RNA id: TCONS_00066336



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00066336
length 778
lncRNA type antisense
GC content 0.37
exon number 3
gene id XLOC_033908
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007118.7
NCBI id CM002891.2
chromosome length 74282399
location 37851111 ~ 37863503 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GTGAACAACAGACTGCTTGGTGAGGAGACCCAACTAATATGTGGCAGGATTGGAGATTTCCTTCAATTAGTTTACATCCATACaagttttcctCCGCGAGGCTAAAGTCCAGGACTCTTCAGCTTCATAGTCAGACGCATCCCTTGAACAGCGGGACAGGAGAGATGAATGCTAAGAGCAGCAGCAGAGCTTCAGAGCTGCTCCTATCTGCACAGGTCCTCATGTGCTGAGTCTCGCTGAGGCTTCCTCTTCTTTACATTGGACTTCACAGACTTGCTGCTCTGCTGGATCTTGTTGGGGTTGTTGTGCGGCCCTTGAGTACTTTTGTTAGCGAGCTGCCGGCTCTGGATAAAACACAAGATGACATTTTTATTAGGGTTATGAAACTCAATTGTCAATTTGAGTCAATGATTTAGATGTATTAAtttcaaatattattaatttataaatagatCCCAGATTAATTAGGAAACTGGAAAACGATAACACATGAAACttcaaaatgcattaaattaaaaatgttaaaagagGATTCAGATATGAGATGTTCATTTTAGAGTTAGCATCAAACTAAAATGTGAAAAAGTGagtatatacacaaacatacctTATGAAAGTTATATTTCAACATTTGATTGGTTCATTATTATGAtgaaattgaattttattttattttgaataattaaaaacttaCTGACAAATGTGCAATATTGAGAGGAGAGTGGTAATCAGGGAGTGACATTAACACCAGCCCAATGCTGGTAGATTTTAGCTGTGA

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000173876

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00068584 lncRNA upstream 42644 37808226 ~ 37808467 (+) True XLOC_033907
TCONS_00068905 lncRNA upstream 265201 37579670 ~ 37585910 (+) True XLOC_033905
TCONS_00068904 lncRNA upstream 660792 37186880 ~ 37190319 (+) True XLOC_033903
TCONS_00068902 lncRNA upstream 665863 37060427 ~ 37185248 (+) False XLOC_033901
TCONS_00068906 lncRNA downstream 55975 37919478 ~ 37922901 (+) True XLOC_033909
TCONS_00068907 lncRNA downstream 236906 38100409 ~ 38109640 (+) False XLOC_033911
TCONS_00068908 lncRNA downstream 237249 38100752 ~ 38109640 (+) False XLOC_033911
TCONS_00066339 lncRNA downstream 241200 38104703 ~ 38109515 (+) True XLOC_033911
TCONS_00066340 lncRNA downstream 280860 38144363 ~ 38145800 (+) True XLOC_033912
TCONS_00066335 mRNA upstream 95765 37742299 ~ 37755346 (+) True XLOC_033906
TCONS_00066333 mRNA upstream 458939 37372479 ~ 37392172 (+) False XLOC_033904
TCONS_00066334 mRNA upstream 458939 37377335 ~ 37392172 (+) True XLOC_033904
TCONS_00066332 mRNA upstream 461520 37359004 ~ 37389591 (+) False XLOC_033904
TCONS_00066337 mRNA downstream 226147 38089650 ~ 38095324 (+) False XLOC_033910
TCONS_00066338 mRNA downstream 227012 38090515 ~ 38093610 (+) True XLOC_033910
TCONS_00066346 mRNA downstream 386355 38249858 ~ 38257848 (+) False XLOC_033918
TCONS_00066347 mRNA downstream 391915 38255418 ~ 38256288 (+) True XLOC_033918
TCONS_00066348 mRNA downstream 395246 38258749 ~ 38264092 (+) False XLOC_033919
TCONS_00066319 other upstream 1375467 36467822 ~ 36475644 (+) False XLOC_033894
TCONS_00066313 other upstream 2087898 35736321 ~ 35763213 (+) True XLOC_033889
TCONS_00066310 other upstream 2098500 35679424 ~ 35752611 (+) False XLOC_033889
TCONS_00066341 other downstream 329840 38193343 ~ 38194494 (+) False XLOC_033914
TCONS_00066342 other downstream 330344 38193847 ~ 38194702 (+) True XLOC_033914
TCONS_00066343 other downstream 339035 38202538 ~ 38203393 (+) True XLOC_033915
TCONS_00066356 other downstream 486162 38349665 ~ 38364944 (+) False XLOC_033923
TCONS_00066360 other downstream 537591 38401094 ~ 38424009 (+) False XLOC_033924

Expression Profile


//