XLOC_015978


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_015978
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 56125003 ~ 56130443 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00033723
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>TCONS_00033724
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>TCONS_00033725
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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00033723 False 5362 lncRNA 0.32 2 56125003 56130443
TCONS_00033724 False 4820 lncRNA 0.33 3 56125168 56130443
TCONS_00033725 True 1155 lncRNA 0.31 2 56125171 56126826

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_015977 loxl5b coding upstream 83113 56012016 ~ 56041890 (+)
XLOC_015976 nmrk2 coding upstream 134674 55982300 ~ 55990329 (+)
XLOC_015975 atcayb coding upstream 154033 55914699 ~ 55970970 (+)
XLOC_015974 NA coding upstream 340558 55782537 ~ 55784445 (+)
XLOC_015973 NA coding upstream 344966 55777822 ~ 55780037 (+)
XLOC_015979 pgpep1 coding downstream 9498 56139941 ~ 56162607 (+)
XLOC_015980 upf1 coding downstream 38176 56168619 ~ 56237133 (+)
XLOC_015981 NA coding downstream 41650 56172093 ~ 56172528 (+)
XLOC_015982 homer3a coding downstream 135348 56265791 ~ 56283159 (+)
XLOC_015983 NA coding downstream 193891 56324334 ~ 56335388 (+)
XLOC_015971 NA non-coding upstream 521438 55603128 ~ 55603565 (+)
XLOC_015968 NA non-coding upstream 855713 55268020 ~ 55269290 (+)
XLOC_015960 CABZ01050280.1 non-coding upstream 1677290 54430632 ~ 54447713 (+)
XLOC_015984 NA non-coding downstream 199098 56329541 ~ 56331424 (+)
XLOC_015986 CU469531.1 non-coding downstream 357225 56487668 ~ 56493661 (+)
XLOC_015987 NA non-coding downstream 366691 56497134 ~ 56507389 (+)

Expression


Co-expression Network