XLOC_000783


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_000783
gene name NA
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007112.7
NCBI id CM002885.2
chromosome length 59578282
location 56819153 ~ 56900288 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

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ko03200 Viral proteins

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000096543

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00003245 False 723 lncRNA 0.40 3 56819153 56900288
TCONS_00003244 False 723 lncRNA 0.40 3 56819153 56900288
TCONS_00003247 False 14066 lncRNA 0.38 1 56858475 56872540
TCONS_00003248 False 746 lncRNA 0.40 3 56858489 56900288
TCONS_00001272 False 974 mRNA 0.43 5 56859745 56864253
TCONS_00003249 True 526 lncRNA 0.42 2 56871767 56872540

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_000782 si:dkey-27j5.6 coding upstream 2458 56813845 ~ 56816695 (+)
XLOC_000781 NA coding upstream 11551 56806134 ~ 56807602 (+)
XLOC_000780 si:ch211-1f22.3 coding upstream 13727 56801021 ~ 56805426 (+)
XLOC_000779 FO680692.1 coding upstream 32232 56779495 ~ 56786921 (+)
XLOC_000778 CABZ01049362.1 coding upstream 49826 56768263 ~ 56769327 (+)
XLOC_000791 si:ch211-152f2.3 coding downstream 292 56900580 ~ 56904810 (+)
XLOC_000792 si:ch211-1f22.9 coding downstream 19454 56919742 ~ 56922160 (+)
XLOC_000793 si:ch211-152f2.4 coding downstream 29585 56929873 ~ 56932578 (+)
XLOC_000794 NA coding downstream 39059 56939347 ~ 56944389 (+)
XLOC_000795 si:ch211-1f22.10 coding downstream 55061 56955349 ~ 56960001 (+)
XLOC_000776 NA non-coding upstream 135519 56669158 ~ 56683634 (+)
XLOC_000775 NA non-coding upstream 156502 56660197 ~ 56662651 (+)
XLOC_000774 NA non-coding upstream 215343 56569514 ~ 56603810 (+)
XLOC_000773 NA non-coding upstream 254801 56562827 ~ 56564352 (+)
XLOC_000801 NA non-coding downstream 215977 57116265 ~ 57120505 (+)
XLOC_000809 NA non-coding downstream 314005 57214293 ~ 57214954 (+)
XLOC_000815 NA non-coding downstream 508379 57408667 ~ 57436117 (+)
XLOC_000816 NA non-coding downstream 519060 57419348 ~ 57433416 (+)
XLOC_000772 NA non-coding upstream 214801 56561226 ~ 56604352 (+)

Expression


Co-expression Network