XLOC_015975 (atcayb)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_015975
gene name atcayb
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 55914699 ~ 55970970 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00031647
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>TCONS_00031650
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>TCONS_00031649
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>TCONS_00031648
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Function

symbol description
atcayb Predicted to enable exopolyphosphatase activity. Predicted to be involved in apoptotic process and polyphosphate catabolic process. Predicted to be active in cytoplasm. Human ortholog(s) of this gene implicated in Cayman type cerebellar ataxia and cerebellar ataxia. Orthologous to human ATCAY (ATCAY kinesin light chain interacting caytaxin).

GO:

id name namespace
GO:0006915 apoptotic process biological_process
GO:0006798 polyphosphate catabolic process biological_process
GO:0005737 cytoplasm cellular_component
GO:0004309 exopolyphosphatase activity molecular_function

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-070912-220 Predicted to enable exopolyphosphatase activity. Predicted to be involved in apoptotic process and polyphosphate catabolic process. Predicted to be active in cytoplasm. Human ortholog(s) of this gene implicated in Cayman type cerebellar ataxia and cerebellar ataxia. Orthologous to human ATCAY (ATCAY kinesin light chain interacting caytaxin).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000059781

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00031647 False 10011 mRNA 0.37 13 55914699 55970970
TCONS_00031650 False 933 mRNA 0.51 9 55916911 55948210
TCONS_00031649 False 963 mRNA 0.50 9 55916911 55948210
TCONS_00031648 True 957 mRNA 0.51 8 55916911 55948210

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_015974 NA coding upstream 130254 55782537 ~ 55784445 (+)
XLOC_015973 NA coding upstream 134662 55777822 ~ 55780037 (+)
XLOC_015972 klf2b coding upstream 241474 55665095 ~ 55673225 (+)
XLOC_015971 NA coding upstream 311134 55603128 ~ 55603565 (+)
XLOC_015970 ap1m1 coding upstream 422384 55429988 ~ 55492315 (+)
XLOC_015976 nmrk2 coding downstream 11330 55982300 ~ 55990329 (+)
XLOC_015977 loxl5b coding downstream 41046 56012016 ~ 56041890 (+)
XLOC_015978 NA coding downstream 154033 56125003 ~ 56130443 (+)
XLOC_015979 pgpep1 coding downstream 168971 56139941 ~ 56162607 (+)
XLOC_015980 upf1 coding downstream 197649 56168619 ~ 56237133 (+)
XLOC_015968 NA non-coding upstream 645409 55268020 ~ 55269290 (+)
XLOC_015960 CABZ01050280.1 non-coding upstream 1466986 54430632 ~ 54447713 (+)
XLOC_015981 NA non-coding downstream 201123 56172093 ~ 56172528 (+)
XLOC_015983 NA non-coding downstream 353364 56324334 ~ 56335388 (+)
XLOC_015984 NA non-coding downstream 358571 56329541 ~ 56331424 (+)
XLOC_015986 CU469531.1 non-coding downstream 516698 56487668 ~ 56493661 (+)

Expression


Co-expression Network