RNA id: TCONS_00000963


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00000963
length 548
RNA type mRNA
GC content 0.51
exon number 6
gene id XLOC_000554
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007112.7
NCBI id CM002885.2
chromosome length 59578282
location 44906517 ~ 44926013 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

CAACCTGCTCCACCCTACCACCCATATACTCATGAGGGTTATAATCCTGTGAATGTGCCTCAAAACCCTGTCTATCCACCTCAATCTGCACCCACTCATCCTCCCCAGTGGAATGACCCTGCCTCCCAGAACAACCCATTTCCAAATCAGGGCTTTAATCCTGGGAATGTGCCTCAAAACCCGCTCTATCCACCTCAGTCTGGACCCACATATACTGAACCTGCCTCCCAATACAACCCGTCTCCTGCTATGAACTATTCTTCTCCTGGGCCTGAAACCACAGGGATGACTACGAATGATCCACCTCAAACTGCGCCCCTGCTTGCACCCCAGCCTGAGGGTTACAGGTCTGCTCTGGACAGCCTTTCAATGAATATGCTCAGCACTAGCGACTCTGGGGTCCAGTTTGACATCAACAAAGGAAAGTCTACAAGCAACAACTTCCTGtagtttctccaaaatgctggaTTATCCTCATGCTGTACCGATTCCCAGCAGGACACAGACGCACGCCAGGCCTGCTAATCTCAGTGCTGTGGTTTCTGCTG

Function

GO: NA

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-030131-2925 No description available

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000140402

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00000962 lncRNA upstream 4816 44913836 ~ 44914405 (+) False XLOC_000554
TCONS_00000954 lncRNA upstream 83483 44826320 ~ 44835738 (+) False XLOC_000552
TCONS_00000947 lncRNA upstream 162210 44753977 ~ 44757011 (+) True XLOC_000547
TCONS_00003121 lncRNA upstream 265253 44647908 ~ 44653968 (+) True XLOC_000545
TCONS_00003120 lncRNA upstream 348352 44567513 ~ 44570869 (+) True XLOC_000542
TCONS_00000965 lncRNA downstream 15619 44941632 ~ 44942285 (+) True XLOC_000555
TCONS_00000968 lncRNA downstream 42449 44968462 ~ 44971240 (+) False XLOC_000557
TCONS_00000969 lncRNA downstream 44556 44970569 ~ 44972926 (+) True XLOC_000557
TCONS_00000974 lncRNA downstream 78893 45004906 ~ 45008973 (+) False XLOC_000559
TCONS_00003122 lncRNA downstream 457591 45383604 ~ 45398821 (+) True XLOC_000567
TCONS_00000957 mRNA upstream 49249 44838706 ~ 44869972 (+) False XLOC_000553
TCONS_00000958 mRNA upstream 49249 44838714 ~ 44869972 (+) False XLOC_000553
TCONS_00000959 mRNA upstream 49249 44852497 ~ 44869972 (+) True XLOC_000553
TCONS_00000955 mRNA upstream 83483 44826367 ~ 44835738 (+) False XLOC_000552
TCONS_00000964 mRNA downstream 15018 44941031 ~ 44946224 (+) False XLOC_000555
TCONS_00000966 mRNA downstream 23896 44949909 ~ 44962538 (+) False XLOC_000556
TCONS_00000967 mRNA downstream 24157 44950170 ~ 44963259 (+) True XLOC_000556
TCONS_00000972 mRNA downstream 66194 44992207 ~ 44994299 (+) True XLOC_000558
TCONS_00000973 mRNA downstream 76958 45002971 ~ 45014434 (+) False XLOC_000559
TCONS_00000949 other upstream 149166 44769034 ~ 44770055 (+) True XLOC_000548
TCONS_00000941 other upstream 328840 44590267 ~ 44590381 (+) True XLOC_000544
TCONS_00000938 other upstream 353875 44559451 ~ 44565346 (+) True XLOC_000541
TCONS_00000933 other upstream 411968 44507134 ~ 44507253 (+) True XLOC_000540
TCONS_00000911 other upstream 691767 44222222 ~ 44227454 (+) False XLOC_000523
TCONS_00000970 other downstream 57812 44983825 ~ 44989546 (+) False XLOC_000558
TCONS_00000971 other downstream 60983 44986996 ~ 44997770 (+) False XLOC_000558
TCONS_00000975 other downstream 81390 45007403 ~ 45009616 (+) True XLOC_000559
TCONS_00000982 other downstream 244033 45170046 ~ 45170652 (+) True XLOC_000563
TCONS_00000997 other downstream 842403 45768416 ~ 45768530 (+) True XLOC_000573

Expression Profile

//