RNA id: TCONS_00001111



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00001111
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.55
exon number 1
gene id XLOC_000651
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007112.7
NCBI id CM002885.2
chromosome length 59578282
location 51465468 ~ 51465582 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GcttgcagctagctctctgcagctctcacatAGTCGCCCACTGAGGCTAAGCAGGGCTGTACcctgtcagtacctggataggagaccacatgggaaagctaggttgctgccaaaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000184063

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00001098 lncRNA upstream 392340 51066816 ~ 51073128 (+) True XLOC_000645
TCONS_00001095 lncRNA upstream 423136 51039558 ~ 51042332 (+) True XLOC_000644
TCONS_00003160 lncRNA upstream 446917 51015858 ~ 51018551 (+) True XLOC_000643
TCONS_00001091 lncRNA upstream 481529 50977554 ~ 50983939 (+) False XLOC_000641
TCONS_00003159 lncRNA upstream 511910 50943592 ~ 50953558 (+) True XLOC_000640
TCONS_00001114 lncRNA downstream 13564 51479146 ~ 51481022 (+) False XLOC_000652
TCONS_00002874 lncRNA downstream 229169 51694751 ~ 51717215 (+) True XLOC_000656
TCONS_00003161 lncRNA downstream 287396 51752978 ~ 51826020 (+) False XLOC_000658
TCONS_00001121 lncRNA downstream 287543 51753125 ~ 51826020 (+) False XLOC_000658
TCONS_00001122 lncRNA downstream 358142 51823724 ~ 51826020 (+) False XLOC_000658
TCONS_00001110 mRNA upstream 37362 51407520 ~ 51428106 (+) True XLOC_000650
TCONS_00001108 mRNA upstream 58937 51386649 ~ 51406531 (+) False XLOC_000649
TCONS_00001109 mRNA upstream 61819 51391082 ~ 51403649 (+) True XLOC_000649
TCONS_00001107 mRNA upstream 87618 51329069 ~ 51377850 (+) True XLOC_000648
TCONS_00001103 mRNA upstream 90016 51312752 ~ 51375452 (+) False XLOC_000648
TCONS_00001112 mRNA downstream 9512 51475094 ~ 51482755 (+) False XLOC_000652
TCONS_00001113 mRNA downstream 13546 51479128 ~ 51525084 (+) False XLOC_000652
TCONS_00001115 mRNA downstream 31280 51496862 ~ 51525086 (+) True XLOC_000652
TCONS_00001116 mRNA downstream 71668 51537250 ~ 51545917 (+) True XLOC_000653
TCONS_00001117 mRNA downstream 149924 51615506 ~ 51616105 (+) False XLOC_000654
TCONS_00001097 other upstream 392361 51066782 ~ 51073107 (+) False XLOC_000645
TCONS_00001084 other upstream 610990 50854364 ~ 50854478 (+) True XLOC_000638
TCONS_00001079 other upstream 1333459 50131158 ~ 50132009 (+) True XLOC_000630
TCONS_00001068 other upstream 1749646 49699903 ~ 49715822 (+) False XLOC_000626
TCONS_00001057 other upstream 1874645 49590701 ~ 49590823 (+) True XLOC_000623
TCONS_00001119 other downstream 217937 51683519 ~ 51683618 (+) True XLOC_000655
TCONS_00001126 other downstream 664582 52130164 ~ 52135502 (+) False XLOC_000662
TCONS_00001154 other downstream 1534250 52999832 ~ 53061197 (+) False XLOC_000682
TCONS_00001160 other downstream 1898928 53364510 ~ 53368034 (+) True XLOC_000689
TCONS_00001166 other downstream 1922183 53387765 ~ 53387881 (+) True XLOC_000690

Expression Profile


//