G36535


Basic Information

Item Value
gene id G36535
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000005
NCBI id null
chromosome length 7630583
location 1705218 ~ 1720596 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU41499
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GAGG

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU41499 True 15004 lncRNA 0.36 3 1705218 1720596

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
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CI01000005_01674196_01674495 NA coding downstream 30723 1673439 ~ 1674495 (-)
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CI01000005_01250101_01298320 MYOM2 coding downstream 406898 1248838 ~ 1298320 (-)
CI01000005_00700274_00704932 NA coding downstream 1000286 699474 ~ 704932 (-)
CI01000005_01723641_01729676 NA coding upstream 2742 1723338 ~ 1730336 (-)
CI01000005_01761513_01769840 NA coding upstream 40591 1761187 ~ 1769851 (-)
CI01000005_01883894_01899867 NA coding upstream 162626 1883222 ~ 1899867 (-)
CI01000005_01924855_01938284 NA coding upstream 204082 1924678 ~ 1938284 (-)
CI01000005_01944678_01957016 NA coding upstream 223365 1943961 ~ 1957016 (-)
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G36619 NA non-coding downstream 65300 1639699 ~ 1639918 (-)
G36614 NA non-coding downstream 87583 1617139 ~ 1617635 (-)
G36631 NA non-coding upstream 47327 1767923 ~ 1768347 (-)
G36640 NA non-coding upstream 58277 1778873 ~ 1779086 (-)
G36525 NA non-coding upstream 157965 1878561 ~ 1879486 (-)
G36523 NA non-coding upstream 193249 1913845 ~ 1917676 (-)
G36517 NA non-coding upstream 201819 1922415 ~ 2001557 (-)
G36628 NA other downstream 40939 1663267 ~ 1664279 (-)
G36049 NA other downstream 661546 1021295 ~ 1043672 (-)
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G39515 NA other upstream 4113196 5833792 ~ 5834539 (-)
CI01000005_06481721_06483251 NA other upstream 4760093 6481355 ~ 6483265 (-)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location
eurasian perch (Perca fluviatilis) G231514 LOC101480717,LOC102290810,LOC102794459 unknown NC_053135.1 CM020932.1 2096875 ~ 2098749 (+)
striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus) G322744 NA non-coding NC_047615.1 CM018561.1 18811105 ~ 18812335 (+)
mexican tetra (Astyanax mexicanus) G231003 NA unknown NW_019170761.1 APWO02000359.1 18507 ~ 22440 (+)
mexican tetra (Astyanax mexicanus) G53185 LOC108430338 non-coding NC_035902.1 CM008305.1 18778714 ~ 18786708 (-)