G1649321


Basic Information

Item Value
gene id G1649321
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048583.1
NCBI id CM023237.2
chromosome length 67237266
location 65607466 ~ 65609228 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1887774
gtggaggtgatggtggtggtgattgtaggtgatggtggtggtgagtgtagatggtggtggtgattgtagatggtggtggtgattgtagatgttggtgattgtaggtttgtggtggtggtgattgtaggtttgtggtgattgtaggtttttggtgattgtaggtttgtggtggtggtgattgtaggtttgtggtggtggtgattgtaggtttgtggtggtggtgattgtaggtttgtggtgattgtaggtttgtggttgtggtgattgtaggtttgtggtgattgtaggtttgtgctggtggtgattgtaggtttgtggtgattgtaggtttgtggtggtggtgattgtaggtttgtggtgattgtaggtttgtggtgattgtaggtttgtgctggtggtgattgtaggtttgtggtgattgtaggtttgtggtggtggtgatttgtaggtgtgtgttggtggtggtggtggttgtaggtttgtggtgattgtaggtttgtggtggtggtggtgattgtaggtttgtggtgattgtaggtttgtggtggtggtggtgattgtaggtttgtggtgattgtaggtttgtggtggtggagattgtagatggtggtggtgatggtgttgattgtaggtggtggtgatggtgttgattgtaggtataggtggtgattgtaggtggtggtgatggtggtgattgtaggtggtggtgatggtggtgattgtaggtggtggtgatggtgttgattgtag

Function

NR:

description
PREDICTED: uncharacterized protein LOC106592043

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1887774 True 750 lncRNA 0.47 2 65607466 65609228

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110498317 LOC106600683 coding upstream 80508 65515808 ~ 65526958 (+)
LOC110498315 LOC106606645 coding upstream 316375 65250079 ~ 65291091 (+)
LOC118941380 NA coding upstream 363173 65241682 ~ 65244293 (+)
nat8 LOC106607815 coding upstream 368029 65229684 ~ 65239437 (+)
manba manba coding upstream 464646 65108685 ~ 65142820 (+)
LOC110498312 LOC106560777 coding downstream 736504 66345732 ~ 66347001 (+)
LOC110498313 LOC106611434 coding downstream 761798 66370807 ~ 66379174 (+)
cfd LOC101448046 coding downstream 1109206 66718434 ~ 66723596 (+)
LOC110498318 LOC106560213 coding downstream 1333485 66942713 ~ 66975247 (+)
LOC110498319 pgrmc2 coding downstream 1377603 66986831 ~ 66995509 (+)
G1649314 NA non-coding upstream 3175 65587884 ~ 65604291 (+)
G1649316 NA non-coding upstream 12554 65588631 ~ 65594912 (+)
G1649313 NA non-coding upstream 15608 65585723 ~ 65591858 (+)
G1649308 NA non-coding upstream 23464 65575722 ~ 65584002 (+)
G1649306 NA non-coding upstream 36083 65570775 ~ 65571383 (+)
G1649326 NA non-coding downstream 8038 65617266 ~ 65618570 (+)
G1649362 NA non-coding downstream 67619 65676847 ~ 65677922 (+)
G1649366 NA non-coding downstream 74683 65683911 ~ 65685588 (+)
G1649300 NA non-coding downstream 119776 65729004 ~ 65731122 (+)
LOC110498653 atrn non-coding downstream 178098 65549526 ~ 65812816 (+)
G1649319 NA other upstream 5050 65600960 ~ 65602416 (+)
G1649309 NA other upstream 24884 65578439 ~ 65582582 (+)
G1649291 NA other upstream 62411 65544377 ~ 65545055 (+)
G1649268 NA other upstream 144012 65461773 ~ 65463454 (+)
G1648608 NA other upstream 626523 64980364 ~ 64980943 (+)
G1649614 NA other downstream 362227 65970505 ~ 65976240 (+)

Expression


Co-expression Network