LOC117596585



Basic Information


Item Value
gene id LOC117596585
gene name NA
gene type non-coding
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_047624.1
NCBI id CM018570.1
chromosome length 11744058
location 7262801 ~ 7268416 (+)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence


>XR_004577633.1
gaaacgagcatTGACTGATGTTCAGTAAGGACCTAACCTTTCCGTTTTGAGTTAATGTCGTGTTGTTGGTTTGTAAAAGTGTTCTGTACTTTAGGGCCACTGTAATTTTGGGTTTGCAATCAGTTACAACCGCAATGATCAAAAAATTTTTGTGAAAACAGTCACTGCGAGTGCCGTATGCTCATGGCAATACATCATCTGGACTCaaacccctaatctcttgtttctcagcccagttcctaactactgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcttgggatcatgtgtgtatttttttcttttaaatcccagAGAGCCACTTGTAGTTAgacagctgtggttagacaccatgttacaactacatctgaaaataaagagcacttggaGAGAGTAATACTCCCAGGGTTGCCAACTCTCATACATTTGGCGTGAGACACACTTTCAGGCTCTGTTTCATGTTCTTACGCTGCCTAAGTAAATCTTGTGCCAAATTAAATAACAAGCCAGCGTAAAAACACAATATGGTCTCAAATTTgctcatatgatttttttttctgtcagcatGAAGAAGGTGTGGGGTTTAATTAAACCAGTGGAGCCCCACAACTTTTTGATTGGACCAGTCTGAAGCAGCTGGGTTCTGTACCAGCCATATTTCTTATTGCTCTGTCCAAAGTCACTGAGCAAAATGAAGATGGTGCTGGAGAAGACAGAGGACAGTGGATTAGGTACCTATAGGAAGACAGAAGATAAATCCGATCACTGTGAAACTATGGAGTTCTGAAGGCTGGTTCACAGATTTCTGGATATGGGCCTAACTACAGGGACCAACTGCTGCACTGCAGAGGCCATATTTAGTAAAATGCATGAGGTGCTGCAAAGTTACATCACATGGACCAGTTGTGTGGCTCTTGCAGTTTACAATGCCAGTGTCAACAGGGGTATCAGAAATTCAGGTAGGAGCAGGGTCCTGGACCAGAATCCTTCTGTATTTGTCCTAGGCTGTCCCTGCCACATTGTACACAATAATGCACATGCTGGAGGGTTGCTGTATTCAGAAGTAATCGCCTGGAAGTCACAATGTTAGCTGTGTTTAGATCTTGTTTATAATTTCTATTTTAGGGAGTGATTTGACATACAGTAATATGACTAACATAATGTTTTGCTTTCCCCAGATATCAGGCTTTGATGTTCAGGATTTTTGTATTGATCTTGTGTACTGGTTCAAATCcagcacaaagagaaagaacatGCTTGATGGCAAATTATCACTGCATAATGCATTTATTGTACTGTGAGAGTATTGTGAGAATCagaaatggcaatcatttaTTGAAGGGCCAtactacttttatttatttatatatataatgtgtgtgtgtatatatacattttagagttctgtgtgttttgtgacacAAAGTACATGGACGAACTGCAGCATTTGAGCATTAGGTGGCTCAGTTTGGACCTAGCTGTGAACTGTATACTCCGTCTCTACAATGCTATTTTAGATCCACAGAGACAAGACCCACACCTCCATCCCCTTTCATGGGCAGACCTCCAGCTTGGCCCTACGACTGACAAGCGCCACTGTGAGAAGGCTGCATGAGGCTGGCGAAATTCCCTCCAGTGATGTTGCAAACCTCTACATAGCAGCAATGGGCTTTCTGGTGAGGTCTACAGAGTATACCTTGACAAAGCTGCCACTGAATGACACAATTCTCTCACATGCTCAGTTTGTGGACTTCAGGCAGAGACTGGACACCAAAAGGGATGATGTGCTTTACTTTGTCCAACGGTGAACAAATTAACCCTGTTTGACTATACCAATAATCTGAGTGATTTGGAGTGGAGGCTGGCTCTACCAGCTACTGTAATGGTCTCCTTCTGCCATTTGACGATGCCAGAGAACAGGACAGCATGGGTGAGGAGTTCCTGGATTTTCAAATGCTAGAAGACACCAACATCCCTGAAAGGGTCTGGAAAACTGCCCTGGTCAAGGTGGATGGGGAGAAAGAATTCTACTGAACGGACATCATAAGGGCACACTTAAGTGCCATGCCGTTTAACAGGTGCACCCAGGTTCCAAAGACTTGTGAAAGTGACACAGCTTCTGTTCTGCCTACCACACTCAAATGCAGACTCTGAGAAAACATTCTGTGATAGGCCTCAACAAAACTGAAGCAAGTAAAAAATTATCACTAGAGGGTACATTGTCCTCTGTAATGTGTATCAAGATGACCCAGATGGAACCATGCTACAAATATGAGCCACCTCTGCAGATGATTAAAAACTCAGTCTGCAGCTTCAGAATACAACAAAGAACATTCAGCAAAATAGGTTGATAAAACATCAGGAAAAGGTCTTTCCTATTTTACTTCAAAAGAAAAGCATGAattgtaaatttacatttacattgttttcatGACCGTTAGGCATATTTTACCCCCTAATTCTCATTTCTGAACAGCAAAAAAGGTAATTTGATTCATAAATCTCAATCCAGCCTGGTAGCCAAAGTCAGCAACCCTGTAGTACAGAATGTgcagatttctttaaaatgatcagttatCAGTTTTTTTATACTTACTTATCCACACTTCTCAATACTATGTTCAGTCTTTCGAAACTCTTCACATAGTTGGGTTAACCAGAGTGCAGGTCAGTACAGCAGTTAACCTCACATCTATAATGCACTATAACTAACGAAACACTTCATATACGCCTCAAAACCAACTCATTCTACCAAAACACTAGCAAAGCATCTCTCGCCCAACAACCTATAGCTGGAGTATACTGGAAACACACCCTGGATTGTACACCAGTCAACTGcagtaaccacacacacacaaaatgataaCAAagagcaatttatcttagccagtccacctactggcatgttttaggaGGAGGCATGAAgccagaggaaacctacatggacatggggagaacaagcacagaaactccacacagatgggaccccgagctcaggattgaagcgggaaccctggagctgtgaggagacaacgctacccactgcatcaccacGCTGCTTACAGGTCCACAGATTTCCCCTTTTGTATAGATGGTAATGAAGTGATAAAGAGAACACCTGGGTAAGGCTAAATTGGAAATAATCtatggtttgtttgtttattcttcacaatcttaatttttattactatagaaTGTATCgatttgtttggatttgatCTTGTATTGATTAGTTTTTGAAAActatatgtgaatatgtgaaaaataatttgtagaTACACAGATTTGTTGGTTGAgtttgagtgagaaaagaattcATGGATTTTGAAAGCTGAGGTTATTCAATCCTTTGtgtcaaagcaataaaaattgaTACACAGTTCAGTTCAAA
>XR_004577634.1
tgcaagtccgactctctgtCCATTAGCCCCCTAATAGCCCCCTGTCTTACGAATGAACTAGTGAAGAACGTCTGCAATCAGCATTTTACATTAGCTACTGAGGGGTCCAACGATACTGGAAGACAGAAGATAAATCCGATCACTGTGAAACTATGGAGTTCTGAAGGCTGGTTCACAGATTTCTGGATATGGGCCTAACTACAGGGACCAACTGCTGCACTGCAGAGGCCATATTTAGTAAAATGCATGAGGTGCTGCAAAGTTACATCACATGGACCAGTTGTGTGGCTCTTGCAGTTTACAATGCCAGTGTCAACAGGGGTATCAGAAATTCAGGTAGGAGCAGGGTCCTGGACCAGAATCCTTCTGTATTTGTCCTAGGCTGTCCCTGCCACATTGTACACAATAATGCACATGCTGGAGGGTTGCTGTATTCAGAAGTAATCGCCTGGAAGTCACAATGTTAGCTGTGTTTAGATCTTGTTTATAATTTCTATTTTAGGGAGTGATTTGACATACAGTAATATGACTAACATAATGTTTTGCTTTCCCCAGATATCAGGCTTTGATGTTCAGGATTTTTGTATTGATCTTGTGTACTGGTTCAAATCcagcacaaagagaaagaacatGCTTGATGGCAAATTATCACTGCATAATGCATTTATTGTACTGTGAGAGTATTGTGAGAATCagaaatggcaatcatttaTTGAAGGGCCAtactacttttatttatttatatatataatgtgtgtgtgtatatatacattttagagttctgtgtgttttgtgacacAAAGTACATGGACGAACTGCAGCATTTGAGCATTAGGTGGCTCAGTTTGGACCTAGCTGTGAACTGTATACTCCGTCTCTACAATGCTATTTTAGATCCACAGAGACAAGACCCACACCTCCATCCCCTTTCATGGGCAGACCTCCAGCTTGGCCCTACGACTGACAAGCGCCACTGTGAGAAGGCTGCATGAGGCTGGCGAAATTCCCTCCAGTGATGTTGCAAACCTCTACATAGCAGCAATGGGCTTTCTGGTGAGGTCTACAGAGTATACCTTGACAAAGCTGCCACTGAATGACACAATTCTCTCACATGCTCAGTTTGTGGACTTCAGGCAGAGACTGGACACCAAAAGGGATGATGTGCTTTACTTTGTCCAACGGTGAACAAATTAACCCTGTTTGACTATACCAATAATCTGAGTGATTTGGAGTGGAGGCTGGCTCTACCAGCTACTGTAATGGTCTCCTTCTGCCATTTGACGATGCCAGAGAACAGGACAGCATGGGTGAGGAGTTCCTGGATTTTCAAATGCTAGAAGACACCAACATCCCTGAAAGGGTCTGGAAAACTGCCCTGGTCAAGGTGGATGGGGAGAAAGAATTCTACTGAACGGACATCATAAGGGCACACTTAAGTGCCATGCCGTTTAACAGGTGCACCCAGGTTCCAAAGACTTGTGAAAGTGACACAGCTTCTGTTCTGCCTACCACACTCAAATGCAGACTCTGAGAAAACATTCTGTGATAGGCCTCAACAAAACTGAAGCAAGTAAAAAATTATCACTAGAGGGTACATTGTCCTCTGTAATGTGTATCAAGATGACCCAGATGGAACCATGCTACAAATATGAGCCACCTCTGCAGATGATTAAAAACTCAGTCTGCAGCTTCAGAATACAACAAAGAACATTCAGCAAAATAGGTTGATAAAACATCAGGAAAAGGTCTTTCCTATTTTACTTCAAAAGAAAAGCATGAattgtaaatttacatttacattgttttcatGACCGTTAGGCATATTTTACCCCCTAATTCTCATTTCTGAACAGCAAAAAAGGTAATTTGATTCATAAATCTCAATCCAGCCTGGTAGCCAAAGTCAGCAACCCTGTAGTACAGAATGTgcagatttctttaaaatgatcagttatCAGTTTTTTTATACTTACTTATCCACACTTCTCAATACTATGTTCAGTCTTTCGAAACTCTTCACATAGTTGGGTTAACCAGAGTGCAGGTCAGTACAGCAGTTAACCTCACATCTATAATGCACTATAACTAACGAAACACTTCATATACGCCTCAAAACCAACTCATTCTACCAAAACACTAGCAAAGCATCTCTCGCCCAACAACCTATAGCTGGAGTATACTGGAAACACACCCTGGATTGTACACCAGTCAACTGcagtaaccacacacacacaaaatgataaCAAagagcaatttatcttagccagtccacctactggcatgttttaggaGGAGGCATGAAgccagaggaaacctacatggacatggggagaacaagcacagaaactccacacagatgggaccccgagctcaggattgaagcgggaaccctggagctgtgaggagacaacgctacccactgcatcaccacGCTGCTTACAGGTCCACAGATTTCCCCTTTTGTATAGATGGTAATGAAGTGATAAAGAGAACACCTGGGTAAGGCTAAATTGGAAATAATCtatggtttgtttgtttattcttcacaatcttaatttttattactatagaaTGTATCgatttgtttggatttgatCTTGTATTGATTAGTTTTTGAAAActatatgtgaatatgtgaaaaataatttgtagaTACACAGATTTGTTGGTTGAgtttgagtgagaaaagaattcATGGATTTTGAAAGCTGAGGTTATTCAATCCTTTGtgtcaaagcaataaaaattgaTACACAGTTCAGTTCAAA
>XR_004577635.1
gaaacgagcatTGACTGATGTTCAGTAAGGACCTAACCTTTCCGTTTTGAGTTAATGTCGTGTTGTTGGTTTGTAAAAGTGTTCTGTACTTTAGGGCCACTGTAATTTTGGGTTTGCAATCAGTTACAACCGCAATGATCAAAAAATTTTTGTGAAAACAGTCACTGCGAGTGCCGTATGCTCATGGCAATACATCATCTGGACTCaaacccctaatctcttgtttctcagcccagttcctaactactgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcttgggatcatgtgtgtatttttttcttttaaatcccagAGAGCCACTTGTAGTTAgacagctgtggttagacaccatgttacaactacatctgaaaataaagagcacttggaGAGAGTAATACTCCCAGGGTTGCCAACTCTCATACATTTGGCGTGAGACACACTTTCAGGCTCTGTTTCATGTTCTTACGCTGCCTAAGTAAATCTTGTGCCAAATTAAATAACAAGCCAGCGTAAAAACACAATATGGTCTCAAATTTgctcatatgatttttttttctgtcagcatGAAGAAGGTGTGGGGTTTAATTAAACCAGTGGAGCCCCACAACTTTTTGATTGGACCAGTCTGAAGCAGCTGGGTTCTGTACCAGCCATATTTCTTATTGCTCTGTCCAAAGTCACTGAGCAAAATGAAGATGGTGCTGGAGAAGACAGAGGACAGTGGATTAGGAAGACAGAAGATAAATCCGATCACTGTGAAACTATGGAGTTCTGAAGGCTGGTTCACAGATTTCTGGATATGGGCCTAACTACAGGGACCAACTGCTGCACTGCAGAGGCCATATTTAGTAAAATGCATGAGGTGCTGCAAAGTTACATCACATGGACCAGTTGTGTGGCTCTTGCAGTTTACAATGCCAGTGTCAACAGGGGTATCAGAAATTCAGGTAGGAGCAGGGTCCTGGACCAGAATCCTTCTGTATTTGTCCTAGGCTGTCCCTGCCACATTGTACACAATAATGCACATGCTGGAGGGTTGCTGTATTCAGAAGTAATCGCCTGGAAGTCACAATGTTAGCTGTGTTTAGATCTTGTTTATAATTTCTATTTTAGGGAGTGATTTGACATACAGTAATATGACTAACATAATGTTTTGCTTTCCCCAGATATCAGGCTTTGATGTTCAGGATTTTTGTATTGATCTTGTGTACTGGTTCAAATCcagcacaaagagaaagaacatGCTTGATGGCAAATTATCACTGCATAATGCATTTATTGTACTGTGAGAGTATTGTGAGAATCagaaatggcaatcatttaTTGAAGGGCCAtactacttttatttatttatatatataatgtgtgtgtgtatatatacattttagagttctgtgtgttttgtgacacAAAGTACATGGACGAACTGCAGCATTTGAGCATTAGGTGGCTCAGTTTGGACCTAGCTGTGAACTGTATACTCCGTCTCTACAATGCTATTTTAGATCCACAGAGACAAGACCCACACCTCCATCCCCTTTCATGGGCAGACCTCCAGCTTGGCCCTACGACTGACAAGCGCCACTGTGAGAAGGCTGCATGAGGCTGGCGAAATTCCCTCCAGTGATGTTGCAAACCTCTACATAGCAGCAATGGGCTTTCTGGTGAGGTCTACAGAGTATACCTTGACAAAGCTGCCACTGAATGACACAATTCTCTCACATGCTCAGTTTGTGGACTTCAGGCAGAGACTGGACACCAAAAGGGATGATGTGCTTTACTTTGTCCAACGGTGAACAAATTAACCCTGTTTGACTATACCAATAATCTGAGTGATTTGGAGTGGAGGCTGGCTCTACCAGCTACTGTAATGGTCTCCTTCTGCCATTTGACGATGCCAGAGAACAGGACAGCATGGGTGAGGAGTTCCTGGATTTTCAAATGCTAGAAGACACCAACATCCCTGAAAGGGTCTGGAAAACTGCCCTGGTCAAGGTGGATGGGGAGAAAGAATTCTACTGAACGGACATCATAAGGGCACACTTAAGTGCCATGCCGTTTAACAGGTGCACCCAGGTTCCAAAGACTTGTGAAAGTGACACAGCTTCTGTTCTGCCTACCACACTCAAATGCAGACTCTGAGAAAACATTCTGTGATAGGCCTCAACAAAACTGAAGCAAGTAAAAAATTATCACTAGAGGGTACATTGTCCTCTGTAATGTGTATCAAGATGACCCAGATGGAACCATGCTACAAATATGAGCCACCTCTGCAGATGATTAAAAACTCAGTCTGCAGCTTCAGAATACAACAAAGAACATTCAGCAAAATAGGTTGATAAAACATCAGGAAAAGGTCTTTCCTATTTTACTTCAAAAGAAAAGCATGAattgtaaatttacatttacattgttttcatGACCGTTAGGCATATTTTACCCCCTAATTCTCATTTCTGAACAGCAAAAAAGGTAATTTGATTCATAAATCTCAATCCAGCCTGGTAGCCAAAGTCAGCAACCCTGTAGTACAGAATGTgcagatttctttaaaatgatcagttatCAGTTTTTTTATACTTACTTATCCACACTTCTCAATACTATGTTCAGTCTTTCGAAACTCTTCACATAGTTGGGTTAACCAGAGTGCAGGTCAGTACAGCAGTTAACCTCACATCTATAATGCACTATAACTAACGAAACACTTCATATACGCCTCAAAACCAACTCATTCTACCAAAACACTAGCAAAGCATCTCTCGCCCAACAACCTATAGCTGGAGTATACTGGAAACACACCCTGGATTGTACACCAGTCAACTGcagtaaccacacacacacaaaatgataaCAAagagcaatttatcttagccagtccacctactggcatgttttaggaGGAGGCATGAAgccagaggaaacctacatggacatggggagaacaagcacagaaactccacacagatgggaccccgagctcaggattgaagcgggaaccctggagctgtgaggagacaacgctacccactgcatcaccacGCTGCTTACAGGTCCACAGATTTCCCCTTTTGTATAGATGGTAATGAAGTGATAAAGAGAACACCTGGGTAAGGCTAAATTGGAAATAATCtatggtttgtttgtttattcttcacaatcttaatttttattactatagaaTGTATCgatttgtttggatttgatCTTGTATTGATTAGTTTTTGAAAActatatgtgaatatgtgaaaaataatttgtagaTACACAGATTTGTTGGTTGAgtttgagtgagaaaagaattcATGGATTTTGAAAGCTGAGGTTATTCAATCCTTTGtgtcaaagcaataaaaattgaTACACAGTTCAGTTCAAA
>XR_004577636.1
CTATTTCAGTAAGTGTAATGTGTACAGTTGTTTTTGGGAGGATAATATCTCATATAATAATAAGGAGTTTCATACGAAAGCTGAGGTCAACGTTCCTGAAGCCTGTAGCTTTCAAAATGAcaactttagagactgttgaTCTTCTAGGACAAGAAAACCAACTGCCAGACCTCCAGCTTGGCCCTACGACTGACAAGCGCCACTGTGAGAAGGCTGCATGAGGCTGGCGAAATTCCCTCCAGTGATGTTGCAAACCTCTACATAGCAGCAATGGGCTTTCTGGTGAGGTCTACAGAGTATACCTTGACAAAGCTGCCACTGAATGACACAATTCTCTCACATGCTCAGTTTGTGGACTTCAGGCAGAGACTGGACACCAAAAGGGATGATGTGCTTTACTTTGTCCAACGGTGAACAAATTAACCCTGTTTGACTATACCAATAATCTGAGTGATTTGGAGTGGAGGCTGGCTCTACCAGCTACTGTAATGGTCTCCTTCTGCCATTTGACGATGCCAGAGAACAGGACAGCATGGGTGAGGAGTTCCTGGATTTTCAAATGCTAGAAGACACCAACATCCCTGAAAGGGTCTGGAAAACTGCCCTGGTCAAGGTGGATGGGGAGAAAGAATTCTACTGAACGGACATCATAAGGGCACACTTAAGTGCCATGCCGTTTAACAGGTGCACCCAGGTTCCAAAGACTTGTGAAAGTGACACAGCTTCTGTTCTGCCTACCACACTCAAATGCAGACTCTGAGAAAACATTCTGTGATAGGCCTCAACAAAACTGAAGCAAGTAAAAAATTATCACTAGAGGGTACATTGTCCTCTGTAATGTGTATCAAGATGACCCAGATGGAACCATGCTACAAATATGAGCCACCTCTGCAGATGATTAAAAACTCAGTCTGCAGCTTCAGAATACAACAAAGAACATTCAGCAAAATAGGTTGATAAAACATCAGGAAAAGGTCTTTCCTATTTTACTTCAAAAGAAAAGCATGAattgtaaatttacatttacattgttttcatGACCGTTAGGCATATTTTACCCCCTAATTCTCATTTCTGAACAGCAAAAAAGGTAATTTGATTCATAAATCTCAATCCAGCCTGGTAGCCAAAGTCAGCAACCCTGTAGTACAGAATGTgcagatttctttaaaatgatcagttatCAGTTTTTTTATACTTACTTATCCACACTTCTCAATACTATGTTCAGTCTTTCGAAACTCTTCACATAGTTGGGTTAACCAGAGTGCAGGTCAGTACAGCAGTTAACCTCACATCTATAATGCACTATAACTAACGAAACACTTCATATACGCCTCAAAACCAACTCATTCTACCAAAACACTAGCAAAGCATCTCTCGCCCAACAACCTATAGCTGGAGTATACTGGAAACACACCCTGGATTGTACACCAGTCAACTGcagtaaccacacacacacaaaatgataaCAAagagcaatttatcttagccagtccacctactggcatgttttaggaGGAGGCATGAAgccagaggaaacctacatggacatggggagaacaagcacagaaactccacacagatgggaccccgagctcaggattgaagcgggaaccctggagctgtgaggagacaacgctacccactgcatcaccacGCTGCTTACAGGTCCACAGATTTCCCCTTTTGTATAGATGGTAATGAAGTGATAAAGAGAACACCTGGGTAAGGCTAAATTGGAAATAATCtatggtttgtttgtttattcttcacaatcttaatttttattactatagaaTGTATCgatttgtttggatttgatCTTGTATTGATTAGTTTTTGAAAActatatgtgaatatgtgaaaaataatttgtagaTACACAGATTTGTTGGTTGAgtttgagtgagaaaagaattcATGGATTTTGAAAGCTGAGGTTATTCAATCCTTTGtgtcaaagcaataaaaattgaTACACAGTTCAGTTCAAA
>XR_004577637.1
gaaacgagcatTGACTGATGTTCAGTAAGGACCTAACCTTTCCGTTTTGAGTTAATGTCGTGTTGTTGGTTTGTAAAAGTGTTCTGTACTTTAGGGCCACTGTAATTTTGGGTTTGCAATCAGTTACAACCGCAATGATCAAAAAATTTTTGTGAAAACAGTCACTGCGAGTGCCGTATGCTCATGGCAATACATCATCTGGACTCaaacccctaatctcttgtttctcagcccagttcctaactactgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcttgggatcatgtgtgtatttttttcttttaaatcccagAGAGCCACTTGTAGTTAgacagctgtggttagacaccatgttacaactacatctgaaaataaagagcacttggaGAGAGTAATACTCCCAGGGTTGCCAACTCTCATACATTTGGCGTGAGACACACTTTCAGGCTCTGTTTCATGTTCTTACGCTGCCTAAGTAAATCTTGTGCCAAATTAAATAACAAGCCAGCGTAAAAACACAATATGGTCTCAAATTTgctcatatgatttttttttctgtcagcatGAAGAAGGTGTGGGGTTTAATTAAACCAGTGGAGCCCCACAACTTTTTGATTGGACCAGTCTGAAGCAGCTGGGTTCTGTACCAGCCATATTTCTTATTGCTCTGTCCAAAGTCACTGAGCAAAATGAAGATGGTGCTGGAGAAGACAGAGGACAGTGGATTAGGTACCTATAGGAAGACAGAAGATAAATCCGATCACTGTGAAACTATGGAGTTCTGAAGGCTGGTTCACAGATTTCTGGATATGGGCCTAACTACAGGGACCAACTGCTGCACTGCAGAGGCCATATTTAGTAAAATGCATGAGGTGCTGCAAAGTTACATCACATGGACCAGTTGTGTGGCTCTTGCAGTTTACAATGCCAGTGTCAACAGGGGTATCAGAAATTCAGGTAGGAGCAGGGTCCTGGACCAGAATCCTTCTGTATTTGTCCTAGGCTGTCCCTGCCACATTGTACACAATAATGCACATGCTGGAGGGTTGCTGTATTCAGAAATATCAGGCTTTGATGTTCAGGATTTTTGTATTGATCTTGTGTACTGGTTCAAATCcagcacaaagagaaagaacatGCTTGATGGCAAATTATCACTGCATAATGCATTTATTGTACTGTGAGAGTATTGTGAGAATCagaaatggcaatcatttaTTGAAGGGCCAtactacttttatttatttatatatataatgtgtgtgtgtatatatacattttagagttctgtgtgttttgtgacacAAAGTACATGGACGAACTGCAGCATTTGAGCATTAGGTGGCTCAGTTTGGACCTAGCTGTGAACTGTATACTCCGTCTCTACAATGCTATTTTAGATCCACAGAGACAAGACCCACACCTCCATCCCCTTTCATGGGCAGACCTCCAGCTTGGCCCTACGACTGACAAGCGCCACTGTGAGAAGGCTGCATGAGGCTGGCGAAATTCCCTCCAGTGATGTTGCAAACCTCTACATAGCAGCAATGGGCTTTCTGGTGAGGTCTACAGAGTATACCTTGACAAAGCTGCCACTGAATGACACAATTCTCTCACATGCTCAGTTTGTGGACTTCAGGCAGAGACTGGACACCAAAAGGGATGATGTGCTTTACTTTGTCCAACGGTGAACAAATTAACCCTGTTTGACTATACCAATAATCTGAGTGATTTGGAGTGGAGGCTGGCTCTACCAGCTACTGTAATGGTCTCCTTCTGCCATTTGACGATGCCAGAGAACAGGACAGCATGGGTGAGGAGTTCCTGGATTTTCAAATGCTAGAAGACACCAACATCCCTGAAAGGGTCTGGAAAACTGCCCTGGTCAAGGTGGATGGGGAGAAAGAATTCTACTGAACGGACATCATAAGGGCACACTTAAGTGCCATGCCGTTTAACAGGTGCACCCAGGTTCCAAAGACTTGTGAAAGTGACACAGCTTCTGTTCTGCCTACCACACTCAAATGCAGACTCTGAGAAAACATTCTGTGATAGGCCTCAACAAAACTGAAGCAAGTAAAAAATTATCACTAGAGGGTACATTGTCCTCTGTAATGTGTATCAAGATGACCCAGATGGAACCATGCTACAAATATGAGCCACCTCTGCAGATGATTAAAAACTCAGTCTGCAGCTTCAGAATACAACAAAGAACATTCAGCAAAATAGGTTGATAAAACATCAGGAAAAGGTCTTTCCTATTTTACTTCAAAAGAAAAGCATGAattgtaaatttacatttacattgttttcatGACCGTTAGGCATATTTTACCCCCTAATTCTCATTTCTGAACAGCAAAAAAGGTAATTTGATTCATAAATCTCAATCCAGCCTGGTAGCCAAAGTCAGCAACCCTGTAGTACAGAATGTgcagatttctttaaaatgatcagttatCAGTTTTTTTATACTTACTTATCCACACTTCTCAATACTATGTTCAGTCTTTCGAAACTCTTCACATAGTTGGGTTAACCAGAGTGCAGGTCAGTACAGCAGTTAACCTCACATCTATAATGCACTATAACTAACGAAACACTTCATATACGCCTCAAAACCAACTCATTCTACCAAAACACTAGCAAAGCATCTCTCGCCCAACAACCTATAGCTGGAGTATACTGGAAACACACCCTGGATTGTACACCAGTCAACTGcagtaaccacacacacacaaaatgataaCAAagagcaatttatcttagccagtccacctactggcatgttttaggaGGAGGCATGAAgccagaggaaacctacatggacatggggagaacaagcacagaaactccacacagatgggaccccgagctcaggattgaagcgggaaccctggagctgtgaggagacaacgctacccactgcatcaccacGCTGCTTACAGGTCCACAGATTTCCCCTTTTGTATAGATGGTAATGAAGTGATAAAGAGAACACCTGGGTAAGGCTAAATTGGAAATAATCtatggtttgtttgtttattcttcacaatcttaatttttattactatagaaTGTATCgatttgtttggatttgatCTTGTATTGATTAGTTTTTGAAAActatatgtgaatatgtgaaaaataatttgtagaTACACAGATTTGTTGGTTGAgtttgagtgagaaaagaattcATGGATTTTGAAAGCTGAGGTTATTCAATCCTTTGtgtcaaagcaataaaaattgaTACACAGTTCAGTTCAAA
>XR_004577638.1
gaaacgagcatTGACTGATGTTCAGTAAGGACCTAACCTTTCCGTTTTGAGTTAATGTCGTGTTGTTGGTTTGTAAAAGTGTTCTGTACTTTAGGGCCACTGTAATTTTGGGTTTGCAATCAGTTACAACCGCAATGATCAAAAAATTTTTGTGAAAACAGTCACTGCGAGTGCCGTATGCTCATGGCAATACATCATCTGGACTCaaacccctaatctcttgtttctcagcccagttcctaactactgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtcttgggatcatgtgtgtatttttttcttttaaatcccagAGAGCCACTTGTAGTTAgacagctgtggttagacaccatgttacaactacatctgaaaataaagagcacttggaGAGAGTAATACTCCCAGGGTTGCCAACTCTCATACATTTGGCGTGAGACACACTTTCAGGCTCTGTTTCATGTTCTTACGCTGCCTAAGTAAATCTTGTGCCAAATTAAATAACAAGCCAGCGTAAAAACACAATATGGTCTCAAATTTgctcatatgatttttttttctgtcagcatGAAGAAGGTGTGGGGTTTAATTAAACCAGTGGAGCCCCACAACTTTTTGATTGGACCAGTCTGAAGCAGCTGGGTTCTGTACCAGCCATATTTCTTATTGCTCTGTCCAAAGTCACTGAGCAAAATGAAGATGGTGCTGGAGAAGACAGAGGACAGTGGATTAGGTACCTATAGGAAGACAGAAGATAAATCCGATCACTGTGAAACTATGGAGTTCTGAAGGCTGGTTCACAGATTTCTGGATATGGGCCTAACTACAGGGACCAACTGCTGCACTGCAGAGGCCATATTTAGTAAAATGCATGAGGTGCTGCAAAGTTACATCACATGGACCAGTTGTGTGGCTCTTGCAGTTTACAATGCCAGTGTCAACAGGGGTATCAGAAATTCAGagttctgtgtgttttgtgacacAAAGTACATGGACGAACTGCAGCATTTGAGCATTAGGTGGCTCAGTTTGGACCTAGCTGTGAACTGTATACTCCGTCTCTACAATGCTATTTTAGATCCACAGAGACAAGACCCACACCTCCATCCCCTTTCATGGGCAGACCTCCAGCTTGGCCCTACGACTGACAAGCGCCACTGTGAGAAGGCTGCATGAGGCTGGCGAAATTCCCTCCAGTGATGTTGCAAACCTCTACATAGCAGCAATGGGCTTTCTGGTGAGGTCTACAGAGTATACCTTGACAAAGCTGCCACTGAATGACACAATTCTCTCACATGCTCAGTTTGTGGACTTCAGGCAGAGACTGGACACCAAAAGGGATGATGTGCTTTACTTTGTCCAACGGTGAACAAATTAACCCTGTTTGACTATACCAATAATCTGAGTGATTTGGAGTGGAGGCTGGCTCTACCAGCTACTGTAATGGTCTCCTTCTGCCATTTGACGATGCCAGAGAACAGGACAGCATGGGTGAGGAGTTCCTGGATTTTCAAATGCTAGAAGACACCAACATCCCTGAAAGGGTCTGGAAAACTGCCCTGGTCAAGGTGGATGGGGAGAAAGAATTCTACTGAACGGACATCATAAGGGCACACTTAAGTGCCATGCCGTTTAACAGGTGCACCCAGGTTCCAAAGACTTGTGAAAGTGACACAGCTTCTGTTCTGCCTACCACACTCAAATGCAGACTCTGAGAAAACATTCTGTGATAGGCCTCAACAAAACTGAAGCAAGTAAAAAATTATCACTAGAGGGTACATTGTCCTCTGTAATGTGTATCAAGATGACCCAGATGGAACCATGCTACAAATATGAGCCACCTCTGCAGATGATTAAAAACTCAGTCTGCAGCTTCAGAATACAACAAAGAACATTCAGCAAAATAGGTTGATAAAACATCAGGAAAAGGTCTTTCCTATTTTACTTCAAAAGAAAAGCATGAattgtaaatttacatttacattgttttcatGACCGTTAGGCATATTTTACCCCCTAATTCTCATTTCTGAACAGCAAAAAAGGTAATTTGATTCATAAATCTCAATCCAGCCTGGTAGCCAAAGTCAGCAACCCTGTAGTACAGAATGTgcagatttctttaaaatgatcagttatCAGTTTTTTTATACTTACTTATCCACACTTCTCAATACTATGTTCAGTCTTTCGAAACTCTTCACATAGTTGGGTTAACCAGAGTGCAGGTCAGTACAGCAGTTAACCTCACATCTATAATGCACTATAACTAACGAAACACTTCATATACGCCTCAAAACCAACTCATTCTACCAAAACACTAGCAAAGCATCTCTCGCCCAACAACCTATAGCTGGAGTATACTGGAAACACACCCTGGATTGTACACCAGTCAACTGcagtaaccacacacacacaaaatgataaCAAagagcaatttatcttagccagtccacctactggcatgttttaggaGGAGGCATGAAgccagaggaaacctacatggacatggggagaacaagcacagaaactccacacagatgggaccccgagctcaggattgaagcgggaaccctggagctgtgaggagacaacgctacccactgcatcaccacGCTGCTTACAGGTCCACAGATTTCCCCTTTTGTATAGATGGTAATGAAGTGATAAAGAGAACACCTGGGTAAGGCTAAATTGGAAATAATCtatggtttgtttgtttattcttcacaatcttaatttttattactatagaaTGTATCgatttgtttggatttgatCTTGTATTGATTAGTTTTTGAAAActatatgtgaatatgtgaaaaataatttgtagaTACACAGATTTGTTGGTTGAgtttgagtgagaaaagaattcATGGATTTTGAAAGCTGAGGTTATTCAATCCTTTGtgtcaaagcaataaaaattgaTACACAGTTCAGTTCAAA

Function


GO: NA

KEGG: NA

RNA


RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
XR_004577633.1 True 3395 lncRNA 0.41 5 7262801 7268416
XR_004577634.1 False 2768 lncRNA 0.41 5 7264797 7268416
XR_004577635.1 False 3385 lncRNA 0.41 5 7262801 7268416
XR_004577636.1 False 1997 lncRNA 0.41 3 7266118 7268416
XR_004577637.1 False 3280 lncRNA 0.41 6 7262801 7268416
XR_004577638.1 False 2954 lncRNA 0.42 6 7262801 7268416

Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
LOC117596544 LOC108261522,LOC108256778 coding upstream 677309 6494417 ~ 6585492 (+)
LOC117596543 LOC108256778 coding upstream 878577 6380073 ~ 6384224 (+)
LOC117596580 NA coding upstream 894018 6363164 ~ 6368783 (+)
ivns1abpa ivns1abp,ivns1abpa,LOC108256770,LOC107732388,LOC107553504,LOC107726450 coding upstream 1214279 6034549 ~ 6048522 (+)
arpc5b arpc5,arpc5b,LOC103045524,LOC107698380,LOC107599090,LOC107732423,LOC104921830 coding upstream 1352906 5903579 ~ 5909895 (+)
LOC113529075 LOC108275256,LOC108427497,LOC100690439 coding downstream 164072 7432488 ~ 7497053 (+)
nrl LOC108275247,LOC108427498 coding downstream 252032 7520448 ~ 7525893 (+)
LOC113528764 LOC108427476,LOC103026240,LOC108274573 coding downstream 261811 7530227 ~ 7546810 (+)
senp6a senp6 coding downstream 310849 7579265 ~ 7607340 (+)
myo6a myo6 coding downstream 343439 7611855 ~ 7726643 (+)
LOC117596602 NA non-coding upstream 53716 7208315 ~ 7209085 (+)
G409021 NA non-coding upstream 54727 7099297 ~ 7208074 (+)
LOC117596588 NA non-coding upstream 110244 7152037 ~ 7152557 (+)
LOC117596595 NA non-coding upstream 132821 7129305 ~ 7129980 (+)
LOC117596599 NA non-coding upstream 142817 7117232 ~ 7119984 (+)
G409280 NA non-coding downstream 68921 7337337 ~ 7340017 (+)
G409390 NA non-coding downstream 262509 7530925 ~ 7531296 (+)
G409602 NA non-coding downstream 610474 7878890 ~ 7879101 (+)
G409603 NA non-coding downstream 613751 7882167 ~ 7882388 (+)
LOC113528831 NA non-coding downstream 657778 7926194 ~ 7934506 (+)
LOC117596594 NA other upstream 191768 6764911 ~ 7071033 (+)
LOC117596573 LOC108280157 other upstream 523274 6613273 ~ 6739527 (+)
LOC117596581 NA other upstream 608783 6633365 ~ 6654018 (+)
G408929 NA other upstream 620303 6556363 ~ 6642498 (+)
LOC117596579 NA other upstream 825038 6394856 ~ 6437763 (+)
G409600 NA other downstream 609379 7877795 ~ 7878545 (+)
LOC113529148 NA other downstream 1829961 9098377 ~ 9104224 (+)
G410936 snx3 other downstream 2909633 10178049 ~ 10182672 (+)
afg1lb lace1 other downstream 2929300 10197716 ~ 10230807 (+)
armc2 armc2 other downstream 2967565 10235981 ~ 10295205 (+)

Expression



Co-expression Network