hinfp (hinfp,LOC107677425,LOC107662995)


Basic Information

Item Value
gene id hinfp
gene name hinfp,LOC107677425,LOC107662995
gene type misc
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047621.1
NCBI id CM018567.1
chromosome length 18889892
location 8382695 ~ 8398355 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>TU454547
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>TU454548
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>XM_034300767.1
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Function

symbol description
hinfp Predicted to enable DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific and RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding activity. Predicted to be involved in anatomical structure development and regulation of transcription by RNA polymerase II. Orthologous to human HINFP (histone H4 transcription factor).

NR:

description
histone H4 transcription factor

GO:

id name namespace
GO:0046872 metal ion binding molecular_function
GO:0003676 nucleic acid binding molecular_function

KEGG: NA

RNA

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Neighbor

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ftr83 LOC108260410,LOC108429748,LOC107712363,LOC107587475,LOC107677412,LOC107664511,LOC107722782 coding downstream 70280 8306374 ~ 8312415 (-)
ruvbl2 ruvbl2,LOC105888489,LOC107664527,LOC107722783 coding downstream 78731 8288568 ~ 8303964 (-)
ube2g1a ube2g1,ube2g1a,UBE2G1,LOC107597432 coding downstream 244297 8126267 ~ 8138398 (-)
dpagt1 dpagt1,LOC107587348,LOC107722798,LOC107717886,LOC107597531 coding upstream 9235 8407590 ~ 8416180 (-)
hmbsa hmbs,hmbsa,LOC107717875,LOC107722788 coding upstream 68858 8467213 ~ 8482453 (-)
stk36 LOC108260317,LOC108271363,LOC107722762,LOC107598122 coding upstream 168930 8567285 ~ 8579445 (-)
c27h11orf53 c28h11orf53,cunh11orf53,LOC107597648 coding upstream 181742 8580097 ~ 8590527 (-)
adamts15a LOC108260351 coding upstream 357284 8755639 ~ 8775242 (-)
G383386 NA non-coding downstream 62902 8319585 ~ 8319793 (-)
LOC117596218 NA non-coding downstream 98384 8270854 ~ 8284311 (-)
G383366 NA non-coding downstream 219530 8162782 ~ 8163165 (-)
G383362 NA non-coding downstream 228688 8151418 ~ 8154007 (-)
G383359 NA non-coding downstream 234339 8147877 ~ 8148356 (-)
G383515 NA non-coding upstream 112236 8510591 ~ 8510815 (-)
G383522 NA non-coding upstream 118006 8516361 ~ 8517669 (-)
G383523 NA non-coding upstream 120089 8518444 ~ 8518890 (-)
G383526 NA non-coding upstream 123342 8521697 ~ 8522292 (-)
G383527 LOC108260305 non-coding upstream 126953 8525308 ~ 8526588 (-)
pdzd3b LOC108260234 other downstream 34426 8338508 ~ 8348269 (-)
atp2a3 atp2a3,LOC107587360,LOC107597397,LOC107712375,LOC107664518,LOC107748501 other downstream 395962 7889060 ~ 7986733 (-)
camkk1a camkk1,LOC107664416,LOC107587369,LOC107664519 other downstream 486966 7799638 ~ 7895729 (-)
si:dkey-220k22.3 NA other downstream 726571 7649293 ~ 7656124 (-)
G382719 cit other downstream 1022724 7275671 ~ 7359971 (-)
G383467 h2afx,LOC106516344,LOC107677420,LOC104950138,LOC100693699,LOC108260105,LOC106527800 other upstream 68004 8466359 ~ 8467012 (-)
timm8b timm8b,LOC107598437,LOC107717885 other upstream 439323 8837678 ~ 8839764 (-)
LOC113531288 NA other upstream 521055 8919410 ~ 9008686 (-)
ubash3ba ubash3b,ubash3ba,LOC108259961,LOC106602883,LOC107597727,LOC101074361 other upstream 622360 9020715 ~ 9070259 (-)
f11r.1 f11r other upstream 675397 9073752 ~ 9084084 (-)

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