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00051678
length 120
RNA type rRNA
GC content 0.52
exon number 1
gene id XLOC_026513
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 33948669 ~ 33948788 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GCTGGCAGCTAGGTCTCTGCAACTCTAACATGGTCACCaattgaagctaagcagagctgtgcctggtcagtagccggatgggagaccacatggaaaaactactgtaggttgctgctggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000119825

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00051677 lncRNA downstream 9848 33936453 ~ 33938821 (-) True XLOC_026512
TCONS_00051675 lncRNA downstream 13231 33922620 ~ 33935438 (-) False XLOC_026512
TCONS_00053065 lncRNA downstream 29474 33918566 ~ 33919195 (-) True XLOC_026511
TCONS_00051667 lncRNA downstream 257915 33681518 ~ 33690754 (-) True XLOC_026509
TCONS_00051659 lncRNA downstream 510937 33435754 ~ 33437732 (-) True XLOC_026506
TCONS_00053066 lncRNA upstream 190849 34139637 ~ 34141181 (-) True XLOC_026572
TCONS_00051762 lncRNA upstream 231019 34179807 ~ 34180432 (-) False XLOC_026573
TCONS_00051763 lncRNA upstream 231019 34179807 ~ 34180451 (-) True XLOC_026573
TCONS_00051771 lncRNA upstream 521366 34470154 ~ 34477363 (-) False XLOC_026575
TCONS_00051773 lncRNA upstream 577154 34525942 ~ 34546406 (-) False XLOC_026575
TCONS_00051673 mRNA downstream 6794 33922072 ~ 33941875 (-) False XLOC_026512
TCONS_00051671 mRNA downstream 7350 33921971 ~ 33941319 (-) False XLOC_026512
TCONS_00051672 mRNA downstream 7350 33922072 ~ 33941319 (-) False XLOC_026512
TCONS_00051676 mRNA downstream 13469 33932379 ~ 33935200 (-) False XLOC_026512
TCONS_00051674 mRNA downstream 13881 33922387 ~ 33934788 (-) False XLOC_026512
TCONS_00051679 mRNA upstream 458 33949246 ~ 33961589 (-) True XLOC_026514
TCONS_00051680 mRNA upstream 14459 33963247 ~ 33967767 (-) False XLOC_026515
TCONS_00051681 mRNA upstream 16790 33965578 ~ 33967767 (-) False XLOC_026515
TCONS_00051682 mRNA upstream 16791 33965579 ~ 34027178 (-) False XLOC_026515
TCONS_00051683 mRNA upstream 16791 33965579 ~ 34095221 (-) False XLOC_026515
TCONS_00051656 other downstream 524341 33424192 ~ 33424328 (-) True XLOC_026505
TCONS_00051635 other downstream 975135 32972974 ~ 32973534 (-) True XLOC_026495
TCONS_00051585 other downstream 1761284 32186134 ~ 32187385 (-) False XLOC_026474
TCONS_00051529 other downstream 3148011 30800541 ~ 30800658 (-) True XLOC_026441
TCONS_00051520 other downstream 3460575 30454353 ~ 30488094 (-) False XLOC_026436
TCONS_00051702 other upstream 74377 34023165 ~ 34023613 (-) True XLOC_026529
TCONS_00051708 other upstream 86404 34035192 ~ 34035631 (-) True XLOC_026534
TCONS_00051712 other upstream 88693 34037481 ~ 34037881 (-) True XLOC_026535
TCONS_00051715 other upstream 98391 34047179 ~ 34047616 (-) True XLOC_026538
TCONS_00051716 other upstream 99417 34048205 ~ 34048653 (-) True XLOC_026539