LOC110519969 (LOC106586020)


Basic Information

Item Value
gene id LOC110519969
gene name LOC106586020
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048567.1
NCBI id CM023221.2
chromosome length 85311031
location 40440040 ~ 40452542 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

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>XM_021596896.2
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>TU292451
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>TU292452
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Function

NR:

description
fas apoptotic inhibitory molecule 1-like

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
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XM_021596896.2 False 3174 mRNA 0.43 5 40440040 40452542
TU292451 False 2741 TUCP 0.44 4 40440069 40452180
TU292452 True 2733 TUCP 0.44 4 40440069 40452180

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
asmtl asmtl coding upstream 657636 39769763 ~ 39782404 (+)
LOC110519965 LOC106586023 coding upstream 670614 39745774 ~ 39769426 (+)
LOC110519964 LOC106586025 coding upstream 698191 39713690 ~ 39741849 (+)
LOC110519963 LOC106586016 coding upstream 730375 39706441 ~ 39709665 (+)
LOC110519960 LOC106586058 coding upstream 771743 39658753 ~ 39668297 (+)
dnah7 dnah7 coding downstream 8619 40461161 ~ 40702678 (+)
LOC118944668 NA coding downstream 405755 40858297 ~ 40861180 (+)
LOC110519971 tmeff2 coding downstream 1101929 41554471 ~ 41725755 (+)
LOC110519972 sdpr coding downstream 1287548 41740090 ~ 41767612 (+)
spegb LOC106586064 coding downstream 1334411 41786953 ~ 41915322 (+)
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G256639 NA non-coding upstream 99679 40340137 ~ 40340361 (+)
G257218 NA non-coding downstream 334653 40787195 ~ 40787426 (+)
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G257247 NA non-coding downstream 355926 40808468 ~ 40808734 (+)
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G254445 NA other upstream 1839174 38600487 ~ 38600866 (+)
G254204 NA other upstream 1998306 38441166 ~ 38441734 (+)
G253834 LOC100136012 other upstream 2347306 38092322 ~ 38092734 (+)
G261749 NA other downstream 3799527 44252069 ~ 44252551 (+)
G262037 NA other downstream 4067877 44520419 ~ 44525408 (+)
G263547 LOC106586150 other downstream 5386379 45838921 ~ 45839480 (+)
G263710 NA other downstream 5481577 45934119 ~ 45934418 (+)
G263733 LOC106586158 other downstream 5622942 46075484 ~ 46079425 (+)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
eurasian perch (Perca fluviatilis) G68094 NA non-coding NC_053117.1 CM020914.1 39794220 ~ 39846179 (+)
bowfin (Amia calva) G72787 NA unknown CM030128.1 CM030128.1 30990063 ~ 30996363 (+)