RNA id: TCONS_00023840



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00023840
length 129
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_012088
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007128.7
NCBI id CM002901.2
chromosome length 53461100
location 22925209 ~ 22925337 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


CTTGGCAGAAATGTTATATGTAAAAtaggcagctagctctctgcaactctcacatggtcgcccactgaagctaagcccggtcagtacctggatgggagaccacatgggaaagctaggttgctgccagaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000119523

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00024895 lncRNA downstream 235422 22687170 ~ 22689787 (-) False XLOC_012086
TCONS_00023837 lncRNA downstream 235422 22687170 ~ 22689787 (-) True XLOC_012086
TCONS_00023838 lncRNA downstream 235577 22687170 ~ 22689632 (-) False XLOC_012086
TCONS_00023834 lncRNA downstream 353226 22570700 ~ 22571983 (-) False XLOC_012085
TCONS_00023830 lncRNA downstream 399464 22524246 ~ 22525745 (-) True XLOC_012083
TCONS_00024896 lncRNA upstream 557722 23483059 ~ 23485336 (-) True XLOC_012093
TCONS_00023851 lncRNA upstream 702239 23627576 ~ 23631411 (-) True XLOC_012098
TCONS_00024897 lncRNA upstream 725197 23650534 ~ 23652336 (-) False XLOC_012099
TCONS_00024898 lncRNA upstream 1060536 23985873 ~ 23987510 (-) True XLOC_012103
TCONS_00024540 lncRNA upstream 1097970 24023307 ~ 24026857 (-) True XLOC_012104
TCONS_00023832 mRNA downstream 351807 22563836 ~ 22573402 (-) False XLOC_012085
TCONS_00023833 mRNA downstream 351838 22565703 ~ 22573371 (-) False XLOC_012085
TCONS_00023835 mRNA downstream 351897 22571891 ~ 22573312 (-) False XLOC_012085
TCONS_00023836 mRNA downstream 351898 22572300 ~ 22573311 (-) True XLOC_012085
TCONS_00023831 mRNA downstream 372531 22544648 ~ 22552678 (-) True XLOC_012084
TCONS_00023841 mRNA upstream 287390 23212727 ~ 23221504 (-) True XLOC_012089
TCONS_00023842 mRNA upstream 311902 23237239 ~ 23241393 (-) True XLOC_012090
TCONS_00023843 mRNA upstream 485865 23411202 ~ 23416897 (-) False XLOC_012091
TCONS_00023844 mRNA upstream 485935 23411272 ~ 23412705 (-) True XLOC_012091
TCONS_00023845 mRNA upstream 508874 23434211 ~ 23446760 (-) True XLOC_012092
TCONS_00023839 other downstream 138918 22786174 ~ 22786291 (-) True XLOC_012087
TCONS_00023820 other downstream 914541 22002857 ~ 22010668 (-) False XLOC_012077
TCONS_00023811 other downstream 1066045 21833724 ~ 21859164 (-) False XLOC_012072
TCONS_00023801 other downstream 1645024 21279873 ~ 21280185 (-) True XLOC_012064
TCONS_00023793 other downstream 1794832 21130261 ~ 21130377 (-) True XLOC_012061
TCONS_00023856 other upstream 737874 23663211 ~ 23666478 (-) True XLOC_012099
TCONS_00023885 other upstream 1938374 24863711 ~ 24866653 (-) True XLOC_012119
TCONS_00023894 other upstream 1992013 24917350 ~ 24937879 (-) False XLOC_012122
TCONS_00023896 other upstream 2003806 24929143 ~ 24937535 (-) False XLOC_012122
TCONS_00023897 other upstream 2007354 24932691 ~ 24937684 (-) False XLOC_012122

Expression Profile


//