G216826


Basic Information

Item Value
gene id G216826
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000050
NCBI id null
chromosome length 7556436
location 7178673 ~ 7183925 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU245946
CACTGATAGAGAAAGCCATGTTGTTCTCATGTTAAACCTCACTTAACTTCTATAACGATTCCAGTTTGAAACTATAACTTAAAACTATATATTCCCAGTGTGGTGAGTAATTCATATATTGTTTAAGTGAATTGATCATTTCTGATATGTTGTAGATCGCTATTTGCGATTAGCGCCATTGCGCCTAAACGGCTAATTTTATACACTTGTATTTTGATGTTAGTGTAGACATTTACTGTTTTATATTGTTTGTTGAAATATTCATGCAATATATGTTGCATTTAGTTGGTAAACAAAGTTTAGTACGTGTTTGTGACACAGAGACTGTTCTAGAAATATGTGATAATGCTTAGTGCATATACGTAATATTTCCTGCCAATATGTGATATTAGCGTTATAGGGATTATTATATTTTGATTTATAAGCATATAATTTAATGCTTACAATCTAAAGCTGATGTTTAAATGTTTGTAGAAATTTATTTGGTGATGTGAACAATACTGGATAGTAATTGTGAATTGTTTTGTTTTACAGTTTGACCACACACACACACACACATATACACATAAATGTGCAAAAAATACTCAACTAAAACTACAACAACAACGACCAAATGTGTACATTGTGAGTTCTGCACGAGAGGAATAAAAGACAAAATCAAGATCTAAGTTAATGTTATCATTTCATGGGTAACAATAATGATTTAATAATAAAAAACTACATACATATAAAAATGCTTTAAAAAGAAAAAAAACTTGAGATTAATACTTGTTTTTAATAAACAGAGAATTACTTAAATTATGTAAACATACAAAATAGTATTGTATTGTTTTTTTTTTTTTTAAACATAAGGAATGTTTATTTTATATTGTATTTTAATATTTTATATTATATTTTATATTTTAATTTATTTTAGATTAGATTAGGTTAGATGACCTGGAAAAATGTGTCAACAATAAGCGAAACTGGAACATGAATTTACATTGAATTAAAAAAACAGTGAGGAATTTGTTTCTGCAATTCTGAACACCACTGCATGCTGAACAGAAAATATAATTCCACAGCTTTGGGAAAACATAAAAAACATCAGGGCTGTTTAATAGTGCAATATGACAATATGATATAATATATAATTGATATAATAAACAATCTGGCACCTGGCAATTACATATTTGCTCTAGACATGGGTTTTCAAACCTTTGCTAAAGACTCCTAAAGGCTTCGGGAATAGTTTGAGAAAGCAATCTCATCTGTCTTGCCTTGTGCCATCAGACAGAAATGCTGTCTGTTCCTCACGTGTTTGACTGCATGTTTCACACATGGCTGCCCAGTGAGCAGTTATGACATCACACTACACACCAGTATTGCATTAATTTTTTGTACTATGCTATTACACTCTGTGTTCACGCTGTGTTCACAATGTACCAAAGAACATCTTGAAAAAAATCACTTTTTTCAGGTGGTAACATGCTCAATGAAACAAAATTGCCCATATTTCATAAACATTCTAGAAATGCATGTTAAATATTTTTTAATTTTACATCATGGCGGTACTTTGTTTTACATATTTCAAAATCCTAAAGCTGTATGTTTATGTCTGTGTTTAAATGAATTCTGAAGTTTCAATGCTATCTCAAACATTTTGAATGTAGTACGTTCACAGTAACTAAAGTGGATTGCATTAATTCAGACTGGATGCATGACAGTGAATGGTTTGAAAATGGAGGAAGCAGTATTATGTAATTTTATATGTGTGAGTGCCAAAAGAGAAGGGCGTGTCAGTGTAATGATAAGTAGAGGTATTTATAGCCTCACAAGAGAAACAACAGATTTAGGCCATCAAGAGTATGTGTGTATGGCACAAGGACACAGTTGCATAATCACCACTAAGAAGCTCAATCCACAAAAAACACACATATACGCAAACACATAATTGTATACAATTATAGAAGGGGCCATTTGATGTGGACAGCTATGCTCATTAATGCCATCTCAGTGAAGTACACTTGGGAGTAATGAAGACAACAATAAAGACAGCTAATTCTTGACACCATAGTCAAGTCAAGTCATCTTCATTTATATAGCACTTTTTACAATACAGATTGTTTCAAAGCAGCTTCACAGTGATAATAGGTATTTAATTAATGGGCAGAGATTGTTTTGGCTTTACAGCAGCTCTAGGAAAAAATTATTATCGAGCAAAAGTACGTTTTTGATTGATTCACTTCAGTTGTAAAAATCATTAATTATTAACTAAGGGGTCGCTTAAATGACACCTTTTTAACTGAAAACAGAAGACTTTTAATGAGTTCTTGCCATTCATTTACGTGATTAGTCTATAGGTATGTGAGTTTGAATGTGTATGTGCGCAGACGCTTGGTCTTTCTTTACAAAGTGACATCGCCAAATTACTTGTCTGGTCAGCATAATACAGAATTATTAGTCGTTTCCGCGGATCCTTGCAAACTGGAATCATTTTGATAACGTTATTCTATACAAAGGGAAAGGGAAGGAGGCCTTCGCAGGGGATAGTTTAGTTGACGCTTCAGGGCTGCATTGTCGTCGTGTCTAGGCGCAGGTCCTTCATCTCATCTGGATACGGCCTGGATCTGGCAGACTACGGTAAACCTCGGGATAAACAGAGAGAGACTAATATTAGCGTAGACACCATTCTTTATATGATGCAGCGAGTACATCAGGTGTTATGGGAAGTGTTCCCAGTTCCGGCTGACCTAATTTATGCAGCCTAACAATTTACAATTTGAATTATAGAAGTAGATAATGTGTTATGTGTATGCCAGGTTAAAGAGATGTGTTTTTATTCTAGATTTAAACTGACAGAGTGTGTCTGCTTCCCGAACAATGCTAGGAAGACTGTTCCAAAGTTTAGGTGCTAAAAAGGAAAATGATCTACCATCAATTTTGATATACTAGGTATTATCAACTGGCCAGAATTTTGAGATCGCTATAGACGTGAAGGACTGTAATGTGTTAAGAGCTCGCTCAAGTACTTGGGAGCTAAACTATTTAGTGCAAGATTTTAACATTTATACAATGTTTAATAGGGAGCCAATGCAGTGTTGACAGAACTGGGTTAATATGGTCATACTTCCTGGTTCTAGTAAGAACTCTAGCTGCTGCATTTTGGACCAGCTGGAGTTTGTTTATTAGGCATGCAAGGCAACCACCCAGTAGAGCAATACAATAATCTAGCCTTGAGGTCATGAATGCATGAACTAACTGTTCCGCATTTGTCATTGAGAGCATATGTCATCATTTTCAAATGAAAGATTGGTATCAAAGAGAACACCCAGGTTCCTAACTGATGACGGAGACTTGACAGAACATCCATCAAGTGTTAGATAGTATTCTAGGTTATTACGTGCAGAGGTTTTTGGTACAATCATTAGAATCTCTGTTTTTTGTTTTTTTTTTCTTCAGAATTAAGTAGTAGGAAATTGCTAGTCATCCAATTTTTTATATCAGCTATGCATTCCATTAATTGGACTACGCACTTGGACTACGTCAGAAACAGAACATGGAATCCATTCACTGTCGGGAATGTGTTGTCTCGCGTCTCACCGTGCCGCATCCAGTATTGTCAACTGATTAAAATGGGTTCTATTATAATTTGACGCGTCGCATCGCGCCGCTCGCGTCCGGTGTAGACACGGTGTTATATTTTTTTAAAACAGCGACAACTTCGTCGCAGATATGTGTGTTTTAGCAAGGCGGTCTATGTTGCAAGTTGGTGAATGAAGATACTTGCCAGGTTACATGAGAGGTTAACTCTGCTTTATTAATTTATCCAGTGTAAAACCCGGACACTGCCACAAAAATGTGGCTTTTTGTTAATGACTGTCCTACTACAGGATTTAACACGGAGTAACAGCTCACTACCAGTTACAAAAGACACTGTAACTGTCTCAATTAATTTAAATTATCCTTTGACTATGTTCTGGCCCGCCATCTAGTGGCGAAAATTTTGCCAAACTTAATTGCCAACCCCTGGTCTAAATCCGGACTGGAAATCCTCACAGATACCATTTCTTTCTAAAAAGGAGCATAGTTGTGAGGATACTGCCTTTTCTAATATCTTTGACAGAAAAGGTAGATTCGAGATTGGCCTGTAATAGACTATTTCTGTAGGATCAAGTTGTGTTTTTTTTTAACAAGAGGTTTAATAATAGCTAGCTTAAAAGTTTTTGGTACGTATCCTAATGACAAAAATGAATCAATGACATTAAGAAGAGGATCTATGACTTCTGGAAGCATCTCTTTCAGTAGCTTAGTCGGTATAGGGTCTAACATACTACATGTTGTTGATTTAGATGATTTAATGAGTTTAGACAGTTCTTTCTCTCCTGTAGCAATGAATGGAGTTTTTCCTCAGGGACACTACAATGCACTGTCTGATGTGATACTGTAGTAGACGGTTCCATAGTTATAATTTTCTCTCTAATATTATCAATCTTGTAAGTAAAGAAGTTCATGGAGTCATTGCTGCTGTGCTGTTTGGAAATGTAAGGGGTCGAAGCTTTATTTCTCATTAATTTAGCCACTGTATCAAATAAATACCTAGGGTTGTGTTTGTTTTCTTCTAAAAGGGTTGAAAAATAATCAGATCTAGCAGTTTTTAAGGCCTATTTTATACGCAATCATGCTCTCTCTCCACAAAATGCGGAAAACCTCTAGTTTTGTTTTATTCCAGCTGCGCTCCATTTTTCTGGCTGCTCTTTTAAAGGGTTAGTTCACCCAAAAATGAAAATTCT

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU245946 True 4772 lncRNA 0.35 2 7178673 7183925

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000050_07124003_07124284 NA coding upstream 54331 7123887 ~ 7124393 (+)
CI01000050_07107277_07123150 SULT1ST1, SULT1ST2, SULT1ST3 coding upstream 55489 7106594 ~ 7123184 (+)
CI01000050_07078547_07104277 TAS1R2.1 coding upstream 74073 7077133 ~ 7104600 (+)
CI01000050_07008484_07018990 NA coding upstream 159010 7008484 ~ 7019663 (+)
CI01000050_06966299_06980426 NA coding upstream 198050 6964336 ~ 6980623 (+)
CI01000050_07221976_07238268 QARS coding downstream 37850 7221775 ~ 7238459 (+)
CI01000050_07250416_07306801 MTOR coding downstream 66491 7250416 ~ 7306801 (+)
CI01000050_07312365_07324523 NA coding downstream 126656 7310581 ~ 7324673 (+)
G216852 NA non-coding upstream 3501 7174973 ~ 7175172 (+)
G216850 NA non-coding upstream 4998 7173048 ~ 7173675 (+)
G216843 NA non-coding upstream 21779 7155544 ~ 7156894 (+)
G216845 NA non-coding upstream 30372 7148094 ~ 7148301 (+)
G216823 NA non-coding downstream 24518 7208443 ~ 7215304 (+)
G216825 NA non-coding downstream 165281 7349206 ~ 7367142 (+)
G215773 NA other upstream 512970 6661188 ~ 6665703 (+)
G215539 NA other upstream 1547470 5629610 ~ 5631203 (+)
CI01000050_05407682_05409108 FKBP1B, FKBP1AA, FKBP1AB, FKBP1A, FKB1B, FKB1A other upstream 1769025 5407585 ~ 5409417 (+)
CI01000050_04591548_04592778 NA other upstream 2585624 4589926 ~ 4593049 (+)
G214717 NA other upstream 3070393 4107582 ~ 4108280 (+)

Expression


Co-expression Network