RNA id: TCONS_00069614


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00069614
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_035486
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007119.7
NCBI id CM002892.2
chromosome length 54304671
location 11860028 ~ 11860144 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

ggccacagccatatcaccctgcagaccaagactggttacttactgaagctaagcagagctaaGCCTAGTCAGTtactggatgggagaccacatgggaaagcaaggttgctgttggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000177998

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00072153 lncRNA upstream 47864 11794658 ~ 11812164 (+) True XLOC_035485
TCONS_00069610 lncRNA upstream 207651 11648661 ~ 11652377 (+) True XLOC_035483
TCONS_00072152 lncRNA upstream 286556 11567232 ~ 11573472 (+) False XLOC_035482
TCONS_00072151 lncRNA upstream 286556 11567232 ~ 11573472 (+) True XLOC_035482
TCONS_00069608 lncRNA upstream 368535 11483080 ~ 11491493 (+) True XLOC_035481
TCONS_00072154 lncRNA downstream 905886 12766030 ~ 13040576 (+) False XLOC_035489
TCONS_00072155 lncRNA downstream 1167380 13027524 ~ 13040576 (+) False XLOC_035489
TCONS_00069627 lncRNA downstream 1167380 13027524 ~ 13040576 (+) False XLOC_035489
TCONS_00072156 lncRNA downstream 1167616 13027760 ~ 13063138 (+) False XLOC_035489
TCONS_00072157 lncRNA downstream 1180550 13040694 ~ 13063138 (+) True XLOC_035489
TCONS_00069611 mRNA upstream 115034 11687254 ~ 11744994 (+) False XLOC_035484
TCONS_00069613 mRNA upstream 119550 11687586 ~ 11740478 (+) True XLOC_035484
TCONS_00069609 mRNA upstream 178469 11642070 ~ 11681559 (+) False XLOC_035483
TCONS_00069607 mRNA upstream 317739 11471359 ~ 11542289 (+) False XLOC_035481
TCONS_00069606 mRNA upstream 366188 11471350 ~ 11493840 (+) False XLOC_035481
TCONS_00069615 mRNA downstream 133006 11993150 ~ 12065918 (+) False XLOC_035487
TCONS_00069616 mRNA downstream 133007 11993151 ~ 12070546 (+) False XLOC_035487
TCONS_00069617 mRNA downstream 133007 11993151 ~ 12111276 (+) False XLOC_035487
TCONS_00069618 mRNA downstream 240201 12100345 ~ 12111461 (+) True XLOC_035487
TCONS_00069619 mRNA downstream 257953 12118097 ~ 12122228 (+) True XLOC_035488
TCONS_00069612 other upstream 144746 11687257 ~ 11715282 (+) False XLOC_035484
TCONS_00069600 other upstream 1015960 10843952 ~ 10844068 (+) True XLOC_035474
TCONS_00069587 other upstream 1966240 9893672 ~ 9893788 (+) True XLOC_035461
TCONS_00069578 other upstream 2748838 9111072 ~ 9111190 (+) True XLOC_035454
TCONS_00069563 other upstream 3155598 8699105 ~ 8704430 (+) True XLOC_035446
TCONS_00069632 other downstream 1283021 13143165 ~ 13153578 (+) True XLOC_035494
TCONS_00069647 other downstream 2028674 13888818 ~ 13944141 (+) False XLOC_035504
TCONS_00069654 other downstream 2309759 14169903 ~ 14170572 (+) True XLOC_035508
TCONS_00069656 other downstream 2555554 14415698 ~ 14415823 (+) True XLOC_035511
TCONS_00069660 other downstream 2946030 14806174 ~ 14806290 (+) True XLOC_035515