XLOC_022793 (si:ch211-146l10.8)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_022793
gene name si:ch211-146l10.8
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007135.7
NCBI id CM002908.2
chromosome length 42172926
location 10027902 ~ 10032784 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00045324
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>TCONS_00045325
CACACACTATATATAAGGCCAGATCAGAAGTAGTTTTTATGTATGGTTTGGTGAAagctttttctgtttattttgtagtttttgtgtTGAGAGTAGTGTATAGTTGATTTGACTATGGGTGTTAAAACTATGGGTGTTAAAACTATGTGGATTTTAAGTGTTTCTTTAGCAGTACTTTTAGCCCTTGGCACATGTGATTATGACACTGCAACTATTTATACATACAGCCCTGGCAGCAGTGGAGGGAATCCTAGATCTGAAAATTCCAGTCCATTCATGCAGGAAGTGAAACAAAGCCTCTATAGCTTTTATGGACTAACTGATGTACTTGGACCAGTCAGGAAGGATACAGTTAAATGGGGCTATGATGCTGGTAGCTACAGATCTCAGACTGGCTCTTCAGGCACTCCAGTGACAAGTAATAAACCAGACTCTGAATCTCATGCTACAAGCCAACCAGGATTTCAAGTTGGTTCAGCTGCGAGTGGTAGTCTTGTTTATGGTTCTGTGAGAAATCCAGTGAATATGGGTGTGTCTGGGTATGATTCAAGTCAGTCAACTAATCTCCAAGTCTCTGAAGTAATCAGTTCTTCGGACTTGACCCCATTGCAACAAAGCAGTTATTCTGTTTCTAAGCCTAAGCCAGTACAGGTAGTTTCCTCAATTCCACTTCGAATTAACAGTATGTCTGTGGCAAAGCCCAGTAGCCAACAAATTGTGCAGACCATTTCCCAGTCCAGCAGTGAGCAACCAGTGAGCTCTGGAACAGTGTCCCAGTCCAGCCCTCAGCAATTCTCTCTATCCAGTGGTAAACCAATGTCTCAGACTAGCCTCCAGTCTGCAGTGCAGTCTGATAGATGGCCCCTCAAGCCTCTGAAAGGTAAACCCCATCACTCTGGTTCCTGGCCAGTTCATAATGTGGCAACCAGCTTTTTAAAGCCTTTGCAAGCTTCAAAACCTAGTTTATCAATATCGCAGTATGGCAGTGTACCAAGCAGCCTAGCTGTGGCTAGCTATGAACTCGTGAGCCAATCAGCCCAGTCCAGTGGCCAAACTGTAAATCAACCAGGCATCATACAATCTCCCAGTGTCATTGACCTCTCTGTGGTCCAGCCCAGTAGTCCGCTAATTCAACAGGCAGTTGACACCTCTGTGTCCCAAGCCTCCAGCCAGCAGCTAATACAGGCAGGCCAATCTGTCTCAACGCCAAATGTACAACCAGTAGATGCAAGTTATGTTTTTGTGGCTCAACCCAATGGACTGCAGCCTCCCAAGCACCACAAGGGTAAACATCACTTTGGGTCTAAGCCTTTCAATACTAGTCCTCACCAGACACTAAGATTTACTTCTGTAGGTCAGTCCAGTAGCCAGATGCCAGCACAAACCAGCTACCAGTCTGTGTCTCAACCATCTCTACAACTGCCAGTACAAGCCAGCTACCAGCCAGAGGCTCAGTCTCACTCCCAACAGCCAGGACCAACAAGATACCAGTTGGTAGCCAAGCCCAATGTTCAAGAGCCACCAAAGATTAGCTTTTCTGCAGCGCCACTTGCTCTTCAAAAACCAGCACAAACTAGCTACCAGTTGGTGGCACAACTAGGTGTCCAACAGCCAGCACAGGTAAGCCTACCTGTAGCCCAACCAAGCCATCTGCAAGAAGCACAATCCAGCTACGAGTATGTTGCCAAGCAGAATGGGCAAACCCTTTTCAACCCAGTGCAGTCCCATGAGATTCATCAAATTGGCTCCAAACTTTATTCATGCCATGAGTTACCACAGCACAGTTACCAGCGGAGGCATCCGTCTCCATCTACACCTAGTCTTCCAACCCTAGCTCAGGATTTCAAGCCTGTGGTTCTGCCAAGTGATCCGATTCCAATGGACCTGAACCCTCTCAGTTCTCTCGCATCTACTTTCAAACCAGCACATCTGCGTGAACATCCTGTCTTGCAGTCTGTAGTGCTTAAAAACGAACAACCAGTTGAGCTAGAGATCCAATCAAGTGATTTGTCTCTTGTCAAGCCTGGACCAGTGACTTCTAGTTTTGTATCTCAGCCCACTGGTCATCCTTCAAGACCATTGCAGCAGCCTGGCTCCCAGCAACCAACCAAGCCGTTGCAAGATGTGTTTTGGCCCGTAGTCAAGCCTGACAAACTGAAACCTTCTGGTTTTGAGGCACAAGTACTACCTAGCCATGTATCTTCAGTTTCAGGACAGTTTGTTTCCCAGTCTCAAATTCTGCCAGTTGGTCTGTCTCTTGCTCAGTCTACCTCTTCCCTAGCTGTGCCAGTGCAGGCAAGCCAATTGGTTTCCCAGTCAAATGTGCAACCAGTTGATAGACATTCTGTTTTTGTGGCCCAGCCCAGTGGACTGACTCCTCTCAAGCACCACAAAGGTAAACACCATGTTGGGTCCAGCTACCAACCTCAAGTTCTGTCAAGTTCTGGGACTGTTTTGCAGCCTGTATTACAGACTACTTCAGTGGTTGTGCCATCAAGTTACCAGTCTACAAGTTCCCAAGCCTGGAGTAACCCAATAGTTTCAAACTTCGAGTCTGTGCAGCCTGAACTTCCAATTCAAGCACAGTTGACTTATCAGTCTGTCACGGATCAAAATGCTCCTGGCCCTGTTGAAGGCAGCAGGCATCCATCACAGAAGTTGCTCAAGCTGTTGCAACAAGTAAAGTCTTAGGTGTTGTTTGCAATTTTCCTGATTAATGTTTACTTTctgatgaaaaataaaaaaatttttgt

Function

GO: NA

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-160113-6 No description available

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000045423

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00045324 False 4674 mRNA 0.43 4 10027902 10032784
TCONS_00045325 True 2753 mRNA 0.46 3 10027924 10030816

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_022792 cdv3 coding upstream 134108 9881219 ~ 9893794 (+)
XLOC_022791 tmem108 coding upstream 154696 9744012 ~ 9873206 (+)
XLOC_022790 topbp1 coding upstream 290672 9693951 ~ 9737230 (+)
XLOC_022789 nphp3 coding upstream 344528 9612218 ~ 9683374 (+)
XLOC_022788 GPR17 coding upstream 422582 9604442 ~ 9605320 (+)
XLOC_022794 pou6f2 coding downstream 6381 10039165 ~ 10272212 (+)
XLOC_022795 otulina coding downstream 270171 10302955 ~ 10344556 (+)
XLOC_022796 si:ch211-69l10.4 coding downstream 365081 10397865 ~ 10406797 (+)
XLOC_022797 myca coding downstream 380700 10413484 ~ 10416284 (+)
XLOC_022798 NA coding downstream 384520 10417304 ~ 10509462 (+)
XLOC_022785 NA non-coding upstream 746885 9275244 ~ 9281017 (+)
XLOC_022780 NA non-coding upstream 1186522 8832054 ~ 8841380 (+)
XLOC_022778 NA non-coding upstream 1732455 8267583 ~ 8295447 (+)
XLOC_022777 NA non-coding upstream 1782823 8243024 ~ 8245079 (+)
XLOC_022770 NA non-coding upstream 2470012 7553299 ~ 7557890 (+)
XLOC_022799 CT573344.2 non-coding downstream 397742 10430526 ~ 10432439 (+)
XLOC_022800 CT573414.1 non-coding downstream 785176 10817960 ~ 10818085 (+)
XLOC_022804 NA non-coding downstream 1301851 11334635 ~ 11346871 (+)
XLOC_022806 NA non-coding downstream 1506724 11539508 ~ 11539715 (+)

Expression


Co-expression Network