RNA id: TCONS_00043441



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00043441
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.52
exon number 1
gene id XLOC_021939
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007134.7
NCBI id CM002907.2
chromosome length 46223584
location 40752704 ~ 40752818 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TGTCACaacatatcaccctgcagcccaagactggttactcacaaaggtaagcagggctgagcctggtcagtacctggactGGAggtcacatgggaaaactaggctgCTGTTGGAA

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000192435

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00044898 lncRNA upstream 225721 40524394 ~ 40526983 (+) True XLOC_021937
TCONS_00044694 lncRNA upstream 999740 39752488 ~ 39752964 (+) True XLOC_021926
TCONS_00043420 lncRNA upstream 1033870 39714649 ~ 39718834 (+) True XLOC_021925
TCONS_00043411 lncRNA upstream 1262353 39462206 ~ 39490351 (+) False XLOC_021921
TCONS_00043408 lncRNA upstream 1326908 39347185 ~ 39425796 (+) False XLOC_021920
TCONS_00044899 lncRNA downstream 61925 40814743 ~ 40815221 (+) True XLOC_021940
TCONS_00044900 lncRNA downstream 105382 40858200 ~ 40866526 (+) True XLOC_021941
TCONS_00044695 lncRNA downstream 252214 41005032 ~ 41019226 (+) True XLOC_021944
TCONS_00043444 lncRNA downstream 268693 41021511 ~ 41033851 (+) False XLOC_021945
TCONS_00043445 lncRNA downstream 268693 41021511 ~ 41117964 (+) False XLOC_021945
TCONS_00043439 mRNA upstream 7853 40604951 ~ 40744851 (+) False XLOC_021938
TCONS_00043440 mRNA upstream 20930 40655306 ~ 40731774 (+) True XLOC_021938
TCONS_00043434 mRNA upstream 286306 40452197 ~ 40466398 (+) False XLOC_021934
TCONS_00043436 mRNA upstream 286306 40461411 ~ 40466398 (+) True XLOC_021934
TCONS_00043435 mRNA upstream 291651 40460333 ~ 40461053 (+) False XLOC_021934
TCONS_00043442 mRNA downstream 155765 40908583 ~ 40938467 (+) True XLOC_021942
TCONS_00043443 mRNA downstream 198625 40951443 ~ 40996780 (+) True XLOC_021943
TCONS_00043449 mRNA downstream 448036 41200854 ~ 41229194 (+) True XLOC_021948
TCONS_00043450 mRNA downstream 926768 41679586 ~ 41692463 (+) True XLOC_021951
TCONS_00043451 mRNA downstream 1046930 41799748 ~ 41801523 (+) False XLOC_021953
TCONS_00043438 other upstream 272122 40477220 ~ 40480582 (+) True XLOC_021936
TCONS_00043437 other upstream 280616 40466502 ~ 40472088 (+) True XLOC_021935
TCONS_00043431 other upstream 446333 40306244 ~ 40306371 (+) True XLOC_021932
TCONS_00043391 other upstream 2416820 38335760 ~ 38335884 (+) True XLOC_021913
TCONS_00043382 other upstream 2658144 38092005 ~ 38094560 (+) False XLOC_021909
TCONS_00043458 other downstream 1438421 42191239 ~ 42191353 (+) True XLOC_021959
TCONS_00043464 other downstream 1563247 42316065 ~ 42330488 (+) True XLOC_021964
TCONS_00043476 other downstream 1749747 42502565 ~ 42502690 (+) True XLOC_021972
TCONS_00043477 other downstream 1772174 42524992 ~ 42545825 (+) False XLOC_021973
TCONS_00043478 other downstream 1852126 42604944 ~ 42605059 (+) True XLOC_021975