RNA id: TCONS_00058730



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00058730
length 442
RNA type mRNA
GC content 0.53
exon number 4
gene id XLOC_030011
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007116.7
NCBI id CM002889.2
chromosome length 72500376
location 21922534 ~ 21928196 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


gagagtTTGACAGTTCTGGAAGAAACTGGAACAAACGACTGAGCCTCAACTTGccaataTTTCAGAATACCACAGTAACTGAAAACCACTGTGAGGATTCATATGTGCCCATGGCCTCCCCACCAATCAGCTGCACTGATGTCACTTCAGATGGCTACATACCCATGAGCCCCTCCACCCTGCCCGTCTCCCTACTCACCAACGGCAAACCAGAGCTGCCCTCGCCTTCCAATCCTGACCTTGAGCCTCCTCCAGTCGACCGCAACCTTAAACCAAGAAGACCTCGACCGCCGCCTTTAGACTTGCGGGGCCTGTCCACCATTTCTGAATGTCCTTTCCATGTTCCCCTCACACGCGCCATGACAGAACCCAGCACTTCACTTCAGTGTACTCCTTTGGACAGACGGCGTGTTTGGTGCTTAAATGGCTCTGAACAGGATGG

Function


GO: NA

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-070705-270 No description available

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000148092

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00061429 lncRNA upstream 636987 21285042 ~ 21285547 (+) True XLOC_030008
TCONS_00058718 lncRNA upstream 1077111 20843977 ~ 20845423 (+) True XLOC_029998
TCONS_00061682 lncRNA upstream 1376045 20542900 ~ 20546489 (+) False XLOC_029992
TCONS_00061430 lncRNA downstream 79583 22007779 ~ 22008067 (+) True XLOC_030013
TCONS_00061431 lncRNA downstream 157341 22085537 ~ 22094364 (+) True XLOC_030015
TCONS_00061683 lncRNA downstream 303018 22231214 ~ 22234694 (+) True XLOC_030019
TCONS_00061432 lncRNA downstream 468278 22396474 ~ 22404667 (+) True XLOC_030023
TCONS_00061684 lncRNA downstream 942115 22870311 ~ 22892701 (+) True XLOC_030032
TCONS_00058729 mRNA upstream 13452 21891305 ~ 21909082 (+) True XLOC_030010
TCONS_00058728 mRNA upstream 628429 21288227 ~ 21294105 (+) True XLOC_030009
TCONS_00058724 mRNA upstream 672773 21225017 ~ 21249761 (+) True XLOC_030004
TCONS_00058723 mRNA upstream 708235 21211135 ~ 21214299 (+) True XLOC_030003
TCONS_00058722 mRNA upstream 718465 21181047 ~ 21204069 (+) True XLOC_030002
TCONS_00058731 mRNA downstream 2928 21931124 ~ 21932191 (+) True XLOC_030012
TCONS_00058732 mRNA downstream 139374 22067570 ~ 22070229 (+) True XLOC_030014
TCONS_00058733 mRNA downstream 170395 22098591 ~ 22106594 (+) True XLOC_030016
TCONS_00058734 mRNA downstream 204957 22133153 ~ 22174037 (+) True XLOC_030017
TCONS_00058735 mRNA downstream 248837 22177033 ~ 22226645 (+) True XLOC_030018
TCONS_00058727 other upstream 644033 21274165 ~ 21278501 (+) True XLOC_030007
TCONS_00058726 other upstream 651175 21270450 ~ 21271359 (+) True XLOC_030006
TCONS_00058725 other upstream 663296 21258218 ~ 21259238 (+) True XLOC_030005
TCONS_00058714 other upstream 1247484 20674933 ~ 20675050 (+) True XLOC_029996
TCONS_00058694 other upstream 1844724 20077694 ~ 20077810 (+) True XLOC_029982
TCONS_00058738 other downstream 390653 22318849 ~ 22327098 (+) True XLOC_030021
TCONS_00058753 other downstream 1042616 22970812 ~ 22972320 (+) True XLOC_030034
TCONS_00058767 other downstream 1252309 23180505 ~ 23188247 (+) False XLOC_030043
TCONS_00058768 other downstream 1252336 23180532 ~ 23187739 (+) True XLOC_030043
TCONS_00058777 other downstream 1640151 23568347 ~ 23568462 (+) True XLOC_030049

Expression Profile


//