RNA id: TCONS_00058510



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00058510
length 116
RNA type rRNA
GC content 0.51
exon number 1
gene id XLOC_029828
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007116.7
NCBI id CM002889.2
chromosome length 72500376
location 5615331 ~ 5615446 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


ttcacagccatatcacccagcaGGCCAAGATTGGTTattcactgaagccaagcagggctaagcctggtcagtacctggatggcagACCACAttggaacactaggttgctgttggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000179530

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00061395 lncRNA upstream 289174 5242666 ~ 5326157 (+) False XLOC_029825
TCONS_00061396 lncRNA upstream 289174 5321599 ~ 5326157 (+) True XLOC_029825
TCONS_00061625 lncRNA upstream 443999 5163297 ~ 5171332 (+) False XLOC_029824
TCONS_00061629 lncRNA downstream 780828 6396274 ~ 6397926 (+) False XLOC_029830
TCONS_00061630 lncRNA downstream 780851 6396297 ~ 6397926 (+) False XLOC_029830
TCONS_00061631 lncRNA downstream 780885 6396331 ~ 6397926 (+) True XLOC_029830
TCONS_00058516 lncRNA downstream 1106864 6722310 ~ 6728953 (+) True XLOC_029833
TCONS_00061632 lncRNA downstream 1317616 6933062 ~ 6939709 (+) False XLOC_029839
TCONS_00058509 mRNA upstream 115375 5406503 ~ 5499956 (+) True XLOC_029827
TCONS_00058508 mRNA upstream 175929 5398966 ~ 5439402 (+) False XLOC_029827
TCONS_00058506 mRNA upstream 784975 4806851 ~ 4830356 (+) True XLOC_029822
TCONS_00058505 mRNA upstream 1035923 4575800 ~ 4579408 (+) True XLOC_029821
TCONS_00058504 mRNA upstream 1043949 4564233 ~ 4571382 (+) True XLOC_029820
TCONS_00058511 mRNA downstream 74030 5689476 ~ 5696173 (+) True XLOC_029829
TCONS_00058512 mRNA downstream 1001955 6617401 ~ 6620005 (+) True XLOC_029831
TCONS_00058513 mRNA downstream 1055499 6670945 ~ 6717121 (+) False XLOC_029832
TCONS_00058514 mRNA downstream 1057424 6672870 ~ 6718120 (+) False XLOC_029832
TCONS_00058517 mRNA downstream 1140020 6755466 ~ 6790840 (+) False XLOC_029834
TCONS_00058507 other upstream 263144 5352071 ~ 5352187 (+) True XLOC_029826
TCONS_00058497 other upstream 1272564 4332220 ~ 4342767 (+) False XLOC_029816
TCONS_00058487 other upstream 1587453 4016273 ~ 4027878 (+) False XLOC_029813
TCONS_00058491 other upstream 1590342 4016994 ~ 4024989 (+) False XLOC_029813
TCONS_00058490 other upstream 1590374 4016371 ~ 4024957 (+) False XLOC_029813
TCONS_00058515 other downstream 1083674 6699120 ~ 6705073 (+) True XLOC_029832
TCONS_00058523 other downstream 1242693 6858139 ~ 6863720 (+) True XLOC_029836
TCONS_00058525 other downstream 1260474 6875920 ~ 6876034 (+) True XLOC_029838
TCONS_00058580 other downstream 4650202 10265648 ~ 10266690 (+) True XLOC_029886
TCONS_00058581 other downstream 4720689 10336135 ~ 10336763 (+) True XLOC_029887