RNA id: TCONS_00032725



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00032725
length 291
RNA type mRNA
GC content 0.58
exon number 2
gene id XLOC_016669
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 37894849 ~ 37896965 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


atggcgctgttgAAGCTGTTCCTCGGGGCTCTTCTGCTCCTTCAGCTTGTTCTGCAGCTCCTAGCCGGAGCTGCTGACCCTCAAACCTTGAACTGTCCTGCTTATGCTGGAGTTCCAGGCACTCCTGGACACAATGGTCTGCCTGGCAGAGACGGCAGAGACGGAAGAGATGGAGTCACTGGACCCAAAGGAGAGAAGGGAGAGCCAGGAGTGAGTGTGCAGGGACCTCCTGGTAAAGCTGGACCACCTGGACCTGATGGAGCCCAGGGTGAAAGCGGTCCACCAGGTATT

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000075931

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00033384 lncRNA downstream 80890 37813663 ~ 37815373 (-) True XLOC_016662
TCONS_00033385 lncRNA downstream 80959 37813663 ~ 37815304 (-) False XLOC_016662
TCONS_00032709 lncRNA downstream 111103 37782254 ~ 37785160 (-) False XLOC_016661
TCONS_00032707 lncRNA downstream 207951 37687463 ~ 37688312 (-) True XLOC_016660
TCONS_00032702 lncRNA downstream 318282 37569667 ~ 37577981 (-) True XLOC_016658
TCONS_00032737 lncRNA upstream 241704 38138350 ~ 38141977 (-) True XLOC_016679
TCONS_00033891 lncRNA upstream 247516 38144162 ~ 38145701 (-) True XLOC_016680
TCONS_00033892 lncRNA upstream 296313 38192959 ~ 38194479 (-) True XLOC_016681
TCONS_00032745 lncRNA upstream 319699 38216345 ~ 38225373 (-) True XLOC_016682
TCONS_00032760 lncRNA upstream 1101402 38998048 ~ 38998761 (-) False XLOC_016690
TCONS_00032723 mRNA downstream 2353 37892606 ~ 37893910 (-) True XLOC_016668
TCONS_00032720 mRNA downstream 7111 37887277 ~ 37889152 (-) False XLOC_016667
TCONS_00032721 mRNA downstream 7152 37887342 ~ 37889111 (-) False XLOC_016667
TCONS_00032722 mRNA downstream 7834 37887432 ~ 37888429 (-) True XLOC_016667
TCONS_00032719 mRNA downstream 13007 37879812 ~ 37883256 (-) True XLOC_016666
TCONS_00032726 mRNA upstream 56925 37953571 ~ 37956768 (-) True XLOC_016670
TCONS_00032727 mRNA upstream 62394 37959040 ~ 37960688 (-) True XLOC_016671
TCONS_00032728 mRNA upstream 66620 37963266 ~ 37967368 (-) True XLOC_016672
TCONS_00032729 mRNA upstream 98530 37995176 ~ 38000276 (-) True XLOC_016673
TCONS_00032730 mRNA upstream 137679 38034325 ~ 38035235 (-) True XLOC_016674
TCONS_00032691 other downstream 487106 37405351 ~ 37409157 (-) True XLOC_016651
TCONS_00032658 other downstream 1222344 36670656 ~ 36673919 (-) False XLOC_016631
TCONS_00032657 other downstream 1225105 36664770 ~ 36671158 (-) False XLOC_016631
TCONS_00032643 other downstream 1563932 36332018 ~ 36332331 (-) True XLOC_016617
TCONS_00032642 other downstream 1568152 36327607 ~ 36328111 (-) True XLOC_016616
TCONS_00032743 other upstream 307295 38203941 ~ 38204793 (-) False XLOC_016682
TCONS_00032764 other upstream 1166108 39062754 ~ 39068546 (-) False XLOC_016693
TCONS_00032769 other upstream 1474165 39370811 ~ 39370927 (-) True XLOC_016694
TCONS_00032776 other upstream 1838906 39735552 ~ 39752556 (-) True XLOC_016698
TCONS_00032777 other upstream 2030315 39926961 ~ 40026622 (-) False XLOC_016700

Expression Profile


//